比較ゲノム法による主要養殖魚のゲノム構造の推定

使用比较基因组方法估计主要养殖鱼类的基因组结构

• 批准号: 17658084
• 负责人: 鈴木 譲
• 金额: $ 2.3万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17658084/
• 关键词: トラフグ; 比較ゲノム; 連鎖地図; 育種; 養殖; ゲノム配列

近年,多くの生物でゲノム配列解読計画や高密度遺伝子連鎖地図の作製が進行し,全ゲノムレベルで遺伝子の配置(ゲノム構造)を生物間で比較することが可能となってきた.脊椎動物では,ヒトのゲノム配列解読に続き,トラフグのゲノム概要が,続いて,マウス,ラット,ニワトリのゲノム概要が解読されている.また,ゼブラフィッシュやメダカでは既知遺伝子の高密度連鎖地図が作製されている.これらのデータを生物間で比較することにより,脊椎動物の太古の祖先からヒト,齧歯類,硬骨魚類に至るゲノム構造の再編成の過程が再現されることとなった.一方近年,ゲノム配列情報やゲノム構造の情報は連鎖地図と組み合わせることで,水産育種に大きな飛躍がもたらされると期待されている.ところが,我が国の養殖産業は,養殖対象魚種が多岐に渡っていることに大きな特徴があり,今後,そのすべての種においてゲノム配列の解読をおこなうことは現実的とは言えない.そこで,比較ゲノム法を応用して,トラフグゲノムの配列情報をもとにタイやブリなどのゲノム構造が推定できないかと考えた.この試みの成否は,硬骨魚類間でゲノム構造がどれほど保存されているかという点にかかっている。そこで,我々はトラフグのゲノムの10%の配列を連鎖地図上にマップし,これをメダカおよびゼブラフィッシュのゲノム構造と比較した.その結果,硬骨魚類のゲノム構造は驚くほど類似している可能性が示された.特に,トラフグとメダカ間でオルソロジーが明らかな18組の染色体間では,実に85%の遺伝子のシンテニーが保存されていた.我が国の重要養殖魚の多くはスズキ類魚類であり,これはトラフグとメダカにはさまれる系統的位置にあるので,トラフグとメダカの比較ゲノム解析により,多くの養殖対象魚のゲノム構造が推定可能である.

In recent years, multi-purpose biological systems have been deployed to solve the problem. High-density sub-links are used in the development of high-density biologics. in recent years, multi-biological systems have been deployed in high-density sub-links. Vertebrae, animals, animals and animals. You know, you know, you're going to have a high-density connection. In order to improve the quality of life, the animals of the spine, the ancient animals, the ancestors, the animals, the bones, the bones, the On the one hand, in recent years, information systems have been set up and information systems have been linked with each other, and water production systems have been developed to meet the needs of the market. As a matter of fact, our country is responsible for the production of agricultural products, which is similar to that of many kinds of enterprises. From now on, we will make sure that there is an agreement on the distribution of information in the market. In this way, you can tell me that you are not in a position to make a presumption that you are not in a position to do so. Please check whether it is successful or not, and you can save it between the hard bones. Please click on the computer to check whether or not to fail. I don't know, I don't know. According to the results of the test, the model of the system is similar to that of the probability of failure. In this way, you need to know that 18 sets of chromosomes are not available, and that 85% of the chromosomes are stored. In our country, it is important to determine the location of the system, the location of the system.