Molecular basis of the action of Hfq-binding small RNA inEscherichia coli.

大肠杆菌中 Hfq 结合小 RNA 作用的分子基础。

• 批准号: 21247025
• 负责人: AIBA Hiroji
• 金额: $ 18.72万
• 依托单位: Suzuka University of Medical Science
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21247025/
• 关键词: 小分子 RNA; Hfq; サイレンシング; 転写後制御; 大腸菌; 小分子RNA; 翻訳抑制; 塩基対形成; mRNA分解; RNaseE; 転写終結シグナル; polyU tail; RNase E; RNAオリゴ; 試験管内翻訳

Molecular basis of the function of Hfq-binding sRNA has been studied using SgrS as a model. The major findings are as follows. (1) The 14 nt region within SgrS is the minimum region required for base-pairing and translational repression of ptsG mRNA. (2) The region between 711 and 750 of RNase E is sufficient for the functional interaction with Hfq to support the rapid degradation of ptsG mRNA. (3) The polyU tail of rho-independent terminator is essential for Hfq action. (4) The functional Hfq-binding module of bacterial sRNAs consists of a double or single hairpin preceded by a U-rich sequence and followed by a 3’ poly(U) tail. (5) The synthetic Hfq-binding small RNAs to knock down desired mRNAs have been successfully designed.

使用 SgrS 作为模型研究了 Hfq 结合 sRNA 功能的分子基础。主要调查结果如下。 (1) SgrS 内的 14 nt 区域是 ptsG mRNA 碱基配对和翻译抑制所需的最小区域。 (2) RNase E 711和750之间的区域足以与Hfq发生功能性相互作用，以支持ptsG mRNA的快速降解。 (3) rho 独立终止子的 PolyU 尾对于 Hfq 作用至关重要。 (4) 细菌 sRNA 的功能性 Hfq 结合模块由双发夹或单发夹组成，前面是富含 U 的序列，后面是 3' 聚 (U) 尾。 (5) 成功设计了合成的Hfq结合小RNA来敲低所需的mRNA。

项目成果

歴史を遡るRNA研究

RNA研究追溯历史

• 发表时间: 2009
• 期刊: 遺伝子医学MOOK 15
• 作者: Kato K.;Tashiro J.;Miyawaki S.;Ebe K.;Tokunaga M.;饗場弘二
• 通讯作者: 饗場弘二

Poly tail of rho-independent terminator of bacterial small RNA acts an essentialHfq-binding site for riboregulation. The 16thAnnual meeting of the RNA society

细菌小 RNA 的 rho 独立终止子的多尾是核糖调节必需的 Hfq 结合位点。

• 发表时间: 2011
• 作者: 大鷹弘紀;石川博一;森田鉄兵;饗場弘二
• 通讯作者: 饗場弘二

Functional organization of Hfq-binding regulatory RNA

Hfq 结合调节 RNA 的功能组织

• 发表时间: 2011
• 作者: Nagai;M. and Yoneda;Y;岩崎博史;Takeo Kishimoto;立田晴記;饗場弘二
• 通讯作者: 饗場弘二

大腸菌sRNAであるSgrSの機能領域の解析

大肠杆菌 sRNA SgrS 的功能区分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 石川博一;大鷹弘紀;森田鉄兵;饗場弘二
• 通讯作者: 饗場弘二

合成RNAによるptsG mRNAの翻訳抑制

合成 RNA 对 ptsG mRNA 的翻译抑制

• 发表时间: 2009
• 作者: 牧貴美香;森田鉄兵;饗場弘二
• 通讯作者: 饗場弘二