ウイルス遺伝子の進化機構

病毒基因的进化机制

• 批准号: 04640599
• 负责人: 五條堀 孝
• 金额: $ 1.28万
• 依托单位: National Institute of Genetics
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
• 财政年份: 1992
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1992 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-04640599/
• 关键词: ウイルス; 進化; 系統樹; 感染症; AIDS; HIV; MHC; 主要組織適合性

本研究は、「ウイルス遺伝子の分子進化に関する特徴の全体像を把握し、その進化機構を解明する」ことを目的として遂行された。特に、ウイルス遺伝子だけに注目するのではなく、それとの相互作用がウイルス遺伝子の発現や病原性にとって極めて重要だと思われる宿主側の遺伝子にも注目した。例えば、細胞性免疫に本質的な役割を果している主要組織適合性遺伝子や細胞内情報伝達に重要なプロテアーゼやそのインヒビターについても、その進化的描像を研究した。ウイルス遺伝子に関しては、日本で単離されたヒト免疫不全ウイルス(HIV)の6系統について系統樹を作成し、その進化的起源と他のHIV単離株との関係を明らかにした。この結果、血友病患者で血しょう製剤によりHIVに感染したものは、そのHIVがほとんどアメリカ合衆国から単離されたHIV株と非常に近縁であることが明らかになった。ただし、アメリカ合衆国内の地域は、西海岸から東海岸までさまざまな各地のHIV感染者からの単離株と日本のHIV株は近縁で、特にある特定の地域からの単離株と密接な関係があるとは思われなかった。さらに、このようなHIVの系統樹解析により、その注目するウイルス株がどこから由来したかという診断が可能であることがわかった。これを、われわれは「感染症ウイルスの系統樹診断」と名付け、他のいろいろな感染症ウイルスにも応用できることがわかった。このように、本研究は当初の目的を達成し、研究遂行も順調に行われたと統括できる。今後もこの方向をさらに発展させ、ウイルス遺伝子の進化機構の解明に向けて努力するつもりである。

This research was carried out with the goal of "grasping the totality of the characteristics related to the molecular evolution of the Isis gene and explaining the evolutionary mechanism." The interaction between the host and the virus is important for the development and pathogenicity of the virus. For example, the essential functions of cellular immunity are studied in the study of the characteristics of cellular immunity and intracellular information transmission. The relationship between HIV infection and HIV infection in Japan has been clarified. The phylogenetic tree of HIV infection in Japan has been established. The origin of HIV infection and the relationship between HIV infection and HIV infection have been clarified. As a result, hemophilia patients are infected with HIV and infected with HIV. In the United States, the region of the West Coast, the East Coast, the region of HIV infection, the region of HIV infection, the region of HIV infection, HIV phylogenetic tree analysis is possible. The name of the infection is "Phylogenetic tree diagnosis." This study aims to achieve the original goal, and to study the implementation of the system. In the future, we will continue our efforts to develop and clarify the evolution mechanism of the virus.

项目成果

Imanishi,T.,and T.Gojobori: "Patterns of nucleotide substitution inferred from the phylogenies of the class I major histocompatibility complex genes." J.Mol.Evol.35. 196-204 (1992)

Imanishi,T. 和 T.Gojobori：“从 I 类主要组织相容性复合体基因的系统发育中推断出的核苷酸取代模式。”

Ikeo,K.,K.Takahashi,and T.Gojobori: "Evolutionary Origin of a Kunitz-type trypsin inhibitor domain inserted in the amyloid β precursor protein of Alzheimer's disease." J.Mol.Evol.34. 536-543 (1992)

Ikeo, K.、K. Takahashi 和 T. Gojobori：“插入阿尔茨海默病β淀粉样蛋白前体蛋白中的库尼茨型胰蛋白酶抑制剂结构域的进化起源”（J.Mol.Evol.34）。 ）

Shimizu,N.,Y.Takeuchi,T.Naruse.,M.Inagaki,E.N.Moriyama,T.Gojobori,and H.Hoshino: "Six strains of human immunodeficiency virus type-1 isolated in Japan and their molecular phylogeny." J.Mol.Evol.35. 329-336 (1992)

Shimizu,N.、Y.Takeuchi、T.Naruse.、M.Inagaki、E.N.Moriyama、T.Gojobori 和 H.Hoshino：“在日本分离的六种人类免疫缺陷病毒 1 型及其分子系统发育。”

Ina,Y.,Mizokami,E.Orito,E.N.Moriyama,M.Yamamoto,and T.Gojobori: "Reduction of synonymous substitutions in the core protein gene of hepatitis C virus." (Submitted to J.Mol.Evol.). (1992)

Ina,Y.,Mizokami,E.Orito,E.N.Moriyama,M.Yamamoto,and T.Gojobori：“丙型肝炎病毒核心蛋白基因同义替换的减少。”

Moriyama,E,N.and T.Gojobori: "Rates of synonymous substitution and base composition of nuclear genes in Drosophila." Genetics. 130. 855-864 (1992)

Moriyama，E，N. 和 T.Gojobori：“果蝇核基因的同义取代率和碱基组成。”