植物ケツムDNA上に存在するtRNAと相同性を持つ反復配列の解析

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本研究代表者らがタバコの染色体DNAよりクローニングした反復配列はtRNA相同領域、tRNA非相同領域、TTGの繰返しという3つの領域からなっていた。この構造は、これまでに動物で見いだされているSINEの構造と極めて類似しており、これからこの反復配列が植物におけるSINEであることが明らかとなった。本研究代表者らはこのSINEをTS配列と名付けた。また、tRNAにおいて保存されている塩基が、TS配列のtRNA相同領域にも保存されていたことより、TS配列がtRNAを起源としていることが強く示唆された。この結果より、tRNAと相同性を持つSINEが動物のみならず、植物にも存在することが示された。TS配列はtRNA相同領域内にRNAポリメラーゼIIIで転写されるプロモータの共通配列と類似の配列を含んでいたが、実際TS配列はin vitroにおいてRNAポリメラーゼIIIによって転写された。TS配列は調べた限りのナス科植物の染色体上に存在していたが、さらにナス科以外の植物について調べたところ、TS配列はヒルガオ科の植物であるアサガオの染色体DNA上にも存在していた。このことから、TS配列はナス科、ヒルガオ科が属する管状花植物に広く存在するものと考えられた。次にデータベースを検索したところ、すでに報告されているいくつかのナス科植物の塩基配列中にTS配列が含まれていた。これらのTS配列の塩基配列と本研究代表者らがタバコ染色体よりクローニングしたTS配列の塩基配列とを比較したところ、TS配列は少なくとも2つのサブグループにわけられた。それぞれのサブグループの塩基配列のdivergencyが異なることから、それぞれのサブグループはそれぞれ異なる時期に増幅したと考えられる。さらに、一方のサブグループはtRNA相同領域を欠失しているという特徴をもっていた。