小児悪性腫瘍における発現遺伝子の網羅的解析と治療および診断に有用な分子標的の同定

综合分析儿童恶性肿瘤的表达基因并鉴定有助于治疗和诊断的分子靶点

• 批准号: 17591119
• 负责人: 永田 俊人
• 金额: $ 1.02万
• 依托单位: Nihon University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2006
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17591119/
• 关键词: 小児; 固形腫瘍; 腎横紋筋肉腫様腫瘍; マイクロアレイ法; 網羅的遺伝子発現解析; 遺伝子コピー数; 分子プロファイル; トランスレイショナル・スタデイ

私共はこれまでの研究において、Differential display法やマイクロアレイ法を用いて、神経芽腫や肝芽腫の臨床的及び生物学的特徴に関連した、多くの遺伝子群を同定した。また、マイクロアレイ法によって得られた遺伝子発現プロファイルから、生物学的及び臨床的に信頼性の高い情報を抽出するためには、統計学的解析法と教師付き学習法や教師なし学習法などのアルゴリズムを併用するのが、有効な方法の一つである事を示した。現在私共は、ゲノム情報を用いた遣伝子発現解析手法と癌の染色体解析手法とを併用して、発生頻度が低いためにあまり研究されていない腎横紋筋肉腫様腫瘍の分子プロファイルの解析を行っている。私共が平成17年度よりおこなった研究では、腎横紋筋肉腫様腫瘍における生物学的特徴の解析や、診断及び治療に役立つと思われる遺伝子を同定するため、先の研究で明らかになった腎横紋筋肉腫様腫瘍組織の中で発現異常を示す遺伝子群のうち、遣伝子コピー数の異常を示す遺伝子群の探索を試みた。腫瘍組織内で発現変動が比較的大きな4遺伝子(CRABP2,DDR2,MMP7,IL1R1)を選択し、各遺伝子の腫瘍細胞内における遺伝子コピー数の異常を、各染色体領域に対するbacterial artificial chromosome clones (BAC)を用いたfluorescence in situ hybridization法により検討した。その結果発現変化が見られた遺伝子群のうち、今回検討しえたCRABP2,DDR2,MMP7,IL1R1の4遺伝子については、遺伝子コピー数の腫瘍細胞内における異常は見られなかった。本研究により、先の研究で明らかになった腎横紋筋肉腫様腫瘍におけるCRABP2,DDR2,MMP7,IL1R1の発現異常は、腫瘍細胞内における遺伝子コピー数の異常によるものではないと考えられた。今後は本腫瘍における発現変動を示す遺伝子のうち、遺伝子コピー数の異常を示す遺伝子群を網羅的に探索する事により、本腫瘍における生物学的特徴の解析や、診断及び治療に役立つと思われる遺伝子群の同定が可能になると思われる。

In this study, Differential display methods were used to determine the correlation between clinical and biological characteristics of neuroblastoma and hepatoma, and multiple genetic subgroups were identified. This paper describes the use of statistical analysis methods and teacher-learning methods to extract information from biological and clinical information. Now, private and public information must be used to combine genetic discovery analysis methods with cancer chromosome analysis methods, and the frequency of occurrence is low. We are also studying the molecular analysis of kidney striated muscle tumors. In 2007, the study was conducted to analyze the biological characteristics of renal striated muscle tumors, diagnose and treat them, and to determine the genetic parameters of renal striated muscle tumors. The four genes (CRABP2,DDR2, MMP7, IL1R1) were selected from tumor tissues, the number of genes in tumor cells of each gene was abnormal, and the bacterial artificial chromosome clones (BAC) in each chromosome domain were detected by fluorescence in situ hybridization method. The results showed that the changes occurred in the number of tumor cells and the abnormal changes occurred in the number of tumor cells. In this study, we investigated the abnormal expression of CRABP2,DDR2,MMP7,IL1R1 in renal striated muscle tumors. In the future, we will explore the biological characteristics, diagnosis and treatment of this disease, and we will consider the possibility of identifying the genetic group.