Development and Evaluation of Integron Gene Cassette Metagenome Analysis

整合子基因盒宏基因组分析的开发和评估

基本信息

项目摘要

This project aimed to study the mobile DNA element, integrons, and associated gene cassettes, for the first time, in extreme marine environments. Novel and diverse integron structures and environment- adaptive gene cassettes have been recovered. This project had three main achievements. First, it introduced new methodology for recovery of integrons from environmental metagenomes. Second, it extended our understanding to the contribution of integrons in the adaptation of bacteria to extreme marine conditions. Third, it provided us with several novel adaptive and metabolic genes that have several biotechnological applications.
该项目旨在首次研究极端海洋环境中的移动的DNA元件、整合子和相关基因盒。新的和多样的整合子结构和环境适应性基因盒已经恢复。该项目取得了三项主要成就。首先,它介绍了从环境宏基因组中回收整合子的新方法。其次,它扩展了我们对整合子在细菌适应极端海洋条件中的贡献的理解。第三,它为我们提供了几个新的适应性和代谢基因,具有几个生物技术应用。

项目成果

期刊论文数量(49)
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专利数量(0)
Integron metagenome comparison between petroleum oil contaminated and oil-free marine sediments : New study and methodology to expand knowledge about integron diversity in marine environment.
石油污染和无油海洋沉积物之间的整合子宏基因组比较:扩展有关海洋环境中整合子多样性知识的新研究和方法。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Hosam Elsaied;Keiko Kitamura;Akihiko Maruyama
  • 通讯作者:
    Akihiko Maruyama
First investigation of the microbiology of the deepest layer of ocean crust.
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0015399
  • 发表时间:
    2010-11-05
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Mason OU;Nakagawa T;Rosner M;Van Nostrand JD;Zhou J;Maruyama A;Fisk MR;Giovannoni SJ
  • 通讯作者:
    Giovannoni SJ
BACTERIAL INTEGRON METAGENOME IN MICROBIAL COMMUNITIES INHABIT A DEEP GAS HYDRATE CORE-ANCIENT
微生物群落中的细菌整合子宏基因组栖息于古老的深层天然气水合物核心
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Hosam Easa Elsaied;Yosuke Higashi;Hideyoshi Yoshioka;Keiko Kitamura;Akihiko Maruyama
  • 通讯作者:
    Akihiko Maruyama
カスカディア縁辺域におけるガスハイドレートの分布と地下微生物活動の関係
卡斯卡迪亚边缘地区天然气水合物分布与地下微生物活动的关系
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    吉岡秀佳;中村孝道;東陽介;丸山明彦;坂田将
  • 通讯作者:
    坂田将
インテグロン・ジーンカセットシステムに着目した海洋環境微生物ゲノム解析
以整合子基因盒系统为重点的海洋环境微生物基因组分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Hosam Elsaied;Keiko Kitamura;Akihiko Maruyama
  • 通讯作者:
    Akihiko Maruyama
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