MVR-PCR分析による民族特異的アリルの同定とその系統進化に関する研究

MVR-PCR分析鉴定种族特异性等位基因及其系统发育进化研究

• 批准号: 07670486
• 负责人: 玉木 敬二
• 金额: $ 1.22万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
• 财政年份: 1995
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1995 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-07670486/
• 关键词: ヒトミニサテライト; MVR-PCR; ヒトの分岐; 分子進化

ミニサテライトDNAの繰り返し単位内の変異をマッピングするMVR-PCR法を用いて318個の血縁関係のない日本人のMS32のアリルを分析したところ、異なるアリルは302種類検出された。ドットマトリックス法によってホモロジーの分析をしたところ、75.5%のアリルがそれぞれ部分的に特定のリピートで配列を共有する31のグループに分けられた。分類したアリルを並べてみると、5′末端で各アリルのリピート配列は異なっているが、3′末端に近づくにつれて類似した配列を多く持つようになり、このミニサテライトの5′末端付近の突然変異が膨大な多形性をもたらしたのであろうと推察された。また、Prof.Jeffreysより供与されたCaucasianやAfricanなどの他の人種・民族のアリルデータベースを合わせて、同様に分類して比較したところ、グループ内のアリル相互のホモロジーが極めて高く、殆ど単一の人種・民族のアリルで構成されるものと、数十個の複数の異なる人種・民族のアリルがサブグループを形成しながら、全体にはホモロジーの緩やかな大きなグループを構成するものの2つに大別された。さらに、MS32と同程度の高変異ミニサテライトであるMS31Aにおいても、同様に日本人アリルの分析をおこなった。3種類のアリル特異的MVR-PCRによって149個のアリルをマッピングしたところ、異なるアリルが147種類検出され、99.99%以上の高いヘテロ接合度を示したが、17.4%のアリルは全長50リピート程度の比較的短いものであり、これらの殆どが酷似したリピート配列を持ち、Caucasianのアリルには見られないものであった。このグループのアリルの突然変異率は高くないことが予想され、これらのアリルはMS32において示されたアリルの突然変異率がフランキング領域の制御を受けていることを、違うローカスで採る貴重な資料となるものと予想された。このように、MS32およびMS31アリルのMVR-PCRによるマッピングは民族特異性や相互の関連性について極めて有力な情報を与える遺伝マーカーになり得るものと期待された。

ミニサテライトDNA の缲り returned し単変different をマッピングするMVR-PCR method いて 318 のBlood relationship のないJapanese MS32 のアリルをanalysis したところ, different なるアリルは302 species 検出された.ドットマトリックス法によってホモロジーのANALYSIS をしたところ、75.5%のアリルThere are a total of 31のグループに分けられた for the specific のリピートで配array of the がそれぞれ part. Category したアリルを和べてみると、5′ terminal でeach アリルのリピーThe matching arrangement is different and the 3′ end is similar to the matching one. The column is full of つようになり、このミニサテライトの5′ terminal close Sudden divergence of polymorphism and polymorphism.また、Prof.Jeffreysより公与されたCaucasianやAfricanなどのhis race and ethnicityのアリルデータベースを合わせて, compare with 様にcategoryしたところ、グループ内のアリル Mutual のホモロジーが极めて高く、殆ど単一のracial・National のアリルで constitute されるものと、Dozens of のplural のdifferentなる Race・National のアリルがサブグループを Formation しながら、All にはホモロジーのeasing やかな大きなグループを constitutes するものの2つに大比された.さらに, MS32 and the same degree of の高変different ミニサテライトであるMS31A においても, 同様に日本アリルのANALYSIS をおこなった. 3 kinds of specific MVR-PCR PCR products , 147 types of different なるアリルが検出され, 99.99% or more high いヘテロ joint degree をshow したが, 17.4% of the full length of the のアリルは 50リピート degree, the relatively short いものであり, これらの殆どがIt is very similar to the したリピート配arrayをholdち and the Caucasian のアリルには见られないものであった. The rate of sudden change is highされ、これらのアリルはMS32において出されたアリルのSudden change rate of the field of control and control , violation of the う ロ ー カ ス で collection る precious information と な る も の と yu want さ れ た.このように、MS32およびMS31アリルのMVR-PCRによるマッピングはEthnic specificityや Mutual relationship に つ い て 极 め て powerful な information を and え る 伝マ ー カ ー に な り got る も の と さ れ た.

项目成果

玉木敬二: "MVR-PCR分析によるMS32アリル構造の日本人における特徴" DNA多型. 3. 137-143 (1995)

Keiji Tamaki：“通过 MVR-PCR 分析日本人 MS32 等位基因结构的特征”DNA 多态性。3. 137-143 (1995)。

Huang,Xiu Lin: "Analysis of allelic structures at the D7S21(MS31A)locus in the Japanese using minisatellite variant repeat mapping by PCR(MVR-PCR)." Annals of Human Genetics. (in press). (1996)

黄秀林：“使用 PCR（MVR-PCR）小卫星变异重复定位分析日本人 D7S21（MS31A）基因座的等位基因结构。”