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棘皮動物Otx遺伝子の転写調節機構の解明

阐明棘皮动物Otx基因的转录调控机制

基本信息

批准号：
16027235
负责人：
山本卓
金额：
$ 3.46万
依托单位：
Hiroshima University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2005
项目状态：
已结题

项目摘要

本年度は、以下のとおり研究を実施した。1)棘皮動物Otx遺伝子におけるエンハンサーコア領域の比較解析SpとLvゲノムDNAからHpOtxエンハンサーコア相同領域をPCRにより増幅し、HpOtxプロモーターとレポーター遺伝子を連結した構築を作成した。これらの構築をウニ胚に導入し、Otxの発現が高い間充織胞胚期にレポーター活性を測定したところ、Hp同様に、Sp,Lvの相同領域において活性が見られた。この結果は、同定したエンハンサーは他種のSpおよびLvにおていも機能し、Lvにおいては別の位置にあるOtx結合部位が機能する可能性を示している。2)HpOtx遺伝子の多型解析によるエンハンサーコア領域の絞り込みHpOtxエンハンサーコア領域とその上流域および下流の第二エキソンを含む約1800bpの領域を19個体のバフンウニゲノムDNAからPCRにより増幅後、配列を解析した。DNASPプログラムで配列の種内変異を解析したところ、第二エキソンとエンハンサーコアにはSNPは存在したものの頻度は低く、length polymorphismは全く見られなかった。コア内のOtx結合部位は全ての個体において保存されていたが、3種のウニで保存されていたGATA結合部位がSNPにより変異した個体が見られた。一方、エンハンサーコア上流には多数のSNPとlength polymorphismが見られ、コア上流は種内においても変異が入りやすいことが明らかとなった。今回の種内の個体変異からの調節領域の絞込みは、これまでの3種のウニゲノム比較から得られた配列保存性をよく再現しただけでなく、エンハンサー内の転写因子結合部位の絞り込みにも有用であることがわかった。

This year, the following research has been carried out. 1)Comparative analysis of Echinoderm Otx gene fragments in the same domain Sp, Lv, DNA, HpOtx gene fragments, PCR amplification, HpOtx gene fragments, linkage and construction In the same field as Hp, Sp and Lv, the activity of Ot was measured. The results show the possibility that the Sp and Lv binding sites of different species may function. 2) Polytype analysis of HpOtx gene: HpOtx gene: HpOtx The frequency of SNP is low, and the length polymorphism is complete. The Otx binding sites in the genome are preserved in the genome, and three species are preserved in the genome. A party, a party. In this paper, three kinds of species are compared, and the preservation of the alignment is reproduced. The combination of the factors in the species is useful.

项目成果

期刊论文数量（12）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Organ-specific and age-dependent expression of insulin-like growth factor-I (IGF-I) mRNA variants : IGF-IA and IB mRNAs in the mouse.

胰岛素样生长因子-I (IGF-I) mRNA 变体的器官特异性和年龄依赖性表达：小鼠中的 IGF-IA 和 IB mRNA。

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
Zoological Science 22・9
影响因子：
0
作者：
Shepherdley;C.A.;Takemoto T. et al.;Kondoh et al.;Fujii T. et al.;Ohtsuki T. et al.
通讯作者：
Ohtsuki T. et al.

Sexually dimorphic expression of a teleost homologue of Mulleria inhibiting substance during gonadal sex differentiationin Japanease flounder, Paralichthys olivaceus.

日本牙鲆性腺性别分化过程中穆勒氏菌抑制物质的硬骨鱼同源物的性别二态性表达。