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フォールディング・ファネル中間層での遠隔残基間相互作用の研究

フォールディング・ファネル中間層での遠隔残基間相互作用の研究
折叠漏斗中层远程残基相互作用的研究
批准号:
16041240
负责人:
池口 雅道
金额:
$3.07万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 2005

项目摘要

项目成果

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ウマβラクトグロブリン(ELG)と、同じリポカリン・ファミリーに属するヒト涙リポカリン(TL)を材料として中間状態の構造を解析した。1.ELCは酸性pHでモルテン・グロビュール(MG)状態をとる。酸性pHでのCDスペクトルの塩濃度依存性を調べたところ、大きな塩濃度依存は観測されなかった。しかし、ELGは分子内に2つのジスルフィド(S-S)結合を有するので、この存在が分子の拡張を妨げている可能性が考えられた。そこでCysをAlaに置換してS-S結合を1つ無くした変異体を作製し、酸性pHでの塩濃度依存性を調べた。その結果、塩濃度の低下に伴うヘリックス含量の増加が観測され、MG構造の安定化に関する疎水相互作用の役割の重要性が確認された。2.ELGのMG状態と低温変性状態の二次構造の差異を一連のプロリン置換変異体作製とアミドプロトンの水素・重水素交換によって調べた。その結果、MG状態と低温変性状態のいずれにおいても水素交換から保護されているアミドプロトンは天然構造においてF,G,Hストランドを形成する領域とヘリックスを形成する領域に存在した。一方、アミノ酸残基をプロリンに置換してCDスペクトルがヘリックスの減少を示した領域は、MG状態ではHストランドとヘリックスを形成する領域であったのに対して、低温変性状態ではF,G,Hストランドとヘリックスを形成する領域であった。3.TLの尿素変性状態からのフォールディング反応をCDストップト・フロー法により観測した。その結果、ELGと同様に不感時間内にCDスペクトルの変化を示すが、そのスペクトルはELGのように非天然ヘリックス構造の形成を示すものではなかった。TLのアミノ酸配列はELGのように高いヘリックス形成傾向を示さないため、フォールディング初期に形成される中間体の二次構造はアミノ酸配列の二次構造形成傾向を強く反映したものであると考えられた。
期刊论文(6)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Helical and expanded conformation of equine β-lactoglobulin in the cold-denatured state.
马β-乳球蛋白在冷变性状态下的螺旋和扩张构象。
DOI: --
发表时间: 2005
期刊: J.Mol.Biol. 350
影响因子: --
作者: [Yamada, Y.]
通讯作者: Y.
Structural and Thermodynamic Consequences of Removal of a Conserved Disulfide Bond from Equine β-Lactoglobulin
从马 β-乳球蛋白中去除保守二硫键的结构和热力学后果
DOI: --
发表时间: 2006
期刊: Proteins 63
影响因子: --
作者: [Yamashita, T., Yoshiteru Yamada]
通讯作者: Yoshiteru Yamada
Thermal stabilization of penicillolysin, a thermo-labile 19 kDa Zn^<2+>-protease, obtained by site-directed mutagenesis
青霉溶血素的热稳定性,一种热不稳定的 19 kDa Zn^2-蛋白酶,通过定点诱变获得
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: Protein Eng.Des.Sel. 17
影响因子: --
作者: [Yamashita, T., Yoshiteru Yamada, Yoshiteru Yamada, Yuko Doi]
通讯作者: Yuko Doi
Molecular evolution of ferritin: Role of electric charges on iron storage function
  • 批准号:
    21K06116
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $2.25万
  • 财政年份:
    2021
  • 负责人:
    池口 雅道
  • 依托单位:
モルテン・グロビュール構造安定化に寄与する疎水相互作用の特異性
  • 批准号:
    18031036
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $3.01万
  • 财政年份:
    2006
  • 负责人:
    池口 雅道
  • 依托单位:
NMRによるモルテン・グロビュール構造の解析
  • 批准号:
    10157224
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
  • 资助金额:
    $0.77万
  • 财政年份:
    1998
  • 负责人:
    池口 雅道
  • 依托单位:
タンパク質の立体構造形成と分子内相互作用の階層性に関する研究
  • 批准号:
    05780445
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
  • 资助金额:
    $0.58万
  • 财政年份:
    1993
  • 负责人:
    池口 雅道
  • 依托单位: