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海洋微生物の多様性と物質循環フラックスに関する基礎的研究

海洋微生物多样性与物质循环通量基础研究

基本信息

批准号：
14656077
负责人：
浜崎恒二
金额：
$ 2.18万
依托单位：
Hiroshima University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至 2003
项目状态：
已结题

项目摘要

(1)Single-cell BrdU法-特異的プローブとの併用:広島湾より約30種類の海洋細菌を分離し、16S rRNA塩基配列による系統解析を行った。この培養株を用いて、海洋の主要系統群に対するFISH法及びBrdU免疫染色法を行い、特異性の検討と条件設定を行った。(2)BrdU/DGGE法による活性細菌群集の解析:瀬戸内海及び、西部北太平洋(東大海洋研究所共同研究)、サロマ湖(北大低温科学研究所共同研究)を実施し、活性細菌群の時空間変動をモニタリングするための試料を採取した。瀬戸内海において常に出現する細菌種、適当な条件下で出現する細菌種等を特定し、特異的なプローブをデザインした。(3)Single-cel BrdU法によるモニタリング:天然海水にBrdUを加えて培養し、FISHプローブを用いて、活発に増殖する細菌種の生物量、増殖速度を測定する実験を行った。同時に、全BrdU取り込み量を免疫学的に測定し、群集増殖速度を推定するための実験も行った。東大海洋研究所白鳳丸のRI施設を用いて、BrdU法と従来の放射性チミジンを用いる海洋細菌生産量測定法との比較データを集めた。本研究の成果は、国内外の学会発表3件や招待講演2件として公開され(第6回国際バイオテクノロジー会議2003年9月、第19回日本微生物生態学会2003年10月、日仏ワークショップ招待講演2003年11月、第6回VNC研究会招待講演2004年2月、第10回国際微生物生態学会2004年8月)、解説一報、原著論文一報にまとめられた。

(1)Single-cell BrdU method-specific application: isolation of about 30 species of marine bacteria, 16S rRNA gene alignment and system analysis. The culture of these strains was performed using FISH and BrdU immunostaining methods for major system groups in the ocean, and specific assay conditions were set. (2)BrdU/DGGE method was used to analyze the active bacterial community in the inland sea and the western North Pacific Ocean (jointly studied by the Institute of Oceanography of Dongda University) and the lake (jointly studied by the Institute of Cryology of Peking University). The bacteria species that often appear in the interior of the sea, the bacteria species that appear under appropriate conditions, etc., are specific and specific. (3)Single-cel BrdU method: natural seawater BrdU addition, culture, FISH use, viable growth of bacterial species biomass, growth rate determination. At the same time, the total BrdU concentration was determined by immunology, and the colony growth rate was estimated by immunology. A comparative study on the application of the BrdU method to the determination of marine bacterial production The results of this study were published in 3 academic journals at home and abroad and 2 public lectures.(6th International Conference on Microbiology, September 2003, 19th Japan Society of Microbiology, October 2003, Japanese Lecture, November 2003, 6th VNC Research Conference, February 2004, 10th International Society of Microbiology, August 2004), one paper, one paper