0.2ミクロンより小さい細菌(ナノバクテリア)の多様性と系統分類に関する研究

小于0.2微米细菌（纳米细菌）的多样性和系统发育分类研究

• 批准号: 17657032
• 负责人: 長沼 毅
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17657032/
• 关键词: 極微小生物; バクテリア; アーキア; 表層海水; 極限環境; 16SrRNA遺伝子; 分子系統; 多様性; 深海; 熱水噴出孔; 16S rRNA遺伝子

通常の表層海水試料に加えて、深部地下水ならびにトカラ列島や口永良部島などの火山域、サハラ・ゴビ砂漠、北極・南極等の極限環境試料から孔径0.2ミクロン(μm)通過菌(すなわちナノバクテリア)の単離・培養を試みた。上記試料液あるいは懸濁液を三連にした孔径0.2ミクロンSterivexフィルターで濾過し、その濾液を貧栄養の1/100LB液体培地に接種した後、濁りの生じた培地をさらに1/100LB寒天培地に塗布し、形成した単コロニーからの釣菌および画線を繰り返して、0.2ミクロン通過菌、(極微小菌)の単離を行い、6株を取得することができた。このうち好気・室温条件で増殖が比較的速い深部地下水由来の3株の分子系統を16S rRNA遺伝子で調べたところ、それぞれ既知の属(Acidovorax、Micrococcusおよび phaeospirillum)に帰属することが分かった。この深部地下水由来の3株について、一酸化炭素と二酸化炭素の変換および亜硫酸と硫酸の変換という地球化学的な機能を有する酵素の遺伝子を得ることができた。また、一本鎖DNAの分解、突然変異源である酸化ヌクレオチドの分解酵素、トレハロース生合成の最終段階、グルタミン酸の生成(synthetaseではなく、糖代謝とアミノ酸代謝を結ぶsynthase)など、種々の代謝に関わる酵素の遺伝子も得ることができ、極微小生物の生理に関する基礎知見を拡充することができた。

Usually の surface waters sample に plus え て, deep groundwater な ら び に ト カ ラ islands や mouth forever good department island な ど の volcanic domain, サ ハ ラ · ゴ ビ desert, such as the arctic, Antarctic の extreme environment sample か ら aperture 0.2 ミ ク ロ ン (microns) by bacteria (す な わ ち ナ ノ バ ク テ リ ア) の 単 from, cultivate を try み た. Written test material liquid あ る い は suspension を three even に し た aperture 0.2 ミ ク ロ ン Sterivex フ ィ ル タ ー で filtration し, そ の filtrate を poor 1/100 tech students.their ownship keep の lb liquid petty に vaccination し た, turbidity り の raw じ た petty を さ ら に 1/100 lb sees the petty に coated し, forming し た 単 コ ロ ニ ー か ら の catch bacterium お よ び を painting line The return of the kosho omori to て, 0.2 て ロ ロ ロ ロ was obtained by using bacteria, (very tiny bacteria) <s:1> 単 to を row て, and 6 を strains を to obtain する する とがで とがで た た た た た. Good こ の う ち 気, room temperature で raised が comparison of origin の 3 strains of speed い deep groundwater の molecular system を traces of 16 s rRNA 伝 son で adjustable べ た と こ ろ, そ れ ぞ れ both knowledge の (Acidovorax, Micrococcus お よ び phaeospirillum) に 帰 genus す る こ と が points か っ た. Origin の 3 strains of こ の deep groundwater に つ い て, a acidification acidification carbon と two carbon の variations in お よ び 亜 と sulfuric acid sulfate の variations in と い う geochemical な function を have す る enzyme の heritage 伝 sons を may る こ と が で き た. ま た, a lock DNA の decomposition, suddenly - heterologous で あ る acidification ヌ ク レ オ チ ド の decomposition enzyme, ト レ ハ ロ ー ス biosynthesis の Duan Jie, eventually グ ル タ ミ ン acid の generated (synthetase で は な く, sugar metabolism と ア ミ ノ acid metabolism を "ぶ synthase) な ど, kind of 々 の metabolic に masato わ る enzyme の heritage 伝 sons も may る こ と Youdaoplaceholder0 がで, the <s:1> physiology of extremely tiny organisms に is related to する basic knowledge を拡 fill する とがで とがで た た.

项目成果

Phylotype diversity of deep-sea hydrothermal vent prokaryotes trapped by 0.2- and 0.1-μm-pore-size filters

• DOI: 10.1007/s00792-007-0070-5
• 发表时间: 2007-07-01
• 期刊: EXTREMOPHILES
• 影响因子: 2.9
• 作者: Naganuma, Takeshi;Miyoshi, Tatsuo;Kimura, Hiroyuki
• 通讯作者: Kimura, Hiroyuki

Detailed identification of desert-originating bacteria carried by Asian dust storms to Japan

亚洲沙尘暴携带至日本的沙漠起源细菌的详细鉴定

• 发表时间: 2007
• 期刊: Aerobiologia 23
• 作者: Shinohara N;Sugiyama M;Fukuda H;T.Morikawaら;N.Uekiら;Takeshi Naganuma;T.Nakamuraら;Ngoc-Phuc Hua
• 通讯作者: Ngoc-Phuc Hua