蛋白質フォールディング機構の物理化学的解明

蛋白质折叠机制的物理化学阐明

基本信息

项目摘要

1.αラクトアルブミンとリゾチームは互いにアミノ酸配列の類似した相同蛋白質であり、それらのフォールディング反応が類似しているか否かを実験的に明らかにすることは、蛋白質のフォールディング問題を考える上で重要である。昨年までの研究で、ヤギαラクトアルブミンのフォールディング反応の速度論的解析を行い、フォールディングの遷移状態で構造化する領域は、Cヘリックスとα-βドメイン境界にあるカルシウム結合部位近傍に局在化していることが明らかになっている。本年は、イヌ乳リゾチームのフォールディング反応の速度論的解析を行い、遷移状態ではカルシウム結合部位の構造は形成されていないことが明らかとなった。したがって、αラクトアルブミンとリゾチームは互いに相同で立体構造も類似しているがフォールディング経路が異なることになる。2.大腸菌のシャペロニンGroEL/ES複合体が、生理的条件下において、GroELとGroESのモル比が1:1の非対称な構造(弾丸型)を持つのか,あるいは,モル比が1:2の対称な構造(フットボール型)を持つのかは依然解決がついていない。電子顕微鏡の画像解析を利用した研究では,弾丸型であるとする結果とフットボール型であるとする結果の両方が報告されている。溶液X線小角散乱法は溶液中の蛋白質超分子複合体の構造を解析する有効な実験手法である。溶液X線散乱法を用いて,ATP存在下の生理的条件下におけるGroEL/ES複合体の立体構造を解析し,複合体が非対称な弾丸型の構造を持つことを明らかにした。ATP+BeF_x存在下では対称なフットボール型構造が形成されることも明らかとなったので,ATP加水分解を伴ったシャペロニン・サイクル中過渡的にフットボール型となることも期待される。
1. Alpha ラ ク ト ア ル ブ ミ ン と リ ゾ チ ー ム は mutual い に ア ミ ノ acid with column の similar し た same protein で あ り, そ れ ら の フ ォ ー ル デ ィ ン グ anti 応 が similar し て い る か no か を be 験 に Ming ら か に す る こ と は, protein の フ ォ ー ル デ ィ ン グ problem を exam え る で important で あ る. Yesterday in ま で の research で, ヤ ギ alpha ラ ク ト ア ル ブ ミ ン の フ ォ ー ル デ ィ ン グ anti 応 の speed theory of analytic を い, フ ォ ー ル デ ィ ン グ の migration state で structured す は る field, C ヘ リ ッ ク ス と alpha beta ド メ イ ン realm に あ る カ ル シ ウ ム combining site near alongside に bureau in turn し て い る こ と が Ming ら か に な っ て い る. Year は, イ ヌ milk リ ゾ チ ー ム の フ ォ ー ル デ ィ ン グ anti 応 の speed theory of analytic を い, migration state で は カ ル シ ウ ム combining site は の structure form さ れ て い な い こ と が Ming ら か と な っ た. し た が っ て, alpha ラ ク ト ア ル ブ ミ ン と リ ゾ チ ー ム は mutual い に で same three-dimensional structure も similar し て い る が フ ォ ー ル デ ィ ン グ 経 road が different な る こ と に な る. 2. Coliform の シ ャ ペ ロ ニ ン GroEL/ES complex が, physiological conditions に お い て, GroEL と GroES の モ ル than が 1:1 の says な structure (弾 pill) を seaborne hold つ の か, あ る い は, モ ル than が 1:2 の said seaborne な structure (フ ッ ト ボ ー ル type) を hold つ の か は still solve が つ い て い な い. Electronic 顕 micromirror の portrait parsing を using し た research で は, type 弾 pill で あ る と す る results と フ ッ ト ボ ー ル type で あ る と す る results の struck party が report さ れ て い る. Solution X-ray small-angle dispersion method structure of <s:1> protein supramolecular complex <e:1> in solution を analysis する effective な experimental technique である. Solution method of X-ray scattered を with い て, の physiological conditions in the presence of ATP に お け る GroEL/ES complex の three-dimensional structure analytical し を, complex が non said seaborne な 弾 type pill の tectonic を hold つ こ と を Ming ら か に し た. The presence of ATP + BeF_x で は said seaborne な フ ッ ト ボ ー ル type structure が form さ れ る こ と も Ming ら か と な っ た の で, ATP hydrolysis を with っ た シ ャ ペ ロ ニ ン · サ イ ク ル transition in に フ ッ ト ボ ー ル type と な る こ と も expect さ れ る.

