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時間分解赤外分光法を用いた膜蛋白質フォールディング機構の解明

時間分解赤外分光法を用いた膜蛋白質フォールディング機構の解明
使用时间分辨红外光谱阐明膜蛋白折叠机制
批准号:
22870034
负责人:
木村 哲就
金额:
$2.01万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份:
2010
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2010 至 2011

项目摘要

项目成果

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本申請研究は、光開裂・解離性分子をβバレル膜蛋白質OmpAに修飾することで蛋白質構造に大きな摂動を加え、それによって引き起こされた変性状態からのフォールディングを生理的条件に近い温度・pH・塩濃度環境下において追跡することを目的とした。そこで、まずOmpAのβバレル構造ドメインの遺伝子配列をpETベクターに組み込んだプラスミドを作成し、そのプラスミドを形質転換した大腸菌を用いることによって発現を試みた。OmpAのβバレルドメインの発現をSDS-PAGEによって確認した。さらに簡便な精製を目的としてHisタグをC末端側に導入したプラスミドを作成すると同時に、システイン残基を導入した変異体の作製も行った。今後、光解離性分子によるOmpAの修飾を行い、構造を詳細に検討する予定である。一方、フォールディング反応に伴う膜蛋白質の構造変化に関する詳細な情報を得るためには、時間分解赤外差スペクトル分光測定を駆使する予定である。さらには、フォールディングキネティクスの解析には、得られた一連の赤外差スペクトルに対してSVD解析とグローバルフィッティング法を用いて、中間体の構造も含めて検討する必要がある。そこで、αヘリックスから構成される膜蛋白質pHRに関して、その光反応サイクルを実時間観察し、詳細な解析を行うことによって、膜蛋白質構造において起こる変化を追跡することを試みた。その結果、溶媒から隔離されたヘリックスの構造変化が光反応サイクルの後期に起こることがわかった。この予備実験により、よりドラスティックな構造変化であるフォールディング反応を時間分解赤外差スペクトル分光測定によってとらえることができると期待される。
期刊论文(6)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
In vitro protein folding dynamics in the microsecond-to-millisecond timescale
微秒至毫秒时间尺度的体外蛋白质折叠动力学
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: [N. Nakayama, R. Smith, T. Mandel, S. Kimura, A. Boudaud, C. Kuhlemeier, Tetsunari Kimura]
通讯作者: Tetsunari Kimura
時間分解FTIR差スペクトル計測によるファラオニスハロロドプシンの陰イオン輸送過程での構造変化解析
使用时间分辨 FTIR 差异光谱测量分析阴离子传输过程中法老盐视紫红质的结构变化
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: [木村哲就, 神取秀樹, 古谷祐詞]
通讯作者: 古谷祐詞
Conformational changes chloride-ion pumping during the pharaonis halorhodopsin photocycle studied by time-resolved FTIR difference spectroscopy
通过时间分辨傅里叶变换红外光谱法研究法老盐视紫红质光循环过程中氯离子泵送的构象变化
DOI: --
发表时间: 2011
期刊:
影响因子: --
作者: [Tetsunari Kimura, Hideki Kandori, Yuji Furutani]
通讯作者: Yuji Furutani
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: [中山北斗, 木村成介, Tetsunari Kimura]
通讯作者: Tetsunari Kimura
時間分解測定法によるABCトランスポーター膜輸送機構の化学的解明
  • 批准号:
    23K23465
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $2.25万
  • 财政年份:
    2024
  • 负责人:
    木村 哲就
  • 依托单位:
Time-resolved measurements of allocrite transport in ABC transporters
  • 批准号:
    22H02198
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $11.48万
  • 财政年份:
    2022
  • 负责人:
    木村 哲就
  • 依托单位:
圧力効果を利用した蛋白質の折り畳み機構における水分子ダイナミクスの直接観察
  • 批准号:
    05J09383
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $1.41万
  • 财政年份:
    2005
  • 负责人:
    木村 哲就
  • 依托单位:
マイクロ秒分割分光装置を用いた蛋白質の折り畳み機構の解明
  • 批准号:
    03J05176
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $1.15万
  • 财政年份:
    2003
  • 负责人:
    木村 哲就
  • 依托单位:
海外基金