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ユニークな食虫目実験動物スンクスにおける近交系の樹立と遺伝マーカーの整備

独特食虫实验动物Suncus自交系的建立及遗传标记的维护

基本信息

批准号：
17650119
负责人：
石川明
金额：
$ 2.11万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2007
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17650119/
关键词：
スンクス実験動物近交系遺伝マーカー

项目摘要

本年度は、近交系スンクスを樹立するための兄妹交配、スンクスにおけるオリジナルのマイクロサテライトマーカーの開発、および今までに開発したCATS(Comparative Anchor Tagged Sequence)マーカーとマイクロサテライトマーカーから成る遺伝的連鎖地図の作製を行った。具体的には以下の通りである。(1)近交系スンクスの樹立:TKU系統において毎世代兄妹交配を繰り返し、近交系スンクスの樹立を進めた。また、基礎的なデータを得るために、妊娠期間、一腹産子数等を記録した。しかし、残念ながら、近交22世代目で途絶えてしまった。(2)マイクロサテライトマーカーの開発:昨年度までに、F20世代以上を経過して個体間の遺伝的変異性がほとんどないTKUスンクスの臓器から核DNAを抽出して、マイクロサテライトDNA濃縮ライブラリーを構築した。そして、マイクロサテライトDNA陽性クローンの塩基配列をDNAシークエンサーにより決定し、得られた塩基配列に基づいて、PCRプライマーを設計・合成し、F2マッピングパネル作成に用いた両親系統とそのF1において、開発したマイクロサテライトマーカーがPCRにより増幅するか否かを調査した。本年度は、F2マッピングパネル全77個体の多型解析を行い、マーカー開発に成功した。(3)遺伝的連鎖地図の作製:上記のマイクロサテライトマーカーの他に、今までに開発してCATSとマイクロサテライトマーカーを含めて連鎖解析を行い、12群から成る連鎖地図の作製に成功した。

This year, the inbred system スンクスをestablishes するための brother-sister mating, スンクスにおけるオリジナルのマイクロサでに开発したCATS (Comparative Anchor Tagged Sequence) マーカーとマイクロサテライトマーカーから成る伝's chain図のmakingを行った. The specific details are as follows. (1) The establishment of inbred system: TKU system is the mating of brother and sister for each generation, and the inbred system is established and established.また, basic なデータを得るために, pregnancy period, number of babies per pregnancy, etc. are recorded.しかし, cannian ながら, and inbred 22nd generation eye で道久えてしまった. (2) マイクロサテライトマーカーの开発: Last year’s までに, F20 generation and above を経passed してThe opposite sex between individualsんどないTKU スンクスの瓓器からNUCLEAR DNA を EXTRACT して, マイクロサテライトDNA CONCENTRATION ライブラリーを CONSTRUCTION した.そして, マイクロサテライトDNA positive クローンの婩组array をDNA シークエンサーによりdeterminationし, 得られた婩婩lementary baseづいて, PCRプライマーを design・Synthetic し、F2 マッピングパネル成に用いた両 pro system とそのF1 において、Open発したマイクロサテライトマーカーがPCRによりincrease widthするか不かをinvestigationした. This year, the polytype analysis of all 77 individuals of the F2 program was successfully completed and the program was successfully opened. (3) Production of the chain of the deceased's chain: 上记のマイクロサテライトマーカーのTAに, 日本までに开発してCATSとマイクロサテライトマーカーを合めてchainANALYSISを行い、12集团から成るchain地図の成に成した.

项目成果

期刊论文数量（4）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Development and characterization of CATS markers for genetic linkage mapping in the house musk shrew, Suncus murinus

用于家麝鼩 (Suncus murinus) 遗传连锁图谱的 CATS 标记的开发和表征

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
Experimental Animals 54・2
影响因子：
0
作者：
Adjei;S.
通讯作者：
S.

A genetic linkage map of the house musk shrew, Suncus murinus, constructed with PCR-based and RFLP markers

使用基于 PCR 和 RFLP 标记构建的家麝香鼩 (Suncus murinus) 遗传连锁图

DOI：
发表时间：
2008
期刊：
Experimental Animals 57(印刷中)
影响因子：
0
作者：
Adjei;S.
通讯作者：
S.

A novel set of microsatellite marker loci linkage-mapped in the house musk shrew, Suncus murinus

在家麝鼩（Suncus murinus）中绘制的一组新颖的微卫星标记位点连锁图谱

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
Experimental Animals 56・1
影响因子：
0
作者：
Adjei;S.
通讯作者：
S.

Development of a framework genetic linkage map in the musk shrew, Suncus murinus

麝鼩 (Suncus murinus) 框架遗传连锁图的开发

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
0
作者：
Adjei;A.
通讯作者：
A.

DOI：
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