未知ゲノム配列non-codingRNAの機能解析
未知基因组序列非编码RNA的功能分析
基本信息
- 批准号:17659016
- 负责人:
- 金额:$ 2.11万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
- 财政年份:2005
- 资助国家:日本
- 起止时间:2005 至 2006
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
近年、細胞の発生・分化や癌の増殖などに強力な影響を及ぼすマイクロRNAの発見やその新規機能同定に関する報告が相次ぎ、マイクロRNAを始めとする短鎖RNAが細胞の運命を左右し得る重要な機能制御因子として大きな注目を浴びている。しかしながら、マイクロRNAの標的遺伝子を予測するこれまでの技術では、1つのマイクロRNAに対しターゲットとなる遺伝子が数千にも及び、その予測精度に大きな課題を有していた。また、ヒトのマイクロRNAの総数は千種類近くもあると言われ、これまでの方法論によって予測される標的遺伝子との組み合せを想定すると膨大なものとなる。そこで、本研究において、細胞ごとの遺伝子とmiRNAの発現プロファイルと既存miRNAターゲット予測プログラムとを組み合わせた新規方法論を確立し、miRNAによって制御される遺伝子のネットワーク化を行った。特に、従来法の配列相補性による標的遺伝子予測に加え、マイクロRNAとmRNAの発現パターンなどの新たな情報を導入することにより、マイクロRNAの標的遺伝子候補の劇的な絞込みとマイクロRNAによって制御される遺伝子発現ネットワークの抽出に成功した。具体的には、従来法では予測される標的遺伝子数が1つのマイクロRNA当たり数千個であるのに対し、本技術では標的遺伝子候補の予測の確からしさを最尤推定法によって数値化し、数十の遺伝子クラスター(ネットワーク)として絞り込み抽出することに成功している。
In recent years, cell growth, differentiation and cancer proliferation have been strongly influenced by the presence of short-chain RNA, which has been reported as an important functional control factor in cell fate. The technology of RNA target gene prediction has many problems, such as thousands of RNA target genes and the precision of prediction. The total number of RNA samples collected from the samples was estimated by the method of quantitative analysis. In this study, we established a new methodology for miRNA detection, miRNA control and miRNA production in cells. The target gene prediction of the sequence complementarity method was successfully extracted from the target gene candidate by adding new information to the target RNA and mRNA generation system. Specifically, the method for estimating the number of target genes is one, and the method for estimating the number of target genes is one.
项目成果
期刊论文数量(35)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A probabilistic model for mining implicit 'chemical compound-gene' relations from literature
- DOI:10.1093/bioinformatics/bti1141
- 发表时间:2005-01
- 期刊:
- 影响因子:5.8
- 作者:Shanfeng Zhu;Y. Okuno;G. Tsujimoto;Hiroshi Mamitsuka
- 通讯作者:Shanfeng Zhu;Y. Okuno;G. Tsujimoto;Hiroshi Mamitsuka
Correlation between vasoconstrictor roles and mRNA expression of alpha(1)-adrenoceptor subtypes in blood vessels of genetically engineered mice.
基因工程小鼠血管中血管收缩作用与 α(1)-肾上腺素受体亚型 mRNA 表达之间的相关性。
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:M.Isaji et al.;H.Wang et al.;N.Yamada et al.;H.Ueno et al.;H.Tanahashi et al.;Okuno Y;Adachi T;Ishida A;Hosoda C
- 通讯作者:Hosoda C
Two alpha1-adrenergic receptor subtypes regulating the vasopressor response have differential roles in blood pressure regulation.
调节血管加压反应的两种α1-肾上腺素受体亚型在血压调节中具有不同的作用。
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Okuno Y;Yang J;Taneishi K;Yabuuchi H;Tsujimoto G GLIDA;Ishida A;Hosoda C;Zhu S;Lazaro-Suarez ML;Kagaya S;Zacharia J;Sugimoto Y;Nagata N;Egashira N;Kagaya S;Chen Q;Erami C;Katsuma S;Adachi T;Katsuma S;Yamada M;Yamauchi J;Hosoda C
- 通讯作者:Hosoda C
NR4A orphan nuclear receptor family in peripheral blood eosinophils from patients with atopic dermatitis and apoptotic eosinophils in vitro
- DOI:10.1159/000085430
- 发表时间:2005-01-01
- 期刊:
- 影响因子:2.8
- 作者:Kagaya, S;Hashida, R;Saito, H
- 通讯作者:Saito, H
Prostaglandin E2 stimulates granulocyte colony-stimulating factor production via the prostanoid EP2 receptor in mouse peritoneal neutrophils.
