フォトンファクトリーにおける生物マシーナリー研究のためのより効率的な放射光利用法

在光子工厂中更有效地利用同步加速器辐射进行生物机械研究

• 批准号: 11169241
• 负责人: 鈴木 守
• 金额: $ 40.64万
• 依托单位: The High Energy Accelerator Research Organization
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1999
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1999 至 2003
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-11169241/
• 关键词: タンパク質結晶学; シンクロトロン放射光; タンパク質字結晶学; 生物マシーナリー

本研究班では効率的な放射光利用のために回折データ収集の自動化をおよび構造解析の迅速化を達成することを目的とした。これまでに本研究領域予算により、ADSC社のQuantum4R CCD検出器システムを導入し、回折データ測定の自動化をほぼ達成した。また昨年度導入した高速演算処理装置(Linux計算機)及び、回折イメージ処理ソフトウエア・構造解析用ソフトウエアは、すでに多数のユーザーにより使用されている。本システムを用いてビームタイム中に構造解析を達成するユーザー数は確実に増えてきている。本年度は回折データ収集のデータストレージ環境、ネットワーク環境の改善を行った。実際には、高速アクセス可能なレイドディスクを実験ステーションに導入し、回折および処理データの冗長保存、および、高速アクセスを可能とした。またステーションの通信をギガビット化して、データ収集保存/画像処理/データバックアップの安定性、高速性を確保した。また、本研究班で導入した測定システムを用いた実験のデータにより、本研究班員が参加する「細胞内輸送に関係する蛋白質複合体」の構造解析に成功し、輸送の初期段階の分子認識に重要な蛋白質の分子認識機構を明らかにした。これは本研究班で導入したシステムの有効性を示すものである。

The radiation rate of the students in this research class is characterized by the use of radiation, the use of radiation, the use In the field of this study, the field of this study is to calculate the number of users in the field of this study, and to determine the number of users in the field of this study. in the field of this study, the field of this study is to calculate the number of users in the Quantum4R CCD. In the past year, the high-speed calculus equipment (Linux computer) and the computer system have been introduced into the system. The system has been used for analysis and analysis. In this system, you can make sure that you don't know how many times you are going to make sure that you don't know how to make sure that you don't know what to do. This year, we will focus on the improvement of the environment and the improvement of the environment. International traffic, high-speed, high-speed, high-speed and high-speed. This is a good example of how to make sure that you are stable and high-speed. In this research class, we participated in the evaluation of the quality control system, and our research class participated in the "intracellular delivery protein complex". In the early stage of the experiment, the molecular recognition of important proteins in the early stage of the research class was successfully developed. The students of this research class will be enrolled in this research class.

项目成果

T.Shiba et al.: "Molecular mechanism of membrane recruitment of GGA by ARF in lysosomal protein transport"Nat.Struct.Biol.. (in press). (2003)

T.Shiba 等人：“溶酶体蛋白转运中 ARF 招募 GGA 的分子机制”Nat.Struct.Biol..（出版中）。

M.Kataoka: "Structures of photointermediates and their implications for the proton pump mechanism."Biochim.Biophys.Acta. 1460. 166-176 (2000)

M.Kataoka：“光中间体的结构及其对质子泵机制的影响。”Biochim.Biophys.Acta。

T. Konno: "A partially unfolded structure of the alkaline-denatured state of pepsin and its implications for stability of the zymogen-derived protein"Biochemistry. (in press). (2000)

T. Konno：“胃蛋白酶碱变性状态的部分未折叠结构及其对酶原衍生蛋白稳定性的影响”生物化学。

Y.Yamada: "Crystallization and preliminary X-ray analysis of catalase-peroxidase from the halophilic archaeon Haloarcula marismortui"Acta Cryst.. D57. 1157-1158 (2001)

Y.Yamada：“来自嗜盐古菌 Haloarcula marismortui 的过氧化氢酶-过氧化物酶的结晶和初步 X 射线分析”Acta Cryst.. D57。

五十嵐 教之: "新規の多ヘム酵素の立体構造解明"日本結晶学会誌. 41. 283-292 (1999)

Noriyuki Igarashi：“新型多血红素酶的三维结构的阐明”日本晶体学会杂志 41. 283-292 (1999)。