天然個体群を用いた、線形動物門の系統的位置に関する分子生物学的研究

利用自然种群对线虫的系统发育位置进行分子生物学研究

• 批准号: 05640784
• 负责人: 白山 義久
• 金额: $ 1.09万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
• 财政年份: 1993
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1993 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-05640784/
• 关键词: 線形動物; 系統分類学; 分子生物学; 18SrRNA; PCR法; 分子進化速度

18SrRNA遺伝子について、既に報告されている2種の線形動物(Caenorhabditis elegansおよびStrongyloides stercoralis)の塩基配列と、他のいくつかの後生動物のものとを比較し、保存的な領域を選定したのち、その部分の塩基配列に基づいてプライマーを作成した。本補助金に基づいて作成したドレッジを用いて、大槌湾から自由生活型で有性生殖性の線形動物であるSymplocostoma sp.とMetachromadora sp.の天然個体群を採集し、全DNAを抽出した。それを鋳型とし、前述のプライマーを用いたPCR法により、18SrRNA遺伝子を増幅することに成功した。さらに、前種のものについては、その塩基配列を決定した。公表されている線形動物2種および他のいくつかの動物門の18SrRNA遺伝子の塩基配列のデータを利用し、原生動物を外群として、今回得られた新たな塩基配列の系統的位置を最大節約法により求めたところ、Symplocostoma sp.と既知の線形動物2種との単系統性が強く支持された。この結果によって、今回得られた配列が間違いなく線形動物のものであることが確認され、さらに「分子系統学的な解析で、線形動物がしばしば常識的でない系統的位置をとるのは、材料に単為生殖性の種を使ったためのアーティファクトである」という仮説が明確に否定された。同じ配列データを距離法により解析すると、線形動物は、原生動物を含めた他の全ての動物に対して独立した単系統群となった。このことは、線形動物において18SrRNA遺伝子の分子進化速度が、他の動物門より著しく速いことを示している。最大節約法は分子系統解析に最もよく用いられているが、比較するグループ間で分子進化速度が異なる場合、正しい系統関係が得られないことがあると言われている。距離法の結果からみて、今回の線形動物のデータも、この例である可能性が高い。

There are two kinds of Caenorhabditis elegans Strongyloides stercoralis in the 18SrRNA, the report, the product, the product, the field in which the product is saved, and so on. This grant is made into a free life form, a sexual reproduction form, a physical animal Symplocostoma sp, and a free life form. Metachromadora sp. The collection of natural individuals and the extraction of full DNA. The PCR method and the 18SrRNA method were used to determine the success of the device. The decision is made on the basis of the agreement, the previous one, and the basis of the agreement. In the public table, there are two kinds of equipment, such as equipment, equipment, It is known that the two kinds of animal systems strongly support the animal system. The result of the experiment is that this time, we have obtained the confirmation of the molecular system, the analysis of the molecular systematics, the location of the common knowledge of the animal system, and the reproductive effect of the material. The location of the animal system is clearly negative. In the same arrangement, the distance method is used to analyze the structure of the animal, the shape of the animal, and the original animal. It contains the whole animal, the whole animal, the independent system and the system. The speed at which the 18SrRNA molecules evolve, and the speed at which the molecules are processed, are displayed. The molecular system of the maximum method is used to analyze the most effective molecular system, the speed of molecular evolution is higher than that of the molecular system, and the accuracy of the system is very high. Since the result of the method, there is a high probability that the animal will be affected this time.