MVR-PCR分析による民族特異的アリルの同定とその系統進化に関する研究

MVR-PCR分析鉴定种族特异性等位基因及其系统发育进化研究

• 批准号: 07670486
• 负责人: 玉木 敬二
• 金额: $ 1.22万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
• 财政年份: 1995
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1995 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-07670486/
• 关键词: ヒトミニサテライト; MVR-PCR; ヒトの分岐; 分子進化

ミニサテライトDNAの繰り返し単位内の変異をマッピングするMVR-PCR法を用いて318個の血縁関係のない日本人のMS32のアリルを分析したところ、異なるアリルは302種類検出された。ドットマトリックス法によってホモロジーの分析をしたところ、75.5%のアリルがそれぞれ部分的に特定のリピートで配列を共有する31のグループに分けられた。分類したアリルを並べてみると、5′末端で各アリルのリピート配列は異なっているが、3′末端に近づくにつれて類似した配列を多く持つようになり、このミニサテライトの5′末端付近の突然変異が膨大な多形性をもたらしたのであろうと推察された。また、Prof.Jeffreysより供与されたCaucasianやAfricanなどの他の人種・民族のアリルデータベースを合わせて、同様に分類して比較したところ、グループ内のアリル相互のホモロジーが極めて高く、殆ど単一の人種・民族のアリルで構成されるものと、数十個の複数の異なる人種・民族のアリルがサブグループを形成しながら、全体にはホモロジーの緩やかな大きなグループを構成するものの2つに大別された。さらに、MS32と同程度の高変異ミニサテライトであるMS31Aにおいても、同様に日本人アリルの分析をおこなった。3種類のアリル特異的MVR-PCRによって149個のアリルをマッピングしたところ、異なるアリルが147種類検出され、99.99%以上の高いヘテロ接合度を示したが、17.4%のアリルは全長50リピート程度の比較的短いものであり、これらの殆どが酷似したリピート配列を持ち、Caucasianのアリルには見られないものであった。このグループのアリルの突然変異率は高くないことが予想され、これらのアリルはMS32において示されたアリルの突然変異率がフランキング領域の制御を受けていることを、違うローカスで採る貴重な資料となるものと予想された。このように、MS32およびMS31アリルのMVR-PCRによるマッピングは民族特異性や相互の関連性について極めて有力な情報を与える遺伝マーカーになり得るものと期待された。

ミ ニ サ テ ラ イ ト DNA の Qiao り return し 単 within の - different を マ ッ ピ ン グ す る MVR PCR method を with い て 318 の blood try masato is の な い Japanese の MS32 の ア リ ル を analysis し た と こ ろ, different な る ア リ ル は 302 kinds 検 さ れ た. ド ッ ト マ ト リ ッ ク ス method に よ っ て ホ モ ロ ジ ー の analysis を し た と こ ろ, 75.5% の ア リ ル が そ れ ぞ れ part に specific の リ ピ ー ト で match column を mutual す る 31 の グ ル ー プ に points け ら れ た. Classification し た ア リ ル を and べ て み る と, 5 'end で ア リ ル の リ ピ ー ト match column は different な っ て い る が, 3' end に nearly づ く に つ れ て similar し た match column を く hold more つ よ う に な り, こ の ミ ニ サ テ ラ イ ト の 5 'paying nearly の suddenly - different が terminal expansion な pleomorphic を も た ら し た の で あ ろ う と push examine さ れ た. ま た, initial Jeffreys よ り さ and supply れ た Caucasian や substitutes な ど の he の racial, ethnic の ア リ ル デ ー タ ベ ー ス を close わ せ て, with others in に classification し て compare し た と こ ろ, グ ル ー プ within の ア リ ル mutual の ホ モ ロ ジ ー が め extremely high て く, almost ど 単 a の racial, ethnic の ア リ ル で Constitute さ れ る も の と, dozens of の plural の different な る racial, ethnic の ア リ ル が サ ブ グ ル ー プ を form し な が ら, all に は ホ モ ロ ジ ー の slow や か な big き な グ ル ー プ を constitute す る も の の 2 つ に comparing さ れ た. さ ら に, MS32 と same degree の high - different ミ ニ サ テ ラ イ ト で あ る MS31A に お い て も, with others in Japanese に ア リ ル の analysis を お こ な っ た. 3 kinds の ア リ ル specific MVR PCR - に よ っ て 149 の ア リ ル を マ ッ ピ ン グ し た と こ ろ, different な る ア リ ル が 147 kinds 検 さ れ, high above 99.99% の い ヘ テ ロ を joint degrees in し た が, 17.4% の ア リ ル は 50 リ ピ ー ト の short い comparative も の で あ り, こ れ ら の perilous ど が The appearance is similar to that of たリピ たリピ ト ト, which is paired with を holding ち, Caucasian アリ アリ, に に, られな. こ の グ ル ー プ の ア リ ル の suddenly - high rate of different は く な い こ と が to think さ れ, こ れ ら の ア リ ル は MS32 に お い て in さ れ た ア リ ル の suddenly - different rate が フ ラ ン キ ン の グ field suppression を by け て い る こ と を う, spare ロ ー カ ス で valuable な data mining る と な る も の と to think さ れ た. こ の よ う に, MS32 お よ び MS31 ア リ ル の MVR PCR - に よ る マ ッ ピ ン グ は ethnic specificity や mutual の masato even sex に つ い て extremely め て な intelligence を and strong え る heritage 伝 マ ー カ ー に な り have る も の と expect さ れ た.

项目成果

玉木敬二: "MVR-PCR分析によるMS32アリル構造の日本人における特徴" DNA多型. 3. 137-143 (1995)

Keiji Tamaki：“通过 MVR-PCR 分析日本人 MS32 等位基因结构的特征”DNA 多态性。3. 137-143 (1995)。

Huang,Xiu Lin: "Analysis of allelic structures at the D7S21(MS31A)locus in the Japanese using minisatellite variant repeat mapping by PCR(MVR-PCR)." Annals of Human Genetics. (in press). (1996)

黄秀林：“使用 PCR（MVR-PCR）小卫星变异重复定位分析日本人 D7S21（MS31A）基因座的等位基因结构。”