课题基金 / 基金详情

正の自然淘汰の働く遺伝子内領域の推定に基づく遺伝子機能とその変化の予測

正の自然淘汰の働く遺伝子内領域の推定に基づく遺伝子機能とその変化の予測
基于正自然选择作用的基因内区域的预测基因功能及其变化
批准号：
09874159
负责人：
五條堀 孝
金额：
$1.34万
依托单位：
National Institute of Genetics
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
1997
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
1997 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-09874159/
关键词：
正の自然淘汰遺伝子機能DNA配列遺伝子内領域

项目摘要

项目成果

五條堀 孝的其他基金

相似基金

相关文献

中文摘要
翻译
本研究は、現在世界中で進行している各種生物のゲノムプロジェクトを受けて、そこから産生される膨大なゲノムの塩基配列データを用いて、相同遺伝子グループを同定するとともに、それぞれのグループごとでマルチプルアラインメントを作成し、遺伝子機能の推定を行うことにある。特に、正の自然淘汰が働いている遺伝子内領域の推定を行い、それらと機能的ドメインとの対応関係を調べることによって、遺伝子のドメイン進化の予測を行う方法を探索しようというものであった。本年度は、相同遺伝子グループのマルチプルアライメント作成のアルゴリズムを洗練させることに成功した。ただ機能的ドメインの同定に少し手こづっており、これはもう少し時間を要する。しかし、遺伝子内において正の自然淘汰の働く領域の推定には、ウィンドウ解析を同義置換と非同義置換に行いうるというアイデアで、うまくいくことが実証され、そのプログラムも完成した。これらは遺伝子機能やその変化の予測に多いに役立つものと期待される。
英文摘要
本研究は、現在世界中で進行している各種生物のゲノムプロジェクトを受けて、そこから産生される膨大なゲノムの塩基配列データを用いて、相同遺伝子グループを同定するとともに、それぞれのグループごとでマルチプルアラインメントを作成し、遺伝子機能の推定を行うことにある。特に、正の自然淘汰が働いている遺伝子内領域の推定を行い、それらと機能的ドメインとの対応関係を調べることによって、遺伝子のドメイン進化の予測を行う方法を探索しようというものであった。本年度は、相同遺伝子グループのマルチプルアライメント作成のアルゴリズムを洗練させることに成功した。ただ機能的ドメインの同定に少し手こづっており、これはもう少し時間を要する。しかし、遺伝子内において正の自然淘汰の働く領域の推定には、ウィンドウ解析を同義置換と非同義置換に行いうるというアイデアで、うまくいくことが実証され、そのプログラムも完成した。これらは遺伝子機能やその変化の予測に多いに役立つものと期待される。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Tateno Y.: "Evolutionary motif and its biological and structural significance." J.Mol.Evol.44・1. 38-43 (1997)
Tateno Y.：“进化基序及其生物学和结构意义。”J.Mol.Evol.44·1（1997）。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Sato, S.: "Ascidian tyrosinase gene:its unique structure and expression in the developing brain" Developmental Dynamics. 208. 363-374 (1997)
Sato, S.：“海鞘酪氨酸酶基因：其独特的结构和在发育中大脑中的表达”发育动力学。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Suzuki Y.: "The origin and evolution of ebola and marburg viruses." Mol.Biol.Evol.14・8. 800-806 (1997)
铃木 Y.：“埃博拉病毒和马尔堡病毒的起源和进化。”Mol.Biol.Evol.14・8（1997）。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Okamoto Y.: "Father-to-mother-to-infant transmission of HIV-1 : clonally transmitted isolate of infant mutates more rapidly than that of the mother and rapidly loses reactivity with neutralizing antibody." Microbiol Immunol. 42・2. 131-138
Okamoto Y.：“HIV-1 的父亲到母亲到婴儿的传播：婴儿的克隆传播分离株比母亲的变异更快，并且迅速失去与微生物免疫 131 的反应性。” -138
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
共 14 条
    代謝進化のメカニズム-緑色硫黄細菌と生体異物分解経路を中心として-
    • 批准号：
      08F08086
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额：
      $1.02万
    • 财政年份：
      2008
    • 负责人：
      五條堀 孝
    • 依托单位：
      National Institute of Genetics
    マウス胚における眼の形態形成に関する遺伝子発現制御と細胞死の比較ゲノム学的研究
    • 批准号：
      01F00104
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额：
      $0.96万
    • 财政年份：
      2001
    • 负责人：
      五條堀 孝
    • 依托单位：
      National Institute of Genetics
    古生化学的アプローチによる分子レベルでの自然淘汰の検出
    • 批准号：
      99F00707
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额：
      $1.15万
    • 财政年份：
      1999
    • 负责人：
      五條堀 孝
    • 依托单位：
      National Institute of Genetics
    病原性ウイルスの進化におけるMHCの役割
    • 批准号：
      97F00119
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额：
      $1.28万
    • 财政年份：
      1998
    • 负责人：
      五條堀 孝
    • 依托单位：
      National Institute of Genetics
    海外基金