口腔癌関連遺伝子の同定に向けた全ゲノムにおける欠失領域の解析

分析全基因组中的缺失区域以识别口腔癌相关基因

• 批准号: 14571900
• 负责人: 栢原 浩彰
• 金额: $ 1.79万
• 依托单位: Ehime University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14571900/
• 关键词: 口腔癌; 扁平上皮癌; 癌抑制遺伝子; マイクロサテライトマーカー

口腔扁平上皮癌の原因遺伝子の候補領域を探索するため、口腔扁平上皮癌細胞株を用いて、全染色体領域でのhomozygous deletionの解析を行った。本研究には、ABIのPRISM Linkage Mapping Setsのマイクロサテライト多型マーカーを使用し、解析機器としてABI PRISM 3100 Genetic Analyzerを用いた。6種類の口腔扁平上皮癌細胞株とコントロールとしてヒト末梢血からDNAを抽出した。HSC-2で最も多くのhomozygous deletionを認め、811種類のマイクロサテライト多型マーカーのうち56個、6.9%で欠失を認めた。また、最も少なかったのはOSC-2の23個、2.8%であり、6種類の細胞株でのhomozygous deletionの平均は38.1個、4.7%であった。これらの解析結果より、高頻度にhomozygous deletionを示したマイクロサテライト多型マーカー(D6S292、D10S192、D18S68)については、対象細胞株をさらに6種類追加して同様に解析を行なった。D6S292(6q23.2)では12細胞株のうち4個、D10S192(10q24.32)では3個、またD18S68(18q22.1)では5個にhomozygous deletionを認めた。これらの座位については、口腔扁平上皮癌の原因となる癌抑制遺伝子が近傍に位置すると考えられ詳細に検討した。3つのマーカーに近接する既知遺伝子の欠失について検討したが、口腔扁平上皮癌細胞株においてhomozygous deletionは認めなかった。しかし、第6、第10、第18染色体上には口腔癌に関連する未知の遺伝子が存在する可能性があると考えられた。

The etiological causes of oral squamous cell carcinoma remain in the 伝 sub-<s:1> candidate field を exploration するため, oral squamous cell carcinoma cell line を use を て て, complete chromosome field で <s:1> homozygous deletion analysis を line った. This study に は, ABI の PRISM Linkage Mapping Sets の マ イ ク ロ サ テ ラ イ ト polymorphism マ ー カ ー を use し, parsing, machine と し て ABI PRISM 3100 based Analyzer を with い た. Peripheral blood てヒト ら らDNAを was extracted from 6 types of localized oral squamous cell carcinoma cell lines, and <s:1> た た トロ トロ <s:1> と てヒト てヒト てヒト た た た. HSC - 2 で more than most も く の homozygous deletion を confess め, 811 species の マ イ ク ロ サ テ ラ イ ト polymorphism マ ー カ ー の う ち 56, 6.9% で owe lost を め た. ま た, less the も な か っ た の は OSC - 2 の 23, 2.8% で あ り, 6 species の cell lines で の homozygous deletion の は 38.1, an average of 4.7% で あ っ た. Analytical results よ こ れ ら の り, high frequency に homozygous deletion を shown し た マ イ ク ロ サ テ ラ イ ト polymorphism マ ー カ ー (D6S292 D10S192 D18S68) に つ い て は, like cell lines を seaborne さ ら に 6 kinds additional し て with others in line analytical を に な っ た. D6S292(6q23.2)で で 12 cell line うち うち4, D10S192(10q24.32)で <e:1> 3, またD18S68(18q22.1)で <e:1> 5 にhomozygous deletionを identification めた. こ れ ら の seat に つ い て は, oral squamous cell carcinoma の reason と な る cancer inhibition of heritage 伝 が nearly alongside に location す る と exam え ら れ detailed に beg し 検 た. 3 つ の マ ー カ ー に nearly meet す る already know legacy 伝 の owe son lost に つ い て beg し 検 た が, oral squamous cell cancer cells に お い て homozygous deletion は recognize め な か っ た. し か し, 6, 10, 18 chromosome に は oral cancer に masato even す る unknown の heritage 伝 son が exist す る possibility が あ る と exam え ら れ た.