Roles of chromatin structure in gene conversion at chicken immunoglobulin locus
Roles of chromatin structure in gene conversion at chicken immunoglobulin locus
批准号:
14580689
负责人:
OHTA Kunihiro
金额:
$2.3万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2002
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2002 至 2003
中文摘要
在鸡B细胞系DT40中,基因转换是一种同源重组,主要是导致免疫球蛋白(Ig)基因的多样化。我们在鸡DT40细胞系中研究了染色质结构在该基因转化调控中的作用。我们发现具有重组活性的Ig基因座表现出更高的组蛋白乙酰化水平。用组蛋白去乙酰酶抑制剂Tricostatin A(TSA)处理DT40细胞,显著诱导基因转换频率和重组活性等位基因的转录活性,但在重组活性等位基因和非活性等位基因中观察到组蛋白乙酰化水平的升高,提示重组激活和转录活性之间存在联系。在转录激活后,部分GFP和CFP序列之间的基因转换事件被诱导,从而在DT40细胞的一小部分中检测到GFP类型的荧光。此外,利用TSA对基因转换的影响,我们开发了一种快速而灵活的系统,利用经历了激活的基因转换的DT40细胞来制备特异性的单抗。该选择系统(adlib:自主多样化文库)可以快速(从多样化文库到一周)建立产生具有足够特异性和亲和力的单抗IgM的各种克隆,并适用于包括合理蛋白质设计在内的各种生物技术。
英文摘要
In the chicken B-cell line DT40, gene conversion, a type of homologous recombination, primarily contributes to diversification of the immunoglobulin (Ig) gene. We have studied roles of chromatin structure in the regulation of this gene conversion in the chicken DT40 cell lines. We found that recombination-active Ig locus exhibits much higher levels of histone acetylation. Treatment of DT40 cells with histone deacetylase inhibitor Tricostatin A (TSA) markedly induced gene conversion frequency and transcriptional activity at recombination-active allele, but observed elevation of histone acetylation levels in both recombination-active and inactive-alleles, suggesting links between recombination activation and transcriotional activity.Using DT40 cells harboring an artificial chromosomal recombination marker including partial GFP sequence, complete CFP sequence combined with inducible Tet promoter, 3' enhancer, and a matrix attachment region sequence, we further examined relationship between transcriptional activity and gene conversion frequency. After transcriptional activation, gene conversion events between partial GFP and CFP sequences were induced; thereby generating GFP-type fluorescence was detected in a small portion of the DT40 cells. Thus, it is suggested that gene conversion may be activated coupled to some transcription-related mechanisms.In addition, using the effects by TSA on gene conversion, we developed a rapid and flexible system to produce specific monoclonal antibodies using the DT40 cells undergoing activated gene conversion. The selection system (ADLib: Autonomously Diversifying Library) enables quick establishment (〜one week from a diversifying library) of various clones producing monoclonal IgMs with enough specificity and affinity for immunological assays, and is applicable to various biotechnologies including rational protein design.
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Yamada T. et al.: "Roles of histone acetylation and chromatin remodeling factor in a meiotic recombination hotspot"EMBO J.. 印刷中. (2004)
Yamada T. 等人:“组蛋白乙酰化和染色质重塑因子在减数分裂重组热点中的作用”EMBO J.. 已出版(2004 年)。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
DOI:
10.1038/nbt1092
发表时间:
2005-06-01
期刊:
NATURE BIOTECHNOLOGY
影响因子:
46.9
作者:
[Seo, H, Masuoka, M, Ohta, K]
通讯作者:
Ohta, K
Roles of histone acetylation and chromatin remodeling factor in a meiotic recombination hotspot.
组蛋白乙酰化和染色质重塑因子在减数分裂重组热点中的作用。
DOI:
10.1038/sj.emboj.7600138
发表时间:
2004
期刊:
The EMBO journal
影响因子:
--
作者:
[Yamada,Takatomi, Mizuno,Ken-ichi, Hirota,Kouji, Kon,Ning, Wahls,WayneP, Hartsuiker,Edgar, Murofushi,Hiromu, Shibata,Takehiko, Ohta,Kunihiro]
通讯作者:
Ohta,Kunihiro
Fission yeast global repressors regulate the specificity of chromatin alteration in response to distinct environment stresses
裂殖酵母全局抑制因子调节染色质改变的特异性以响应不同的环境压力
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Nucleic Acids Research 32
影响因子:
--
作者:
[Seo H.et al., Ymada T. et al., Hirota K. et al.]
