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RNAiを用いたショウジョウバエ変異体ライブラリーの構築

RNAiを用いたショウジョウバエ変異体ライブラリーの構築
利用 RNAi 构建果蝇突变体文库
批准号：
14011206
负责人：
西郷 薫
金额：
$4.48万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2002
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2002 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14011206/
关键词：
RNAiショウジョウバエ変異体ライブラリゲノムインバートリピート形質転換

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平成14年度は以下の結果を得た。1)ゲノム・アノテーションのアップデートにより、半数ほどの遺伝子で予測配列が更新された。これに伴って至適なプライマー配列をコンピューターにより再計算し、11000遺伝子についてプライマーを揃えることができた。2)ESTクローンのない遺伝子についてcDNAプールよりIR-cDNA構築を行う条件設定を行った。機械を導入した高速化によって、現在までに5,500の遺伝子についてIR-cDNAを得た。このうち3,200遺伝子についてはショウジョウバエに導入し、7,000系統を越える変異体を樹立した。3)これらの系統をAct-GAL4ハエ系統と交配することにより全細胞でRNAiを誘導し、成虫までの発生過程で致死となる遺伝子をスクリーンした。作成した全ての系統で致死となる遺伝子は1617遺伝子(5232系統)中、594遺伝子、また全系統が生存した遺伝子は554遺伝子であった。残りのおよそ1/3の遺伝子では致死と生存の表現型を示す系統が混在していた。このことは、導入した遺伝子の発現に及ぼす染色体位置効果がそれほど極端に影響するわけではないこと、RNAiが非特異的に発生を阻害するわけではないこと、ゲノムにおける致死遺伝子の割合はこれまで推定されていた30%よりも高いことを示唆している。4)局所的にGAL4を発現する幾つかのGAL4ハエ系統を用い、付属肢、複眼に異常を示す変異体系統をスクリーンしたところ、それぞれ10%程度の変異体で異常表現型が観察された。すなわち、このRNAi変異体系統が形態形成に関与する遺伝子のゲノム網羅的なスクリーンに適用可能であることが判明した。
期刊论文(8)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
F.Leulier: "Inducible expression of double strand RNA revelas a role of dFADD in the regulation of antibacterial response in Drosophila"Current Biology. 12. 58-61 (2002)
F.Leulier：“双链 RNA 的诱导表达揭示了 dFADD 在果蝇抗菌反应调节中的作用”《当代生物学》。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
M.Inaki: "Requirements of high levels of Hedghog signaling activity for medial-region cell fate determination in Drosophila leg"Mechanisms of Development. 116. 3-18 (2002)
M.Inaki：“果蝇腿内侧区域细胞命运决定需要高水平的 Hedghog 信号活性”发育机制。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
H.Takemae: "Proteoglycan UDP-galactose : xylose beta1,4galactocyltransferase I is essential for viability in Drosophila melanogaster"J.Biol.Chem.. (in press). (2003)
H.Takemae：“蛋白聚糖 UDP-半乳糖：木糖 β1,4 半乳酰基转移酶 I 对于黑腹果蝇的生存能力至关重要”J.Biol.Chem..（出版中）。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
N.Doi: "Requirement of Dicer and eIF2C translation factors for short-interfering gene silencing in mammalian cells"Current Biology. 13. 41-46 (2003)
N.Doi：“哺乳动物细胞中短干扰基因沉默所需的 Dicer 和 eIF2C 翻译因子”《当代生物学》。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
RNAiを用いたショウジョウバエ変異体ライブラリーの構築
  • 批准号：
    13202012
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
  • 资助金额：
    $5.12万
  • 财政年份：
    2001
  • 负责人：
    西郷 薫
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
ホメオボックス遺伝子の二段階転写調節による肢芽の区画化と遠近軸形成
  • 批准号：
    12028209
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
  • 资助金额：
    $1.34万
  • 财政年份：
    2000
  • 负责人：
    西郷 薫
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
肢形成の分子機構と関連シグナル伝達遺伝子の探索
  • 批准号：
    12026209
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
  • 资助金额：
    $1.54万
  • 财政年份：
    2000
  • 负责人：
    西郷 薫
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
RNAiを用いたショウジョウバエ変異体ライブラリーの構築
  • 批准号：
    12202011
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
  • 资助金额：
    $0.0万
  • 财政年份：
    2000
  • 负责人：
    西郷 薫
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
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