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Quality and evolutionary control of RNA virus genome via nonsense mediated mRNA decay

通过无义介导的 mRNA 衰减对 RNA 病毒基因组进行质量和进化控制

基本信息

批准号：
22K20759
负责人：
小森園亮
金额：
$ 1.83万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-08-31 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K20759/
关键词：
RNAウイルスウイルス進化 RNA分解

项目摘要

真核生物が有するNonsense mediated mRNA decayシステム(NMD)は未成熟な終始コドンや異常な高次構造をもつmRNAを認識し、特異的に分解するRNA品質管理機構である。本研究は、このNMDがmRNAと同様に宿主内で複製するウイルス由来RNAを認識し、RNAウイルスの進化を左右する新たな宿主機構であるか検証することを目的としている。本研究では、急性感染性および持続感染性RNAウイルスをNMD因子ノックダウン細胞へ感染させたのち連続継代し、ウイルスゲノムRNAの配列解析を実施することで経時的なウイルス進化の追跡およびNMD因子による進化への干渉を解析している。研究開始後、急性感染性RNAウイルスのモデルとしてコクサッキーウイルスB3(CVB3)を用い、様々な細胞株への感染性を検討した結果、ヒト由来アストロサイト細胞株KINGS-1およびBecker細胞では細胞非傷害性持続感染を成立させることが明らかとなった。このCVB3感染細胞を長期間培養しても高力価で感染性ウイルス粒子を放出していることから、CVB3は急性感染性および持続感染性両者の感染モデルとして解析が可能であった。またCVB3感染細胞にNMD阻害剤を投与した結果、培養上清中のウイルスゲノムRNA量は有意に増加した。さらに、NMD因子ノックダウン細胞へのCVB3の感染性を検討した結果、コントロールと比較し同様に上清中ウイルスゲノムRNA量は増加した。現在、この急性感染性および持続感染性の両モデルを解析可能であるCVB3を用いて経時的な配列解析を行っている。

Eukaryotes often have high-level mRNA knowledge and a special decomposable Nonsense mediated mRNA decay quality management system (RNA), which is not mature in eukaryotes. In this study, we use NMD mRNA to copy copies in the host. The reason for this is that RNA information and RNA information are improved. In this study, the new host organization is responsible for the purpose of replication. In this study, the infectious RNA virus was used to detect the NMD factor, and the infected cells were linked to the infection virus. In this study, the acute infectious virus was used in this study. In this study, the acute infectious virus was used in this study. In this study, the acute infectious virus was used in this study. The infectious NMD factor was not detected in this study. After the beginning of the study, the acute infectious RNA infection was confirmed by the non-harmful infection of the cell line KINGS-1, the cell line of the Becker cell line, the cell line of the cell line, the cell line, the cell line of the After long-term incubation of CVB3 infected cells, the particles of high strength infectious bacteria were released, and those with acute infectious diseases of CVB3 were infected. The analysis of the risk of infection was not possible. The CVB3 infection cells were infected with NMD to block the results of the injection and the results, and the supernatant was tested. The RNA was measured intentionally. The results of NMD factor test and CVB3 infection test were compared with those in the supernatant of the same supernatant. RNA was measured and increased. At present, it is possible to analyze the number of lines that may be used in the analysis of acute infectious diseases when CVB3 is used.