微量臨床検体発現プロファイルによるがんの個別化治療

使用微临床样本表达谱进行个性化癌症治疗

• 批准号: 18018024
• 负责人: 辻本 豪三
• 金额: $ 4.16万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18018024/
• 关键词: 個別化医療; マイクロアレイ; 臨床検体; 食道癌; バイオインフォマティクス; ゲノム情報; 食道がん; DNAチップ; ゲノム医療

本研究では、患者の遺伝的体質に合わせた処方、治療計画を実践するテーラーメイド医療の実現のために、我々が開発した超高感度マイクロアレイ技術を極微量の臨床試料-特に食道や大腸癌の生検試料-に対して応用し、癌の診断並びに治療に役立てることを目標とする。今年度我々は、生検試料に対して高感受性チップを使用し、データの再現性を確認後、チップ搭載コンテンツを決定し癌判別アルゴリズムを改善することに成功した。まず(1)既に株化されている培養食道がん細胞株(約50種)において、化学療法や放射線療法の感受性と発現プロファイルの関係を統合し、これら治療に対する感受性判定に重要な遺伝子群を絞り込んだ。次に(2)これらの遺伝子群によるマイクロアレイを作製し、生検試料によるプロスペクティブ研究を進めた。さらに、食道癌検体について京都大学腫瘍外科、その他の病院施設において倫理審査委員会の承認を得て研究を実施できる体制を構築した。また上記各機関から実験実施箇所である京都大学薬学部までの検体収集搬体制を確立し、品質良好なRNAを抽出可能な状態で検体を収集できることを確認した。具体的には、食道癌生検検体計54組(生検判断によるガン・非ガン)を収集した。癌判別アルゴリズムによってモデル実験を行ったところ、癌組織の割合が6割以上の検体を癌と判別できることが確認された。このアルゴリズムで新規検体を判別したところ、食道癌の判別精度は81%であった。判別できていない検体については、内視鏡検査時に目視で正常と判断されたが前癌状態であった検体が混じっている可能性がある。上述のアルゴリズムで癌と判定された生検検体について、リンパ節転移を予測したところ、確率73%で転移を判別することができた。以上の如く、高感度チップの検証が終わり臨床応用する体制が整ったため、現在このチップ用いた食道癌の臨床研究に取り組んでいる。

This study aims to develop ultra-high sensitivity techniques for the diagnosis of small amounts of clinical samples, especially for esophageal and colorectal cancer, for use in the diagnosis and treatment of cancer. This year, we successfully used the high sensitivity test material to determine the reproducibility of the test material. (1) To integrate the relationship between the sensitivity and development of chemotherapy and radiotherapy, and to identify important subgroups for sensitivity determination in the treatment of esophageal cancer. The second is to make progress in the study of biological samples. In addition, we have established a system for the recognition and implementation of research by the Ethics Review Committee in the Department of Oncology Surgery at Kyoto University and other hospital facilities for esophageal cancer. The system of sample collection was established in the Faculty of Medicine of Kyoto University, and the sample collection was confirmed to be of good quality. The specific esophageal cancer diagnosis was collected in 54 groups. Cancer identification: the identification of cancer cells and the identification of cancer cells. The accuracy of esophageal cancer discrimination was 81%. It is possible to judge whether the pre-cancer state is normal or not during endoscopic examination. The above results show that the detection rate of cancer is 73%, and the detection rate of cancer is 73%. The system of clinical application of the above-mentioned high-sensitivity screening system has been integrated into the clinical research of esophageal cancer.

项目成果

生活習慣病の予防と治療

生活方式相关疾病的预防和治疗

• 发表时间: 2008
• 作者: Arimura T;Hayashi T;Matsumoto Y;Shibata H;Hiroi S;Nakamura T;Inagaki N;Hinohara K;Takahashi M;Itoh-Satoh M;Bonne G;Schwartz K;Kimura A;辻本豪三
• 通讯作者: 辻本豪三

ゲノム創薬-現状と戦略-

基因组药物发现-现状与策略-

• 发表时间: 2007
• 作者: 安部美奈子;他;辻本豪三
• 通讯作者: 辻本豪三

Genetic analysis of multifocal superficial urothelial cancers by array-based comparative genomic

基于阵列的比较基因组对多灶性浅表尿路上皮癌进行遗传分析

• 发表时间: 2007
• 期刊: Br J Cancer 97
• 作者: Kawanishi H;Ogawa O;et. al.
• 通讯作者: et. al.

ゲノムテクノロジーで変わる医療

基因组技术改变医疗保健

• 发表时间: 2007
• 作者: 佐藤光希;他;辻本豪三
• 通讯作者: 辻本豪三

Altered gene expression of transcriptional regulatory factors in tumor marker-positive cells during chemically induced hepatocarcinogenesis

• DOI: 10.1016/j.toxlet.2006.08.014
• 发表时间: 2006-12-01
• 期刊: TOXICOLOGY LETTERS
• 影响因子: 3.5
• 作者: Osada, Shigehiro;Naganawa, Ayako;Nishihara, Tsutomu
• 通讯作者: Nishihara, Tsutomu