前列腺素 E2 通过小鼠腹膜中性粒细胞中的前列腺素 EP2 受体刺激粒细胞集落刺激因子的产生。
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:M.Isaji et al.;H.Wang et al.;N.Yamada et al.;H.Ueno et al.;H.Tanahashi et al.;Okuno Y;Adachi T;Ishida A;Hosoda C;Zhu S;Lazaro-Suarez ML;Kagaya S;Zacharia J;Sugimoto Y
- 通讯作者:Sugimoto Y
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
辻本 豪三其他文献
スタンダード薬学シリーズ1 ヒューマニズム・薬学入門(日本薬学会編)
标准药学系列1 人文主义/药学概论(日本药学会编)
- DOI:
- 发表时间:
2005 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
M.Isaji et al.;H.Wang et al.;N.Yamada et al.;H.Ueno et al.;H.Tanahashi et al.;Okuno Y;Adachi T;Ishida A;Hosoda C;Zhu S;Lazaro-Suarez ML;Kagaya S;Zacharia J;Sugimoto Y;Nagata N;Egashira N;Kagaya S;Chen Q;Erami C;Katsuma S;Adachi T;Katsuma S;Yamada M;Yamauchi J;Hosoda C;Adachi T;Katsuma S;Deighan C;Hirasawa A;Ami Y;Koshimizu T;辻本 豪三 - 通讯作者:
辻本 豪三
フローサイトメーターを用いた脂肪酸受容体(GPR40)のリガンド受容体直接相互作用の解析
使用流式细胞仪分析脂肪酸受体 (GPR40) 的配体-受体直接相互作用
- DOI:
- 发表时间:
2008 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
原 貴史;平澤 明;井坪 千怜;定金 恵子;辻本 豪三 - 通讯作者:
辻本 豪三
辻本 豪三的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('辻本 豪三', 18)}}的其他基金
脂肪酸受容体の生理、病態における役割に関する統合的理解
全面了解脂肪酸受体在生理学和病理学中的作用
- 批准号:
24249005 - 财政年份:2012
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
微量臨床検体発現プロファイルによるがんの個別化治療
使用微临床样本表达谱进行个性化癌症治疗
- 批准号:
18018024 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
臨床ゲノム研究のための高感度ゲノム機能解析システムの開発
开发用于临床基因组研究的高灵敏度基因组功能分析系统
- 批准号:
17019038 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ATP細胞間情報伝達作用の個体レベルでの解析
个体水平 ATP 细胞间通讯分析
- 批准号:
15659063 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
G蛋白共役型受容体の細胞内局在の分子機構
G蛋白偶联受体细胞内定位的分子机制
- 批准号:
08672555 - 财政年份:1996
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
α_1アドレナリン受容体サブタイプの薬理学的分類と分子生物学的分類に関する研究
α_1肾上腺素受体亚型的药理学和分子生物学分类研究
- 批准号:
07672413 - 财政年份:1995
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
α、アドレナリン受容体サブタイプの心筋細胞膜イオンチャネル活動への影響
α肾上腺素能受体亚型对心肌细胞膜离子通道活性的影响
- 批准号:
06672228 - 财政年份:1994
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
alpha1アドレナリン受容体遺伝子導入培養心筋細胞における各種イオンチャンネル活動の解析
导入α1肾上腺素受体基因的培养心肌细胞中各种离子通道活性的分析
- 批准号:
05670114 - 财政年份:1993
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
α1アドレナリンレセプター遺伝子の転写制御機構の解析
α1肾上腺素受体基因转录调控机制分析
- 批准号:
04671386 - 财政年份:1992
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
心不全心筋におけるβアドレナリン受容体系の脱感作機構に関する遺伝子レベルでの検討
β-肾上腺素能受体系统在心力衰竭心肌脱敏机制的基因水平研究
- 批准号:
63770124 - 财政年份:1988
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
相似海外基金
老化と関連する血中の細胞外マイクロRNAの同定とアンチエイジング機能性核酸の創出
鉴定血液中与衰老相关的细胞外 microRNA 并创建抗衰老功能核酸
- 批准号:
23K24802 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
ウイルス由来マイクロRNAを標的とした慢性活動性EBウイルス病の治療法の開発
针对病毒衍生的 microRNA 开发慢性活动性 EB 病毒病治疗方法
- 批准号:
24K11569 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
エクソソームおよびマイクロRNA測定による新たな腎移植後慢性拒絶反応の診断法の開発
使用外泌体和 microRNA 测量开发肾移植后慢性排斥反应的新诊断方法
- 批准号:
24K11772 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
脊椎固定術におけるマイクロRNAを標的とした新規分子治療法の開発
脊柱融合手术中针对 microRNA 的新型分子疗法的开发
- 批准号:
24K12312 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
マイクロRNAを用いた心房細動バイオマーカーへの応用と新規治療標的の探索
microRNA在房颤生物标志物中的应用及寻找新的治疗靶点
- 批准号:
24K19006 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
がん細胞におけるスプライシング異常を制御する老化誘導性マイクロRNAの機能解明
阐明衰老诱导的 microRNA 控制癌细胞剪接异常的功能
- 批准号:
23K27458 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
中枢神経髄鞘形成におけるマイクロRNAクラスターの機能的役割の解明
阐明 microRNA 簇在中枢神经髓鞘形成中的功能作用
- 批准号:
24K12353 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
大豆イソフラボン代謝物によって誘導されるマイクロRNAの抗線維化機構の解明
阐明大豆异黄酮代谢物诱导的 microRNA 抗纤维化机制
- 批准号:
24K08835 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
膵発がん時の血中マイクロRNA変動機構の包括的解明
全面阐明胰腺癌发生过程中血液microRNA波动机制
- 批准号:
23K24188 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
エクソソーム由来マイクロRNAに着目した新規大腸癌免疫療法の未来像
聚焦外泌体衍生的 microRNA 的新型结直肠癌免疫疗法的未来愿景
- 批准号:
24K11825 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)