水素交換ラベルと二次元NMRによるタンパク質の膜透過型分子構造の解析

使用氢交换标记和二维 NMR 分析蛋白质的膜渗透分子结构

• 批准号: 05252204
• 负责人: 桑島 邦博
• 金额: $ 0.9万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1993
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1993 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-05252204/
• 关键词: タンパク質の細胞内輸送; 分子シャペロン; シャペロニン; GroEL; モルテン・グロビュール状態

タンパク質の巻戻りの中間体であるモルテン・グロビュール(MG)状態は、細胞内において、GroELやSecBなどの分子シャペロンにより認識される膜透過型の分子形態に対応すると考えられていた。本研究の当初の目的は、最も典型的なMG状態を示すα-ラクトアルブミン(α-LA)を対象に、GroELによるMG状態認識の分子機構を調べることにあった。しかし、昨年度より本年度初めにかけての研究結果より、MG状態にあるα-LAはGroELと全く相互作用しないことが明らかとなった。本年度は、(1)GroELの標的タンパク質に対する結合活性を改めて確認すること、(2)SS結合を還元したα-LAとGroELとの相互作用を検討することの二点に絞って研究を行った。ニワトリのジヒドロ葉酸還元酵素の塩酸グアニジンからの巻戻り反応の中間体はGroELと結合することがすでに知られている。そこで、上のMG状態の実験で用いたと同一の条件下で、ジヒドロ葉酸還元酵素の巻戻り中間体とGroELとの相互作用を分子ふるいクロマトグラフィーにより調べた。その結果両者の間には強い相互作用が観測され、この条件下でGroELが標的タンパク質に対する結合活性を十分持っていることが確認された。α-LAの4本のSS結合をジチオスレイトールにより還元し、還元条件下で、GroELとの相互作用を分子ふるいクロマトグラフィーにより調べた。その結果、KClの非存在下では、還元α-LAもGroELと相互作用しないが、50mMKClを添加することにより両者が強く相互作用することが明らかとなった。以下の点が明らかである。(1)還元α-LAとGroELとの相互作用にはKCl依存性がある。(2)MG状態はKClを添加してもGroELとは結合しないので、還元タンパク質の方がGroELに対し強い親和性を持っている。(3)ジヒドロ葉酸還元酵素の中間体はKCl非存在下でもGroELと結合したので、GroELとの相互作用の強さは標的タンパク質の種類にも依存する。CDスペクトルと分子ふるいクロマトグラフィーの溶出位置より、還元α-LAとMG状態との立体構造を比較した。還元α-LAの二次構造はMG状態のものより少なく、分子はより膨潤した構造を取っている。したがって、還元α-LAの構造はよりフレキシブルで疎水性表面もより多く溶媒中に露出していると考えられる。構造のフレキシビリティーと疎水性表面の露出度がGroELによる認識にとって重要であるのかもしれない。

The intermediate of the quality of the product is the state of the cell, the molecular state of the cell, and the molecular state of the cell. The purpose of this study is to investigate the molecular mechanism of MG state by analyzing the most typical MG state, α-LA (α-LA) and GroEL (GroEL). The results of this study show that the MG status is related to the interaction between α-LA and GroEL. This year, we conducted research on (1) the binding activity of GroEL target molecules and (2) the interaction of SS binding molecules with α-LA and GroEL. The intermediate of folate reducing enzyme in the process of synthesis is known as the intermediate of folate reducing enzyme. Under the same conditions, the interaction between folate reductase and GroEL was investigated. As a result, the strong interaction between the two groups was detected, and the binding activity of the target group was confirmed under these conditions.α-LA 4-SS binding is regulated by molecular interaction under reductive conditions. In the absence of KCl, the interaction between α-LA and GroEL is reduced. In the absence of KCl, the interaction between α-LA and GroEL is reduced. In the absence of KCl, the interaction between α-LA and GroEL is reduced. In the absence of KCl, the interaction between α-LA and GroEL is reduced. The following points are clear and clear. (1)The interaction between α-LA and GroEL is dependent on KCl. (2)MG The state of KCl is added to the GroEL and the affinity of the GroEL is maintained. (3)The intermediate of folate reducing enzyme depends on the type of substrate in the absence of KCl. CD molecules are extracted from the solution, and the structure of the α-LA molecule is compared. The secondary structure of α-LA is different from that of MG state, and the molecular structure is different from that of swelling. The structure of α-LA is very different from that of the water surface. The structure of water surface exposure is important for understanding

项目成果

Kuwajima,K.: "Secondary Structure of Globular Proteins at the Early and the Final Stages in Protein Folding" FEBS Lett.334. 265-268 (1993)

Kuwajima,K.：“蛋白质折叠早期和最终阶段球状蛋白质的二级结构”FEBS Lett.334。

桑島邦博・伊倉貞吉: "蛋白質の折れたたみ機構" 蛋白質 核酸 酵素. (発表予定). (1994)

Kunihiro Kuwashima 和 Sadakichi Ikura：“蛋白质折叠机制”蛋白质、核酸、酶（待发表）。

桑島邦博: "ストレス蛋白質の基礎と臨床(一部執筆) 発表予定" 中外医学社出版,永田和宏・編集, (1994)

桑岛国宏：《应激蛋白的基础与临床研究（部分撰写）即将出版》中外医学社出版社，永田和宏编辑，（1994）

Kuwajima,K.: "Spectroscopic Techniques to Study Protein Folding c.Circular Dichroism" Methods in Molecular Biology. (発表予定). (1994)

Kuwajima, K.：“研究蛋白质折叠 c.圆二色性的光谱技术”分子生物学方法（待发表）。