0.2ミクロンより小さい細菌(ナノバクテリア)の多様性と系統分類に関する研究

小于0.2微米细菌（纳米细菌）的多样性和系统发育分类研究

• 批准号: 17657032
• 负责人: 長沼 毅
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17657032/
• 关键词: 極微小生物; バクテリア; アーキア; 表層海水; 極限環境; 16SrRNA遺伝子; 分子系統; 多様性; 深海; 熱水噴出孔; 16S rRNA遺伝子

通常の表層海水試料に加えて、深部地下水ならびにトカラ列島や口永良部島などの火山域、サハラ・ゴビ砂漠、北極・南極等の極限環境試料から孔径0.2ミクロン(μm)通過菌(すなわちナノバクテリア)の単離・培養を試みた。上記試料液あるいは懸濁液を三連にした孔径0.2ミクロンSterivexフィルターで濾過し、その濾液を貧栄養の1/100LB液体培地に接種した後、濁りの生じた培地をさらに1/100LB寒天培地に塗布し、形成した単コロニーからの釣菌および画線を繰り返して、0.2ミクロン通過菌、(極微小菌)の単離を行い、6株を取得することができた。このうち好気・室温条件で増殖が比較的速い深部地下水由来の3株の分子系統を16S rRNA遺伝子で調べたところ、それぞれ既知の属(Acidovorax、Micrococcusおよび phaeospirillum)に帰属することが分かった。この深部地下水由来の3株について、一酸化炭素と二酸化炭素の変換および亜硫酸と硫酸の変換という地球化学的な機能を有する酵素の遺伝子を得ることができた。また、一本鎖DNAの分解、突然変異源である酸化ヌクレオチドの分解酵素、トレハロース生合成の最終段階、グルタミン酸の生成(synthetaseではなく、糖代謝とアミノ酸代謝を結ぶsynthase)など、種々の代謝に関わる酵素の遺伝子も得ることができ、極微小生物の生理に関する基礎知見を拡充することができた。

除了正常的表面海水样品外，我们还试图隔离和培养细菌（即纳米细菌），经过深处的毛孔大小（即纳米细菌），并从深层地下水和极端环境样品（例如Tokara群岛和诸如Tokara群岛）和野外野外，gobi sott和artctic and artcticic的极端环境样本。 The sample liquid or suspension was filtered through a 0.2 micron pore size Sterivex filter made into triplicate series, and the filtrate was inoculated into a 1/100 LB liquid medium of poor nutrition, and the turbidity medium was further applied to a 1/100 LB agar medium, and the catch and streaks from the single colony formed were repeated to isolate 0.2 micron passing bacteria (ultra microbacteria) and obtain six strains.其中，使用16S rRNA基因检查了从深层地下水中得出的三个分子菌株，它们在有氧和室温条件下生长相对较快，发现它们属于已知属（酸伏氏菌，微球菌和Phaeospirillum）。对于源自深地下水的这三种菌株，获得了具有地球化功能的酶的基因，例如一氧化碳和二氧化碳的转化以及硫酸盐和硫酸的转化。我们还获得了参与各种新陈代谢的酶的基因，例如单链DNA的降解，降解氧化核苷酸的酶，突变的来源，天虫生物合成的最终阶段，生物的最终阶段，允许与谷氨酸相比，与糖酸的合成素化合物相结合，促进糖酸的产生（关于超大型生物的生理学。

项目成果

Phylotype diversity of deep-sea hydrothermal vent prokaryotes trapped by 0.2- and 0.1-μm-pore-size filters

• DOI: 10.1007/s00792-007-0070-5
• 发表时间: 2007-07-01
• 期刊: EXTREMOPHILES
• 影响因子: 2.9
• 作者: Naganuma, Takeshi;Miyoshi, Tatsuo;Kimura, Hiroyuki
• 通讯作者: Kimura, Hiroyuki

Detailed identification of desert-originating bacteria carried by Asian dust storms to Japan

亚洲沙尘暴携带至日本的沙漠起源细菌的详细鉴定

• 发表时间: 2007
• 期刊: Aerobiologia 23
• 作者: Shinohara N;Sugiyama M;Fukuda H;T.Morikawaら;N.Uekiら;Takeshi Naganuma;T.Nakamuraら;Ngoc-Phuc Hua
• 通讯作者: Ngoc-Phuc Hua