CNRカドヘリン分子群の機能と系統進化の解析

CNR-cadherin分子的功能和系统发育分析

基本信息

批准号：
16027263
负责人：
先崎浩次
金额：
$ 3.84万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2005
项目状态：
已结题

项目摘要

脊椎動物系統進化の過程でのCNR分子群の機能を明らかにするにあたり、ゼブラフィッシュCNRのゲノム構造解析を行った。マウスCNR遺伝子の共通領域をプローブとしてゼブラフィッシュcDNAライブラリーからゼブラフィッシュCNR(z34)を単離し、このゼブラフィッシュCNRをプローブとしてゼブラフィッシュBAC(Bacterial Artificial Chromosome)ゲノムライブラリーからゼブラフィッシュCNRゲノム領域を含むBACクローンを得た。ショットガンシークエンス法によりBACクローンの全遺伝子配列の同定を行いゼブラフィッシュCNRのゲノム構造を明らかにした。同時にゼブラフィッシュゲノム解析を行っていた他のグループによりゼブラフィッシュCNRのゲノム構造を明らかにしたとの報告がなされ、比較の結果、私たちが解析していたゼブラフィッシュCNRゲノム構造が含まれていない解析結果であった。そこで、ゼブラフィッシュゲノム解析の結果と私たちが解析したゼブラフィッシュCNRゲノム構造解析の結果をまとめ報告した。マウスやヒトのCNRゲノム構造とゼブラフィッシュのゲノム構造を比較解析した結果、マウスやヒトと比べゼブラフィッシュではCNR分子の数が増え、さらに複雑なゲノム構造を形成していた。また、ゼブラフィッシュCNR遺伝子はマウスやヒトにはないアイソフォームが存在することが明らかにされた。これらのことからゼブラフィッシュにおいてはマウスやヒトと異なるCNR分子の機能が想定される。

为了阐明CNR分子在脊椎动物谱系演化过程中的功能，进行了斑马鱼CNR的基因组结构分析。从斑马鱼cDNA文库中分离出斑马鱼CNR（Z34），使用小鼠CNR基因的公共区域作为探针，并使用此Zebrafish cnre cnre cnre cnr ose cnr cnr bac（细菌型人造染色体图），从斑马鱼BAC（细菌型人造染色体）中获得了含有斑马鱼CNR基因组区域的BAC克隆。通过shot弹枪测序鉴定了BAC克隆的整个基因序列，以阐明斑马鱼CNR的基因组结构。据报道，其他同时进行斑马鱼基因组分析的组揭示了斑马鱼CNR的基因组结构，比较结果表明，我们正在分析的斑马鱼CNR的基因组结构不包括斑马鱼CNR基因组结构。因此，我们总结了斑马鱼基因组分析的结果以及我们分析的斑马鱼CNR基因组结构分析的结果。与斑马鱼基因组结构的小鼠和人类CNR基因组结构的比较分析表明，与小鼠和人相比，斑马鱼中的CNR分子数量增加，并且形成了更复杂的基因组结构。还揭示了斑马鱼CNR基因的同工型在小鼠或人类中未发现。从这些原因中，可以假定CNR分子的功能与斑马鱼中的小鼠和人类的功能不同。