What does microaerophilic mean?

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Symbiobacterium属に近縁で、現在の分類体系でBacillota門Clostridia科に含められている’Caldinitratiruptor microaerophilus’ JCM16183株のPacBioを用いた全ゲノム解読を実施した。その結果、環状の3.6 Mb完全長の解読に成功した。それによって、予想通り、高いGC含量（71%）を示すとともに、シトクロムオキシダーゼの全てのドメインをコードする遺伝子を保有していることを明らかにした。一方、キノールオキシダーゼをコードする遺伝子は存在しなかった。また、カタラーゼに相同性を示すタンパク質をコードする遺伝子も保有していないことが判明した。本菌を嫌気条件で培養した菌体を用いた酸素消費活性検定では、低レベルながら電子供与体TMPDの添加によって酸素の消費が観測され、それがアジ化ナトリウムの添加で抑制されることが見いだされた。また、同菌体から超音波破砕と超遠心によって調製した膜画分を用いた検定によって、主要なヘムがbタイプであることが確認された。微好気性を示す高温細菌の探索では、蛎殻を分離源としてC. microaerophilusの培養に用いる最小培地を用いたスクリーニングを実施した。その結果、好気条件に比べて微好気条件での増殖度が高い菌株が複数得られた。16S rRNA遺伝子配列に基づいた系統解析によって、それらはいずれもAnoxybacillus属に属する細菌株であることが明らかになった。これらの株は植え継ぎを繰り返すことで、微好気条件での増殖度が顕著に低下し、逆に好気条件で良好な増殖を示すようになった。この現象は、同属の分離株において過去にも類似の報告があった。