Sequenzbasierte Analyse der Regulation und Interaktion von imprinteten Genen

基于序列的印记基因调控和相互作用分析

• 批准号: 46691177
• 负责人: Privatdozentin Dr.-Ing. Martina Paulsen
• 金额: --
• 依托单位: Arbeitsgruppe Genetik / Epigenetik
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2006-12-31 至 2010-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/46691177?language=en
• 关键词: Sequenzbasierte; Analyse; der; Regulation; und

Elterlich geprägte Gene sind in Säugetieren an verschiedenen Entwicklungsprozessen beteiligt. Viele dieser Gene sind in der Plazenta oder im Gehirn exprimiert, ihre Hauptaufgaben scheinen in der Regulation von embryonalem Wachstum und in neuronalen Funktionen zu liegen. Im Rahmen des Projekts sollen die Produkte elterlich geprägter Gene anhand von DNA-Sequenzmerkmalen, Genexpressionsmustern und Analyse der Proteininteraktionen in Regulations- und Proteinnetzwerke eingebunden werden. Zur Charakterisierung der Regulationsnetzwerke sollen CpG-Inseln und konservierte Elemente geprägter Gene auf typische Sequenzmotive, insbesondere auf Bindestellen bekannter Transkriptionsfaktoren, untersucht werden. Eine Einbeziehung der Expressionsmuster sowohl der elterlich geprägten Gene als auch der potentiell regulierenden Transkriptionsfaktoren soll die Identifikation von relevanten Regulationselementen und daran bindenden Proteinfaktoren erleichtern. Zur Einbindung in Proteinnetzwerke sollen aus Interaktionsdatenbanken Proteine zusammengestellt werden, die mit den geprägten Genprodukten eine direkte Interaktion eingehen oder in einem funktionellen Zusammenhang stehen, also z.B. in denselben Stoffwechselwegen agieren. Relevante Interaktionspartner sollten zudem einer ähnlichen gewebespezifischen Regulation unterliegen. Insgesamt beabsichtigen wir in diesem Projekt eine erstmalige umfassende Charakterisierung der elterlichen Prägung auf genomischer und proteomischer Ebene.

其他基因也在快速发展。许多基因存在于胎盘或胚胎发育过程中，它们在胚胎发育和神经功能的调节中起着重要作用。本文介绍了一种新的蛋白质互作的基因测序、基因表达谱分析和蛋白质网络韦尔登的方法。调节基因的特点是依赖于CpG-Inseln和保守的基因表达，依赖于结合位点的转录因子，这韦尔登。一种表达调控基因的表达调控机制也可能通过识别相关的调控基因和结合蛋白质来调控转录因子。在蛋白质网络中，只有通过数据库间的蛋白质连接才能获得韦尔登，通过直接的遗传产品连接或功能性连接才能获得蛋白质，也就是Z.B. in denselben Stoffwechselwegen agieren. Relevante Interaktionspartner sollten zudem einer ahnlichen gewebespezifischen Regulation unterliegen.在这个项目中，我们需要一个基因组和蛋白质组的其他遗传学特征。