キャピラリーアレイ電気泳動によるがんの高性能遺伝子診断システムの開発

利用毛细管阵列电泳开发高性能癌症基因诊断系统

• 批准号: 06282262
• 负责人: 馬場 嘉信
• 金额: $ 2.62万
• 依托单位: Kobe Pharmaceutical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1994
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1994 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-06282262/
• 关键词: キャピラリー電気泳動; キャピラリーアレイ電気泳動; SSCP; PCR; がん; 遺伝子診断; レーザー蛍光検出

本研究においては、キャピラリー電気泳動とレーザー蛍光検出装置とを組み合わせた、新規DNA解析法であるCE‐LIFシステムを開発した。さらに、このシステムとF‐SSCPを有機的に結合した高性能遺伝子診断システムを開発し、このシステムが、がん遺伝子およびがん抑制遺伝子に存在する変異および多型を高い感度で検出できることを実証した。また、キャピラリーアレイ電気泳動(CAE)開発に関する基本的検討を行った。1.昨年度開発したキャピラリー電気泳動-レーザー蛍光検出システム(CE‐LIF)を用いて、F‐SSCP解析を行った。2.がん遺伝子あるいはがん抑制遺伝子の変異および多型を検出するための最適条件を検討した。その結果、100塩基程度のDNAであれば30分で変異を検出することに成功した。また、異なる種類の蛍光試薬がDNAの泳動挙動に与える影響を調べた。以上の検討によりCE‐LIFとF‐SSCPを結合し、CE‐LIFの迅速さ、高感度さとF‐SSCPの簡便さを兼ね添えたがんの高性能遺伝子診断システムを開発した。3.キャピラリーアレイ電気泳動(CAE)を開発するために必要な、装置の基本的設計とゲル充填キャピラリーの大量調製法の開発を行い、来年度以降におけるCAEシステム開発のための基本的検討を行った。これらの成果は、がんの遺伝子診断を高速化・高精度化する上で重要な貢献をなすものである。以上の研究成果を基礎に、F‐SSCPとCE‐LIFを有機的に結合した新しいがんの遺伝子診断システムをさらに高速化・高精度化するための実験条件の検討を行う。さらに、このシステムを発展させて、多数のがん遺伝子・がん抑制遺伝子を同時に解析できるCAEシステムを開発し、F‐SSCPと組み合わせ多数の遺伝子の多型を同時に検出できる超高速遺伝子診断システムを確立するための基礎実験を行う。

In this study, we developed a new method for DNA analysis. In addition, the F-SSCP is an organic combination of high-performance gene diagnosis system development, gene diagnosis, and gene suppression. The basic model for CAE development is discussed. 1. Yesterday's launch of the first phase of the electrical activity-light detection system (CE-LIF), F-SSCP analysis 2. The optimal conditions for the detection of genetic diversity and polymorphism are discussed. As a result, we were able to detect 30-point differences in 100-base DNA. Different species of DNA can be used to modulate DNA migration. The CE-LIF and F-SSCP systems described above are developed for rapid, highly sensitive, and simple diagnosis. 3. The basic design of the device and the development of a large number of modulation methods for filling in the field are necessary for the development of CAE (Electrophoresis). The results of this study are important for speeding up and improving the accuracy of genetic diagnosis. Based on the above research results, F-SSCP and CE-LIF are organically combined to improve the speed and accuracy of gene diagnosis system. In addition, the system development, simultaneous analysis of most of the genes, suppression genes, CAE system development, F-SSCP and group integration of most of the gene polymorphisms, simultaneous detection, ultra-high-speed gene diagnosis system establishment, basic implementation.

项目成果

馬場嘉信: "キャピラリー電気泳動によるPCR生成物解析とDNAシークエンシングヒト・ゲノム解析計画の実現に向けて" Dojin News. 71. 8-14 (1994)

马场义信：“以毛细管电泳为基础的PCR产物分析和DNA测序，以实现人类基因组分析计划”同人新闻71. 8-14 (1994)。

馬場嘉信: "キャピラリー電気泳動;医薬品および生体成分の次世代高性能解析技術" Pharm Tech Japan. 10. 987-996 (1994)

Yoshinobu Baba：“毛细管电泳；药物和生物成分的下一代高性能分析技术”Pharm Tech Japan。10. 987-996 (1994)。

C.Sumita: "Comparative Study of Capillary Gel Electrophoresis,and Capillary Electrophoresis in Polymer Solutions in the Separation of DNA Restriction Fragments" J.Chromatogr.661. 297-303 (1994)

C.Sumita：“毛细管凝胶电泳和聚合物溶液中毛细管电泳分离 DNA 限制性片段的比较研究”J.Chromatogr.661。

M.Iizuka: "Mapping of 28(CA)n Microsatellite Repeats and 13 Alu Markers on Human Chromosome 11 Using a Panel of Somatic Cell Hybrids" Genomics. 19. 581-584 (1994)

M.Iizuka：“使用体细胞杂交组绘制人类 11 号染色体上的 28(CA)n 微卫星重复序列和 13 个 Alu 标记”基因组学。

Y.Baba: "Three-Dimensional Electropherogram for the Separation of DNA Restriction Fragments Using Capillary Gel Electrophoresis with a Photodiode Array Detector" J.Liq.Chromatogr.(発表予定).

Y.Baba：“使用光电二极管阵列检测器的毛细管凝胶电泳分离 DNA 限制性片段的三维电泳图”J.Liq.Chromatogr。