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High resolution electrospray ionization tandem mass spectrometer coupled to nanoflow chromatography for proteome research

高分辨率电喷雾电离串联质谱仪与纳流色谱联用用于蛋白质组研究

基本信息

批准号：
442069358
负责人：
金额：
--
依托单位：
Georg-August-Universität Göttingen
依托单位国家：
德国
项目类别：
Major Research Instrumentation
财政年份：
2020
资助国家：
德国
起止时间：
2019-12-31 至无数据
项目状态：
未结题

来源：
https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/442069358?language=en
关键词：
resolution electrospray ionization tandem mass

项目摘要

We apply for a high resolution electrospray ionization tandem mass spectrometer coupled to nanoflow chromatography for proteome research at the University Medical Center Göttingen (UMG), University of Göttingen. The instrument we are applying for will be placed in the UMG's Scientific Core Facility Proteomics (DFG RIsources RI_00483) to offer access to this key technology in proteome research preferentially to the UMG's research groups. The Core Facility was founded in the UMG Institute of Clinical Chemistry in 2012, and is currently operating two high resolution mass spectrometers. The mass spectrometer applied for here will replace one of these aging instruments.We plan to mainly use the new instrument for the following applications:1) label-free proteome profiling in samples from cell culture, body fluids and tissues by data-independent acquisition (DIA) mass spectrometry2) global analysis of posttranslational protein modifications such as phosphorylation and ubiquitinylation after affinity enrichment3) analysis of protein interactions biomolecular complexes and cell compartments by affinity purification mass spectrometry or by proximity profiling methods4) analysis of direct protein/protein contact sites by chemical rosslinking using bifunctional crosslinking reagents

我们申请了一个高分辨率电喷雾串联质谱仪耦合到nanoflow色谱蛋白质组研究在哥廷根大学医学中心（UMG），哥廷根大学。我们正在申请的仪器将被放置在UMG的科学核心设施蛋白质组学（DFG RIsomerRI_00483），以优先向UMG的研究小组提供蛋白质组研究中的这一关键技术。核心设施于2012年在UMG临床化学研究所成立，目前正在运行两台高分辨率质谱仪。本次申请的质谱仪将取代其中一台老化的仪器，我们计划将新仪器主要用于以下应用：1）来自细胞培养物的样品中的无标记蛋白质组分析，通过数据非依赖性采集（DIA）质谱法对体液和组织进行分析2）在亲和富集后对翻译后蛋白质修饰（例如磷酸化和泛素化）进行全面分析3）通过亲和纯化质谱法或通过邻近分析法对蛋白质相互作用生物分子复合物和细胞区室进行分析4）直接蛋白质/使用双官能交联剂通过化学交联的蛋白质接触位点