蛋白質フォールディングにおけるフォールディング・エレメントの役割

折叠元件在蛋白质折叠中的作用

• 批准号: 16041248
• 负责人: 新井 宗仁
• 金额: $ 8万
• 依托单位: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16041248/
• 关键词: 蛋白質; フォールディング; 反応速度論; ジヒドロ葉酸還元酵素; 構造形成能; 安定性; 自己組織化; 折りたたみ; フォールディング・エレメント

1.蛋白質がfoldableであるための必要条件の一つは、全フォールディング・エレメント(FE)の存在である。これに加えてFEが互いに連結されていることも必要条件の一つであることを示した。一方、FEは非局所的なFE間相互作用において重要な役割を果たすことが示された。したがって蛋白質がfoldableとなるための必要条件は「全FE間相互作用が効率的に実現されること」と言い換えられる。2.FE間相互作用の効率的実現のための条件探索を目的として、ジヒドロ葉酸還元酵素(DHFR)のFEシャフリング実験を行った結果、様々なFE連結順序の場合にDHFRがfoldableとなることが示された。また、FE間のリンカー配列とその長さについては、FE間相互作用を妨げない範囲において可変であることが示された。3.連続フローX線溶液散乱法を用いてDHFRのFE間相互作用の形成過程を調べた結果、300マイクロ秒以内に慣性半径23Aの中間体を形成すること、および、その後10ミリ秒までの間に大きな構造変化はないことが示された。また、蛍光エネルギー移動法と連続フロー時間相関一光子計測法を組み合わせて測定した結果、30マイクロ秒以内に分子サイズがコンパクトになること、および、100マイクロ秒の時定数を持った小さな構造変化の存在を見出した。4.様々な蛋白質の折り畳み中間体が持つ分子サイズや二次構造などの特徴を統計的に調べた結果、中間体の構造は、天然状態における構造特性と強い相関を持つことが示唆された。5.蛋白質のFE領域を同定する際には、N末端とC末端を適切なリンカーで連結させる必要がある。新規な末端連結法としてシアノシステインを用いた方法を開発し、DHFRを環状化することによって、機能を損なわずに蛋白質を安定化できることを示した。

1. Protein, foldable, protein, protein, protein and protein. Add FE to each other and link each other to the necessary conditions. On the other hand, the interaction between the FE and the FE is very important in service. The results show that the system is in operation. In this paper, we use the necessary conditions for the determination of protein, foldable, and the necessary conditions for the detection of the total FE interaction rate. A probe into the conditions for the realization of the rate of interaction between 2.FE objective: to analyze the results of the FE enzyme (DHFR), the FE link sequence and the DHFR foldable sequence. The long-term and long-range interaction between FE and FE can be displayed in different ranges. 3. The X-ray solution dispersion method uses the interaction between DHFR and FE to form the process simulation results, and the medium temperature within the radius of 23 A within 300 seconds to form the temperature, temperature One photon measurement method is used to determine the results of the test results, and there is an output error when the temperature is controlled within 30 minutes of a second and 100 seconds. 4. In this paper, the results of molecular analysis, and the characteristics of natural conditions. 5. The protein FE domain is the same as the international level, and the N-terminal C-terminal is linked to the necessary amino acid. The new specification end-of-link method is used to verify that the environmental protection system is open, the DHFR environment is used, and the protein is stabilized and stabilized.

项目成果

Localized nature of the transition-state structure in goat α-lactalbumin folding

山羊 α-乳清蛋白折叠中过渡态结构的局部性质

• 发表时间: 2004
• 期刊: Journal of Molecular Biology 341(2)
• 作者: Saeki;K;Arai;M. et al.
• 通讯作者: M. et al.

Helical and expanded conformation of equine beta-lactoglobulin in the cold-denatured state.

马β-乳球蛋白在冷变性状态下的螺旋和扩张构象。

• 发表时间: 2005
• 期刊: Journal of Molecular Biology 350(2)
• 作者: Y.Horie;A.Suzuki et al.;堀江 泰夫 ほか;新井 宗仁;Kuwajima et al.;新井 宗仁;Nakao et al.;Yamada et al.
• 通讯作者: Yamada et al.

Oligomeric Hsp33 with enhanced chaperone activity : Gel-filtration, cross-linking and SAXS analysis

具有增强伴侣活性的寡聚 Hsp33：凝胶过滤、交联和 SAXS 分析

• 发表时间: 2004
• 期刊: Journal of Biological Chemistry 279(53)
• 作者: Akhtar;M.W. et al.
• 通讯作者: M.W. et al.

Peptide fragment studies on the folding elements of dihydrofolate reductase from Escherichia coli

• DOI: 10.1002/prot.20675
• 发表时间: 2006-02-01
• 期刊: PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS
• 影响因子: 2.9
• 作者: Arai, M;Iwakura, M
• 通讯作者: Iwakura, M

タンパク質のフォールディング・エレメント

蛋白质折叠元件

• 发表时间: 2005
• 期刊: 生物物理 45(3)
• 作者: Y.Horie;A.Suzuki et al.;堀江 泰夫 ほか;新井 宗仁;Kuwajima et al.;新井 宗仁;Nakao et al.;Yamada et al.;新井 宗仁
• 通讯作者: 新井 宗仁