项目成果

期刊论文数量(86)
专著数量(0)
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专利数量(0)
Folding of Canine Milk Lysozyme: A Ca^<2+>-Binding Lysozyme
犬乳溶菌酶的折叠:Ca^<2>-结合溶菌酶
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    KUWAJIMA;Kunihiro
  • 通讯作者:
    Kunihiro
Mutational analysis of protein solubility enhancement using short peptide tags
  • DOI:
    10.1002/bip.20596
  • 发表时间:
    2007-01-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Kato, Atsushi;Maki, Kosuke;Kuroda, Yutaka
  • 通讯作者:
    Kuroda, Yutaka
K.Kamagata: "Multiple parallel-pathway folding of proline-free staphylococcal nuclease."J.Mol.Biol.. 332. 1143-1153 (2003)
K.Kamagata:“无脯氨酸葡萄球菌核酸酶的多重平行途径折叠。”J.Mol.Biol.. 332. 1143-1153 (2003)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
M.Arai: "Effects of the difference in the unfolded-state ensemble on the folding of Escherichia coil dihydrofolate reductase."J.Mol.Biol.. 329. 779-791 (2003)
M.Arai:“未折叠状态整体的差异对大肠杆菌二氢叶酸还原酶折叠的影响。”J.Mol.Biol.. 329. 779-791 (2003)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Asymmetry of the GroEL-GroES complex under physiological conditions as revealed by small-angle X-ray scattering
  • DOI:
    10.1529/biophysj.107.114710
  • 发表时间:
    2008-02-15
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Inobe, Tomonao;Takahashi, Kazunobu;Kuwajima, Kunihiro
  • 通讯作者:
    Kuwajima, Kunihiro
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桑島 邦博其他文献

Dynamic analysis of helical protrusion of group II chaperonins using fluorescent probes
使用荧光探针动态分析 II 族伴侣蛋白的螺旋突出
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    増田 莉恵;神前 太郎;飯塚 怜;高橋 一暢;槙 亙介;石井 則行;桑島 邦博;養王田 正文
  • 通讯作者:
    養王田 正文
Efficient energy delivering in powder plasmas
粉末等离子体的高效能量传输
  • DOI:
  • 发表时间:
    2003
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Nobuyuki Matubayasi;Masahiro Kinoshita;and Masaru Nakahara;M. Sawada;Takanori Ichiki;桑島 邦博;S. N. Abolmasov;M. Kobayashi;T. Yokoyama
  • 通讯作者:
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Preparation of diamond whiskers using Ar/O_2 plasma etching
Ar/O_2等离子刻蚀制备金刚石晶须
  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    K.Miyauchi;S.Miyazaki;K.Sakai;S.Kawata Q.Kong;A.A.Andreev;T.Kikuchi;S. Ishii;Y. Shintani;J. Choi;桑島 邦博;一木隆範;K.Zikihara et al.;K.Tachibana;C. Y. Li
  • 通讯作者:
    C. Y. Li
Electronic and structural properties on nanowhiskers fabricated on iron coated diamond films by radio frequency O_2 plasma etching
射频O_2等离子体刻蚀铁涂层金刚石薄膜纳米晶须的电子和结构特性
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    苫居高明;伊藤剛仁;寺嶋和夫;O. Sakai;桑島 邦博;N. Shirai;S. Miyazaki;K.Inoue;C. Y. Li
  • 通讯作者:
    C. Y. Li
Spatio-temporal measurement of surface charge on dielectric electrodes in a coplanar-electrode cell
共面电极电池中介电电极表面电荷的时空测量
  • DOI:
  • 发表时间:
    2006
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    H.Parchamy;N.Yugami;T.Muraki;H.Noda;Y.Nishida;T. Tomai;桑島 邦博;T. Namihira;K. Tachibana
  • 通讯作者:
    K. Tachibana

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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 通讯作者:
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Residual Structures of Denatured Proteins Studied by Two-Dimensional NMR Using a Spin-Desalting Column
使用旋转脱盐柱通过二维 NMR 研究变性蛋白质的残留结构
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  • 批准号:
    15032208
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
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水と生体分子が織り成す生命現象の化学に関する研究の総括
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大肠杆菌伴侣蛋白功能表达动力学
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    14037214
  • 财政年份:
    2002
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蛋白質フォールディングの物理化学的解析
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  • 批准号:
    14015207
  • 财政年份:
    2002
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α-ラクトアルブミンのモルテン・グロビュール状態の安定化の分子機構
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    1998
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    1998
  • 资助金额:
    $ 89.09万
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    06248204
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    1994
  • 资助金额:
    $ 89.09万
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    05252204
  • 财政年份:
    1993
  • 资助金额:
    $ 89.09万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

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二次元材料・生体分子界面におけるナノ物性の解明と局所制御
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生体分子機械の最適輸送プロトコル ー ミクロな系の制御の原理限界に迫る
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    2024
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    23K28358
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    2024
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    2024
  • 资助金额:
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  • 财政年份:
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