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アリル進化の痕跡から個人特異性と集団近縁性を同時解析するDNA検査法の開発

アリル進化の痕跡から個人特異性と集団近縁性を同時解析するDNA検査法の開発
开发一种 DNA 测试方法,可根据等位基因进化的痕迹同时分析个体特异性和群体相关性
批准号:
16659169
负责人:
玉木 敬二
金额:
$2.18万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 2005

项目摘要

项目成果

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最近のDNA検査をはじめとする物体検査から要求される情報は個人識別にとどまらない。例えば血痕などから個人識別情報だけでなく、その個人の属する集団がある程度判明すれば法医鑑識上、大変有用な情報となる。このため、昨年度はこのような高変異ミニサテライトのひとつであるB6.7について、その高変異性の源をたどるべく、霊長類のDNAを用いて、B6.7相当領域の増幅とアリルの塩基配列決定を試みた。17年度は、現在最も集団近縁性を示すMS32(D1S8)について検討した。MS32のアリル情報は、コーカシアンやアフリカンの民族では多く解析されているが、アジア人で多く解析されているのは日本人だけである。そこで、同じアジア人であるタイ人のアリルを分析した。まず、MS32にはミニサテライトの近傍配列の一塩基多型(SNP)が3カ所知られているが、その3カ所をタイピングしてヘテロ接合体を選択した。その結果、Hfと呼ばれるSNPではタイ人サンプル170例のうち60例がヘテロ接合体であったため、このSNPを利用したアリル特異的MVR-PCRを行い、アリルのマッピングをおこなった。マッピングされた106個のMVRの比は、aタイプとtタイプの比で3:1となっており、他の民族と有意な違いを示すものではなかった。また、このうち、アリルコードでは識別できないアリル(同一アリル)は2組あり、他の102個のアリルは全て異なっていた。さらに、ドット・マトリクス法で、今までマッピングされた世界の民族アリルのデータと構造を比較したところ、有意な類似性を示して、グループを作成するアリルが57個であった。そのアリル内類似性によってアリルを並べてみると、タイ人アリルは最も似ているアリルに日本人アリルが選ばれるのがコーカシアンアリルに比べ2倍以上あり、アフリカンアリルに最も似ているという結果を示したアリルは見られなかった。このように、MS32はタイ人においても高い個人識別力を有しているだけでなく、その集団の特徴を表すモチーフ構造をアリル内に有しており、多型マーカーとして極めて有用なローカスであることが示された。今後は他のローカスや他の集団に分析を拡げて、さらに高度なミニサテライト解析法を確立したいと考えている。
期刊论文(12)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
霊長類におけるヒトミニサテライトの分析
灵长类动物的人类小卫星分析
DOI: --
发表时间: 2005
期刊: DNA多型 13
影响因子: --
作者: [Suka M, et al., Katsumi Yoshida, 飯野 守男]
通讯作者: 飯野 守男
Humam tandem repeat sequences in forensic DNA typing.
法医 DNA 分型中的 Humam 串联重复序列。
DOI: --
发表时间: 2005
期刊: Legal Med 7
影响因子: --
作者: [Suka M, et al., Katsumi Yoshida, 飯野 守男, Iino M, Yuan Q-H, Tamaki K]
通讯作者: Tamaki K
Evolution of hypervariable minisatellite B6.7 in man and primates.
人类和灵长类动物中高变小卫星 B6.7 的进化。
DOI: --
发表时间: 2005
期刊: Rechtsmedizin 15
影响因子: --
作者: [Suka M, et al., Katsumi Yoshida, 飯野 守男, Iino M]
通讯作者: Iino M
DOI: --
发表时间: 2005
期刊: 臨床検査 (印刷中)
影响因子: --
作者: [Suka M, et al., Katsumi Yoshida, 飯野 守男, Iino M, Yuan Q-H, Tamaki K, 玉木 敬二]
通讯作者: 玉木 敬二
高識別遺伝マーカーと法数学推計値による混合試料からの新しい情報抽出法の検討
  • 批准号:
    21659174
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
  • 资助金额:
    $1.98万
  • 财政年份:
    2009
  • 负责人:
    玉木 敬二
  • 依托单位:
突然死の法医診断と心臓突然死予防策の確立を目指したDNA指標の分子法医学的研究
  • 批准号:
    18659193
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 资助金额:
    $2.11万
  • 财政年份:
    2006
  • 负责人:
    玉木 敬二
  • 依托单位:
新しい自動マルチローカスMVR−PCR法による高排除率親子鑑定法の開発
  • 批准号:
    10670386
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $1.28万
  • 财政年份:
    1998
  • 负责人:
    玉木 敬二
  • 依托单位:
MVR-PCR分析による民族特異的アリルの同定とその系統進化に関する研究
  • 批准号:
    07670486
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $1.22万
  • 财政年份:
    1995
  • 负责人:
    玉木 敬二
  • 依托单位:
海外基金