通讯作者:
Hirota K. et al.
Tomita K. et al.: "Competition between the Rad50 complex and the Ku heterodimer reveals a role for Exo1 in processing double-strand break, but not telomeres"Mol.Cell.Biol. 23. 5186-5197 (2003)
Tomita K. 等人:“Rad50 复合体和 Ku 异二聚体之间的竞争揭示了 Exo1 在处理双链断裂中的作用,但不是端粒”Mol.Cell.Biol。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 23 条
Control of phenotypic plasticity in armed hone beatle.
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批准号:15K14443
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2015
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负责人:OHTA Kunihiro
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依托单位:
Chromatin regulation by lncRNA
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批准号:21241046
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$29.2万
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财政年份:2009
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负责人:OHTA Kunihiro
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依托单位:
Chromatin regulation around M26/CRE DNA sequences
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批准号:19570008
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2007
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负责人:OHTA Kunihiro
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依托单位:
Interplay among recombination, replication, segregation, and chromatin structure.
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批准号:17080011
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$41.41万
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财政年份:2005
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负责人:OHTA Kunihiro
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依托单位:
Regulation of chromatin remodeling at meiotic recombination initiation sites
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批准号:11680712
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.73万
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财政年份:1999
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负责人:OHTA Kunihiro
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依托单位:
国内基金
海外基金
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利用CRISPR内源性激活Atoh1转录促进前庭毛细胞再生和功能重建
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批准号:82371145
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项目类别:面上项目
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资助金额:46.00万元
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批准年份:2023
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负责人:陶永
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依托单位:
转录因子BCL6抑制ICOSL表达优化生发中心反应的机制研究
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批准号:82371745
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项目类别:面上项目
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资助金额:49.00万元
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批准年份:2023
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负责人:张文倩
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依托单位:
转录因子LEF1低表达抑制HMGB1致子宫腺肌病患者子宫内膜容受性低下的分子机制
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批准号:82371704
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项目类别:面上项目
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资助金额:49.00万元
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批准年份:2023
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负责人:徐步芳
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依托单位:
小鼠肺腺鳞癌转分化类器官模型的建立及表观调控分子机制研究
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批准号:32100593
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项目类别:青年科学基金项目(C类)
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资助金额:30.0万元
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批准年份:2021
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负责人:童欣媛
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依托单位:
NFATc3转录调控MMP14介导少突胶质细胞瘤血管新生促肿瘤恶变的机制研究
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批准号:32100563
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项目类别:青年科学基金项目(C类)
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资助金额:30.0万元
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批准年份:2021
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负责人:齐琳
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依托单位:
KLF5诱导小鼠始发态多能性干细胞向滋养层干细胞转变的作用与机制研究
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批准号:32100596
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项目类别:青年科学基金项目(C类)
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资助金额:30.0万元
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批准年份:2021
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负责人:黄颖华
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依托单位:
锌指蛋白ZBTB17调控成纤维细胞衰老的机制研究
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批准号:32000509
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:24.0万元
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批准年份:2020
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负责人:马兴杰
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依托单位:
细胞衰老抑制直接重编程及心肌再生修复的分子机理研究
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批准号:92068107
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项目类别:重大研究计划
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资助金额:79.0万元
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批准年份:2020
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负责人:王丽
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依托单位:
转录因子SALL4通过影响pre-mRNA可变剪接调控非Yamanaka因子体细胞重编程的机制研究
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批准号:32000502
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:24.0万元
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批准年份:2020
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负责人:王波
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依托单位:
DNA糖苷酶OGG1调节PARP1介导的EB病毒潜伏蛋白表达的机制研究
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批准号:32000546
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:24.0万元
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批准年份:2020
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负责人:郝文静
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依托单位: