RNAとRNA結合型コアクチベーターの相互作用-転写と選択的スプライシングの接点
RNA 和 RNA 结合共激活因子之间的相互作用 - 转录和选择性剪接之间的界面
基本信息
- 批准号:17659281
- 负责人:
- 金额:$ 2.11万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
- 财政年份:2005
- 资助国家:日本
- 起止时间:2005 至 2006
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
近年我々がクローニングしたcoactivator activator(CoAA)は転写活性化因子として機能するほか、RNA結合ドメインであるRNA recognition motif(RRM)を持ち、プロモーター依存性選択的スプライシングを活性化する因子として機能する。Steroid receptor RNA activator(SRA)のようにRNA自体がコアクチベ一夕ーとして機能するものが存在する。RRMを持つCoAA及び、そのスプライシング異性体であり、転写抑制因子であるcoactivator modulator(CoAM)の解析のため、我々は、以下のような新たなin vivo及びin vitroタンパク-RNA結合実験を樹立した。1)in vivo免疫沈降タンパク-RNA結合アッセイ、2)磁力ビーズ結合ポリA-RNAを用いた、迅速タンパク-RNA結合アッセイ、3)発光タンパクであるルシフェラーゼによるmammalian three-hybrid assay、4)発光標識RNAによるin vitroタンパク-RNA結合アッセイ(Liquid Fluorescent RNA pull down assay)、5)in vitro GSTタンパク-RNA pull-downアッセイ。以上のアッセイ及び、既存の実験方法から次の新たな知見が得られた。(1)CoAAはin vivo及び、in vitroにおいて非特異的にRNAと結合する。(2)In vivo及び、in vitroでCoAAはRNA型コアクチベーターであるSRAと結合するとともに、転写を相乗的に活性化する。(3)CoAMはCBPにより活性化された転写を基底レベルまで抑制するが、このとき、histone acetyltransferase (HAT)活性も抑制される。(4)CoAAによる転写活性化及び、CoAMによる転写抑制はRRMの第1RRMを削除すると消失する。
In recent years, we have developed coactivator activators (CoAA) for RNA recognition motifs (RRM), RNA binding motifs, RNA recognition motifs, RNA recognition motifs, RNA recognition Steroid receptor RNA activator(SRA) is a functional RNA activator. RRM maintains CoAA and CoAM as well as coactivator modulator(CoAM) analysis and RNA binding in vivo and in vitro. 1)in vivo immunoprecipitation, 2) in vitro magnetic field binding, rapid magnetic field binding, 3) in vitro Fluorescent field binding, 4) in vitro fluorescent field binding, Liquid fluorescent RNA pull down assay, 5)in vitro fluorescent field binding, GST-RNA pull down assay. The above mentioned problems and problems, existing problems and new problems are solved. (1)CoAA binds to non-specific RNA in vivo and in vitro. (2)In In vivo and in vitro, CoAA is activated by RNA. (3)CoAM inhibits the activity of CBP, HAT and HAT. (4)CoAA is activated and CoAM is inhibited and RRM is eliminated.
项目成果
期刊论文数量(30)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
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- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
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- 通讯作者:鯉淵典之
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- 期刊:
- 影响因子:6.6
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- DOI:
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- 期刊:
- 影响因子:0
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- 通讯作者:Takayama K.
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- DOI:
- 发表时间:2006
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:鯉淵典之;下川哲昭;岩崎俊晴
- 通讯作者:岩崎俊晴
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