New roles of RNAs in metabolic regulation

RNA在代谢调节中的新作用

• 批准号: 17207010
• 负责人: AIBA Hiroji
• 金额: $ 32.45万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17207010/
• 关键词: small RNA; 翻訳制御; mRNA分解; Hfq; 塩基対形成; グルコース応答; 代謝ストレス; tmRNA; 品質管理; RNase E; グルコーストランスポーター; 解糖系; 翻訳抑制; ribonucleoprotein complex

大腸菌tmRNA とリボソームによる翻訳とmRNA 分解制御について解析し、翻訳途上のリボソームが停滞した際にmRNA の切断を誘起し、tmRNA 系と連動してmRNA とタンパク質の双方を分解するというより巧妙な品質管理機構として働いていることを明らかにした。具体的には、翻訳終結因子RF の活性低下、連続するレアコドンを持つmRNA の翻訳、あるいはアミノ酸枯渇により生じるリボソームの停滞に応答していずれの場合にもmRNA が切断されることを見いだし、翻訳伸長の遅延あるいは停滞によるmRNA の切断と分解が普遍的な機構であることを示した。また、グルコース-6-リン酸の異常な蓄積により合成が誘導され、ptsG mRNA を標的としているHfq 結合性小分子RNA(sRNA)であるSgrS による翻訳抑制とmRNA の分解について解析し、SgrS が、ptsG mRNA の翻訳開始領域と部分的な塩基対を形成し、Rnase E に依存したmRNA の不安定化をもたらすこと、SgrS がHfq を介してRnase E と相互作用すること、SgrSによるptsG mRNA の抑制機構において、ptsG mRNA の翻訳阻害が第一義的であること、HfqがSgrS とptsG mRNA の塩基対形成を促進すること、さらには、ptsG mRNA の膜局在性がSgrSのptsG mRNA への効果的な作用に寄与していることなどを明らかにした。

Coliform tmRNA と リ ボ ソ ー ム に よ る turn 訳 と mRNA decomposition suppression に つ い て analytical し, double 訳 retreating の リ ボ ソ ー ム が stagnation し た interstate に mRNA の cut を induced し, tmRNA と correlation し て mRNA と タ ン パ ク both qualitative の を decomposition す る と い う よ り clever な quality management organization と し て 働 い て い る こ と を Ming ら か に し た. Specific に は, low end turn 訳 factor RF の activity, even 続 す る レ ア コ ド ン を hold つ mRNA の 訳, あ る い は ア ミ ノ acid dry 渇 に よ り raw じ る リ ボ ソ ー ム の stagnation に 応 answer し て い ず れ の occasions に も mRNA が cut さ れ る こ と を see い だ し, double 訳 elongation の 遅 delay あ る い は stagnation に よ る mRNA Youdaoplaceholder0 cut off と decompose が common な mechanism である た とを show た た. ま た, グ ル コ ー ス - 6 - リ ン acid accumulation of abnormal の な に よ り synthetic が induced さ れ, ptsG mRNA を mark と し て い る Hfq associativity small rnas (sRNA) で あ る SgrS に よ る turn 訳 inhibit と mRNA の decomposition に つ い て analytical し, SgrS が, ptsG mRNA の 訳 start と part in the field of な salt formed を seaborne し, Rnase E に dependent し た mRNA の not stabilization を も た ら す こ と, SgrS が Hfq を interface し て Rnase E と interaction す る こ と, SgrS に よ る ptsG mRNA の inhibit institutions に お い て, ptsG mRNA の turn 訳 resistance against が righteous one で あ る こ と, Hfq が SgrS と ptsG mRNA の salt base forming seaborne を promote す る こ と, さ ら に は, ptsG mRNA の film bureau in the sexual が SgrS の ptsG mRNA へ の unseen fruit な role に send し て い る こ と な ど を Ming ら か に し た.

项目成果

Yeel, a novel protein involved in modulation of the activity of the glucose-phosphotransferase system in Escherichia coli K-12.

Yeel，一种参与调节大肠杆菌 K-12 葡萄糖磷酸转移酶系统活性的新型蛋白质。

• 发表时间: 2006
• 期刊: J Bacteriol. 188
• 作者: Becker.A.K.;Zeppenfeld;T.;Staab;A.;Seitz;S.;Boos;W.;Morita T.;Aiba H.;Mahr;K.;Titgemeyer;F.;Jahreis;K.
• 通讯作者: K.

(2005) Rnase E-based ribonucleoprotein complexes : mechanicalbasis of mRNA destabilization mediated by bacterial noncoding RNAs

(2005) 基于 Rnase E 的核糖核蛋白复合物：细菌非编码 RNA 介导的 mRNA 不稳定的机械基础

• 期刊: Genes Dev 19
• 作者: Morita;T.;Maki;K.;and Aiba;H
• 通讯作者: H

Mechanism and role of mRNA degradation mediated by Hfq-binding small RNAs in E. coli. JSPS-DST Asian Academic Seminar

大肠杆菌中 Hfq 结合小 RNA 介导的 mRNA 降解机制和作用。

• 发表时间: 2008
• 作者: Aiba;H
• 通讯作者: H

大腸菌smallRNAによるRNA サイレンシングの分子機構

大肠杆菌smallRNA沉默RNA的分子机制

• 发表时间: 2006
• 期刊: 蛋白質 核酸 酵素 51
• 作者: 森田鉄兵;饗場弘二
• 通讯作者: 饗場弘二

(2006) Base-pairing requirement for RNA silencing by a bacterial small RNA and acceleration of duplex formation by Hfq

(2006) 细菌小 RNA 沉默的碱基配对要求和 Hfq 加速双链体形成

• 期刊: Mol. Microbiol 61
• 作者: Kawamoto;H.;Koide;Y.;Morita;T.;and Aiba;H.
• 通讯作者: H.