Quality and evolutionary control of RNA virus genome via nonsense mediated mRNA decay
Quality and evolutionary control of RNA virus genome via nonsense mediated mRNA decay
批准号:
22K20759
负责人:
小森園 亮
金额:
$1.83万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2022-08-31 至 2024-03-31
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英文摘要
真核生物が有するNonsense mediated mRNA decayシステム(NMD)は未成熟な終始コドンや異常な高次構造をもつmRNAを認識し、特異的に分解するRNA品質管理機構である。本研究は、このNMDがmRNAと同様に宿主内で複製するウイルス由来RNAを認識し、RNAウイルスの進化を左右する新たな宿主機構であるか検証することを目的としている。本研究では、急性感染性および持続感染性RNAウイルスをNMD因子ノックダウン細胞へ感染させたのち連続継代し、ウイルスゲノムRNAの配列解析を実施することで経時的なウイルス進化の追跡およびNMD因子による進化への干渉を解析している。研究開始後、急性感染性RNAウイルスのモデルとしてコクサッキーウイルスB3(CVB3)を用い、様々な細胞株への感染性を検討した結果、ヒト由来アストロサイト細胞株KINGS-1およびBecker細胞では細胞非傷害性持続感染を成立させることが明らかとなった。このCVB3感染細胞を長期間培養しても高力価で感染性ウイルス粒子を放出していることから、CVB3は急性感染性および持続感染性両者の感染モデルとして解析が可能であった。またCVB3感染細胞にNMD阻害剤を投与した結果、培養上清中のウイルスゲノムRNA量は有意に増加した。さらに、NMD因子ノックダウン細胞へのCVB3の感染性を検討した結果、コントロールと比較し同様に上清中ウイルスゲノムRNA量は増加した。現在、この急性感染性および持続感染性の両モデルを解析可能であるCVB3を用いて経時的な配列解析を行っている。
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会议论文
Product of a human endogenous bornavirus-like element suppresses RNA interference in mammalian cells
人内源性博纳病毒样元件的产物可抑制哺乳动物细胞中的 RNA 干扰
DOI:
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发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ryo Komorizono, Miya Kawanaka, Shima Yoshizumi, Keizo Tomonaga]
通讯作者:
Keizo Tomonaga
Development of an RNA virus-based episomal vector with artificial aptazyme for switching gene expression off
开发基于 RNA 病毒的附加型载体,带有人工适体酶用于关闭基因表达
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ryo Komorizono, Chiaki Tanaka, Shima Yoshizumi, Keizo Tomonaga]
通讯作者:
Keizo Tomonaga
Intranuclear viral RdRp of Borna disease virus 1 interferes with host RNA maturation and metabolism.
博纳病病毒 1 的核内病毒 RdRp 干扰宿主 RNA 成熟和代谢。
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Miina Kaneko, Ryo Komorizono, Akiko Makino, Keizo Tomonaga]
通讯作者:
Keizo Tomonaga
概日リズムに基づいたウイルス感染制御とそのメカニズムの解明
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批准号:24K18451
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2024
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负责人:小森園 亮
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依托单位:
新興ボルナウイルスの宿主域および病原性に関する分子基盤の解明
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批准号:17J07483
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.6万
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财政年份:2017
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负责人:小森園 亮
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依托单位:
海外基金