光捕集アンテナにおける励起エネルギー移動の分子論的機構の理論的解明
光捕集アンテナにおける励起エネルギー移動の分子論的機構の理論的解明
批准号:
25888020
负责人:
東 雅大
金额:
$1.58万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份:
2013
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2013-08-30 至 2015-03-31
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光合成反応で重要な光捕集アンテナと呼ばれるタンパク質は、内部に含まれる色素で吸収した光エネルギーを励起エネルギー移動(EET)の形で高速・高効率に活性中心に伝達することが知られている。EETの反応速度は励起エネルギーの揺らぎが小さ過ぎても大き過ぎても低下するが、光捕集アンテナではEETの反応速度が最大になるように励起エネルギーの揺らぎが最適化されている。しかし、生体分子の微細な構造や揺らぎがどのように高速・高効率なEETを制御しているか全く明らかになっていない。そこで本研究では、分子レベルで励起エネルギーの揺らぎを解析するために、色素の励起エネルギーを高精度・低コストに計算可能な手法(MMSIC法)を開発した。MMSIC法では、分子力場と修正Shepard内挿法を組み合わせることで、色素の基底状態と励起状態を表すポテンシャル関数を高精度・低コストに生成する。修正Shepard内挿法を色素の構造だけでなく、色素にかかる静電ポテンシャルにも適用することで、周囲の生体分子の揺らぎの影響も取り込む。MMSIC法により必要な量子化学計算の計算コストを大幅に削減し、様々な構造で励起エネルギーを効率的に計算可能となる。このMMSIC法を光捕集アンテナの1つであるFenna-Matthews-Olsonタンパク中の色素バクテリオクロロフィル aに適用した。MMSIC法により励起状態のポテンシャルエネルギーの計算を精度を保ったまま約100万倍加速することに成功しただけでなく、シミュレーションにより得られた励起エネルギーの揺らぎを表すSpectral Densityは実験から得られたものとよく一致した。また、EETダイナミクスに重要なSpectral Densityの低振動数部分がほぼ色素の分子内振動によるものと明らかにした。
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Toward Quantitative Understanding of Excited-State Reaction Dynamics in Solution and Proteins
定量理解溶液和蛋白质中的激发态反应动力学
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[正宗淳, Masahiro Higashi]
通讯作者:
Masahiro Higashi
Theoretical Studies on Excitation Energy Fluctuations of Pigments in a Light-Harvesting Complex
光捕获复合体中颜料激发能量波动的理论研究
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Abolfazl Mehbodniya, Fumiyuki Adachi, Masahiro Higashi]
通讯作者:
Masahiro Higashi
溶液中のバクテリオクロロフィルaの励起状態に関する理論的研究
溶液中细菌叶绿素a激发态的理论研究
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
影响因子:
--
作者:
[東 雅大, 小杉 貴洋, 林 重彦, 斉藤 真司]
通讯作者:
斉藤 真司
Direct Simulations of Excited-State Reactions in Solution and Protein
溶液和蛋白质中激发态反应的直接模拟
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Keisuke Asano,* Yukihiro Fukata, and Seijiro Matsubara*, 関雄太,宮本慎太郎,皆川浩,久田真,早坂洋平, Masahiro Higashi]
通讯作者:
Masahiro Higashi
凝縮相における励起状態反応ダイナミクスの分子論的理解を目指して
旨在从分子角度理解凝聚相中的激发态反应动力学
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ken-ichi Sakaguchi, Takuya Kamimura, Hidemitsu Uno, Shigeki Mori, Shuwa Ozako, Hirofumi Nobukuni, Masatoshi Ishida and Fumito Tani, 東 雅大]
通讯作者:
東 雅大
共 6 条
光合成超分子複合体における光エネルギー伝達ダイナミクスの理論的解明
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批准号:22K05022
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2022
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负责人:東 雅大
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依托单位:
タンパク質内における励起状態反応ダイナミクスの理論的解明
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批准号:11J00238
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.02万
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财政年份:2011
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负责人:東 雅大
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依托单位:
海外基金