海綿由来の超異常ポリペプチドpolytheonamide類の活性発現機序
海绵源超异常多肽聚酰胺的活性表达机制
基本信息
- 批准号:06240211
- 负责人:
- 金额:$ 1.41万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:1994
- 资助国家:日本
- 起止时间:1994 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
八丈島産海綿Theonella swinhoei(30kg)から,溶媒分画,ゲル濾過,および逆相HPLCなどを用いてpolytheonamideA,B,およびCをそれぞれ50mg,70mg,および20mg単離した.まず,polytheonamide B中のアミノ酸残基の立体化学を調べた.すなわち,polytheonamide Bを4NHCl/EtOH中で部分加水分解後,逆相HPLCでフラグメントペプチドを分取した.得られた120のフラクションそれぞれについて,FAB-MS/MSを測定し,含まれるフラグメントペプチドの組成ならびに配列を調べた.次に,このうち9個の画分を用いて,構成アミノ酸の立体化学を決定した.第一に,ダンシル化した後に加水分解し,得られたダンシルアミノ酸をキラルカラムを用いるHPLCで分析し,N末端アミノ酸の立体化学を決定した.第二に,N末端から2番目のアミノ酸残基の立体化学を,エドマン分解でN末端のアミノ酸を除いた後に同様の手法を用いて決定した.さらに,フラグメントペプチドの完全加水分解物をMarfey試薬で誘導体化後,HPLC分析に付し,構成アミノ酸の立体化学を明らかにした.この結果,立体化学が不明であった28残基のうち20残基の立体化学を決定できた.また,立体化学が未決定の異常アミノ酸のうち,β-methylglutamic acidの4種の異性体を合成した.一方,polytheonamide BのCDCl_3/CD_3OHでのNMRデータをもとにして,ディスタンスジオメトリー計算を行った.立体化学が未決定のアミノ酸残基については,ペプチド鎖全般についてD型とL型のアミノ酸が交互に存在するものと仮定した.計算の結果,polytheonamide Bは予想されたとおり6-7残基で1回転する螺旋型のコンフォメーションをとることが判明した.なお,立体化学が未決定の残基の1つのDLを逆転させると,NMRデータを満足するコンフォメーションを導くことができなかった.
The sponge Theonella is produced on Hachijo Island Swinhoei (30 kg) か ら, solvent, ゲ ル filtration, お よ び reverse phase HPLC な ど を with い て polytheonamideA, B, お よ び C を そ れ ぞ れ 50 mg, 70 mg, お よ び 20 mg 単 from し た. ま ず, polytheonamide B の ア ミ ノ acid residues の stereochemistry を adjustable べ た. す な わ ち, polytheonamide を NHCL 4 B/EtOH で after partial hydrolysis, reverse phase HPLC で フ ラ グ メ ン ト ペ プ チ ド を divide し た. Have ら れ た 120 の フ ラ ク シ ョ ン そ れ ぞ れ に つ い て, FAB -ms/MS determination of を し, including ま れ る フ ラ グ メ ン ト ペ プ チ ド の composition な ら び に match column を adjustable べ た. Then に, <s:1> うち うち9 <s:1> are divided into を by に て to form ア, ノ acid <s:1> stereochemistry を to determine た. First に ダ ン シ ル change し た し に after adding water decomposition, to ら れ た ダ ン シ ル ア ミ ノ acid を キ ラ ル カ ラ ム を with い る HPLC analysis で し, N terminal ア ミ ノ acid の stereochemistry を decided し た. Second に, N terminal か ら 2's の ア ミ ノ acid residues の stereochemistry を, エ ド マ ン decomposition で N terminal の ア ミ ノ acid を except い た に with others after の gimmick を with い て decided し た. さ ら に, フ ラ グ メ ン ト ペ プ チ ド の completely water decomposition を Marfey try 薬 で after the inductor, HPLC analysis に pay し, constitute ア ミ ノ acid の stereochemistry を Ming ら か に し た. こ の results, stereochemistry が unknown で あ っ た 28 residues の う ち 20 residues の stereochemistry を decided で き た. ま た, stereochemistry が pending の abnormal ア ミ ノ acid の う ち, beta methylglutamic acid の four の straight body を synthetic し た. Side, polytheonamide B の CDCl_3 / CD_3OH で の NMR デ ー タ を も と に し て, デ ィ ス タ ン ス ジ オ メ ト リ ー count を っ た. Stereochemistry が pending の ア ミ ノ acid residues に つ い て は, ペ プ チ ド lock all に つ い て type D と L の ア ミ ノ acid が exist interactive に す る も の と 仮 set し た. Calculate the <s:1> result,polytheonamide B は to think さ れ た と お り 6-7 residue で 1 back planning す る spiral の コ ン フ ォ メ ー シ ョ ン を と る こ と が.at し た. な お, stereochemistry が pending の residues の 1 つ の DL を inverse planning さ せ る と, NMR デ ー タ を against foot す る コ ン フ ォ メ ー シ ョ ン を guide く こ と が で き な か っ た.
项目成果
期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
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专利数量(0)
Toshiyuki Hamada et al.: "Polytheonamides,Unprecedented Highly Cytotoxic Polypeptides,from the Marine Sponge Theonella swinhoei 2.Structure Elucidation" Tetrahedron Letters. 35. 609-612 (1994)
Toshiyuki Hamada 等人:“Polytheonamides,前所未有的高细胞毒性多肽,来自海洋海绵 Theonella swinhoei 2. 结构阐明”四面体快报。
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Toshiyuki Hamada et al.: "Polytheonamides,Unprecedented Highly Cytotoxic Polypeptides,from the Marine Sponge Theonella swinhoei 1.Isolation and Component Amino Acids" Tetrahedron Letters. 35. 719-720 (1994)
Toshiyuki Hamada 等人:“聚神酰胺,前所未有的高细胞毒性多肽,来自海洋海绵 Theonella swinhoei 1. 氨基酸的分离和组成”四面体快报。
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Toshiyuki Hamada,et al.: "PolytheonamidesA-C,highly cytotoxic polypeptides from the marine sponge Theonella swinhoei" Sponges in Time and Space,Baikema,Rotterdam. 453-457 (1994)
Toshiyuki Hamada 等人:“PolytheonamidesA-C,来自海洋海绵 Theonella swinhoei 的高细胞毒性多肽”《时空海绵》,Baikema,鹿特丹。
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伏谷 伸宏其他文献
Drugs from the sea
- DOI:
10.1159/isbn.978-3-318-00599-8 - 发表时间:
2000-09 - 期刊:
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伏谷 伸宏 - 通讯作者:
伏谷 伸宏
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