RNA聚合酶中金属周围的局部结构和功能-猫眼课题宝

RNA聚合酶中金属周围的局部结构和功能

批准号：

08249243

负责人：

石浜明

金额：

$1.15万

依托单位：

National Institute of Genetics

依托单位国家：

日本

项目类别：

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

财政年份：

1996

资助国家：

日本

项目状态：

已结题

起止时间：

1996 至 --

来源：

https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-08249243/

关键词：

RNAポリメラーゼ転写因子転写シグナル生体金属鉄 DNA-蛋白質相互作用蛋白質-蛋白質相互作用転写制御

项目摘要

项目成果

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RNAポリメラーゼは、転写調節蛋白因子や、DNAの調節シグナルと相互作用をすることによって、転写対象の遺伝子の選択認識特性を変える。遺伝解析によって我々は、大腸菌RNAポリメラーゼ上に、各種の転写因子やDNA調節シグナルとの接点のマッピングを行った。蛋白-蛋白、蛋白-DNA接触の接点が示唆されたが、変異にともなう間接的影響を排除できない。そこで、分子間接触の直接的証明を得る目的で、Fe-BABE(p-Bromoacetamidobenzyl-EDTA)をシステイン残基特異的に導入し、還元剤添加によって鉄原子から発生したラジカルによる、至近距離の蛋白質や核酸の主鎖切断点を同定することによって、接触点を決定する試みを実施した。クラス1転写因子、DNAエンハンサーの接点が推定されていたアルファサブユニットC端ドメインの1個所にだけFe-BABEを結合させ、修飾サブユニットからRNAポリメラーゼを再構成して、DNAとの相互作用を調べたところ、先にエンハンサーと推定していた場所だけが、切断を受け、アルファサブニットのDNA上の接点が同定できた。しかも、2分子のアルファサブユニットの一方にだけFe-BABEを導入する、画期的方策を確立し、それぞれのアルファサブユニットのDNA上の接点を別々に同定することが出来た。本研究のよって、転写制御の分子機構の新たな突破口を切り開くことが出来た。

期刊论文(38)

专著(0)

科研奖励(0)

会议论文

Jishage,M.: "Variation in RNA polymerase sigma subunit composition within different stocks Escherichiacoli strain W3110." J.Bacteriol.179・3. 959-963 (1997)

Jishage, M.：“不同种大肠杆菌菌株 W3110 中 RNA 聚合酶 sigma 亚基组成的变化。J.Bacteriol.179·3 (1997)”

DOI： --

发表时间：

期刊：

影响因子： --

作者：

[]

通讯作者：

Imamura,R.: "Identification of the cdpA gene encoding cyclic 3′,5′-adenosine phosophate phosphodiesterase in Escherichiacoli." J.Biol.Chem.271・41. 25423-25429 (1996)

Imamura, R.：“大肠杆菌中编码环状 3,5-腺苷磷酸二酯酶的 cdpA 基因的鉴定。J.Biol.Chem.271·41 (1996)。

DOI： --

发表时间：

期刊：

影响因子： --

作者：

[]

通讯作者：

Negre,D.: "DNA flexibility of the UP element is a major determinant for transcriptional activation at the Escherichiacoli aoetate promoter." Nucleic Acids Res.25・4. 713-718 (1997)

Negre, D.：“UP 元件的 DNA 灵活性是大肠杆菌 aoetate 启动子转录激活的主要决定因素。” 核酸研究 25・4 (1997)。

DOI： --

发表时间：

期刊：

影响因子： --

作者：

[]

通讯作者：

Belyaeva,T.: "Location of the C-terminal domain of the RNA polymerase alpha subunit in diggerent open complexes at the Escherichiacoli galactose operon regulatory region." Nucleic Acids Res.24・12. 2243-2251 (1996)

Belyaeva, T.：“大肠杆菌半乳糖操纵子调控区挖掘复合物中 RNA 聚合酶 α 亚基的 C 末端结构域的位置。” 核酸研究 24·12 (1996)。

DOI： --

发表时间：

期刊：

影响因子： --

作者：

[]

通讯作者：

Eichenberger,P.: "The influence of the location of the activator binding site on the geometry of a transcriptional activation the geometry of a transcriptional activation complex in Eschericiacoli." Biochemistry. 35・48. 15302-15312 (1996)

Eichenberger, P.：“生物化学中激活剂结合位点的位置对转录激活复合物的几何形状的影响”，15302-15312。

DOI： --

发表时间：

期刊：

影响因子： --

作者：

[]

通讯作者：

共 19 条

金属応答の遺伝子制御機構の解明

批准号：

12147209
项目类别：

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
资助金额：

$28.35万
财政年份：

2003
负责人：

石浜明
依托单位：

Nippon Institute for Biological Science (2002-2004)National Institute of Genetics (2000-2001)