蛋白質の折りたたみ反応の階層的モデルの検証
蛋白質の折りたたみ反応の階層的モデルの検証
批准号:
13780522
负责人:
新井 宗仁
金额:
$1.34万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2001
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2001 至 2002
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昨年度に引き続き、α-ラクトアルブミン(α-LA)のフォールディング反応における遷移状態の構造特徴づけを、Φ値解析法を用いて行った。今年度は特に、α-LAのβドメインやCヘリックス周辺に変異を導入した一アミノ酸置換体を多数作成し、α-LAの遷移状態の構造解析を行った。平衡条件下でのアンフォールディング測定の結果、変異体はどれも野生型より不安定化しており、Φ値解析に有効な試料であった。次に、ストップトフロー円二色性スペクトル法を用いてこれらの変異体の巻き戻り反応とアンフォールディング反応を測定し、Φ値を計算した結果、I89A, I89V, I55VについてはΦ=0.4〜0.6程度であったが、W60A, K93A, L96Aについては、Φ〜0となった。これらの結果は、I89, I55の周りは遷移状態において側鎖の密なパッキングが部分的に形成されているが、W60,K93,L96周辺は、遷移状態では側鎖の秩序化はまだ起きていないことを示している。この2年間の研究結果を総合すると、α-LAの遷移状態の構造について次のような知見が得られた。(1)αドメイン内の側鎖は、天然状態様の密なパッキングをまだ形成していないが、(2)αドメインとβドメインの間、および、カルシウム結合部位近傍では、側鎖の密なパッキングが部分的に形成されている。ここで、モルテン・グロビュール(MG)状態においては、2つのドメイン間にあるCヘリックスが比較的安定なヘリックス構造を形成していることを考慮に入れると、α-LAのフォールディング反応は、MG中間体で形成され始めた構造が遷移状態に進むにつれて更に構造化していくという階層的な反応で記述できると結論づけることができる。
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Zhi-jie Qin: "Refolding of beta-lactoglobulin studied by stopped-flow circular dichroism at subzero temperatures"FEBS letters. 507. 299-302 (2001)
秦志杰:“在零下温度下通过停流圆二色性研究β-乳球蛋白的重折叠”FEBS 信件。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
桑島邦博: "蛋白質フォールデイングの2つの描像:普遍的描像は可能か?"蛋白質・核酸・酵素. (in press). (2002)
Kunihiro Kuwashima:“蛋白质折叠的两张图片:蛋白质、核酸、酶是否可能?”(2002 年出版)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
桑島 邦博: "Two views of protein folding : what is the universal view?"蛋白質・核酸・酵素. 47(6). 657-662 (2002)
Kunihiro Kuwashima:“蛋白质折叠的两种观点:什么是普遍观点?”47(6) (2002)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
新井 宗仁: "Fast Compaction of α-lactalbumin During Folding Studied by Stopped-Flow X-ray Scattering"Journal of Molecular Biology. 321(1). 121-132 (2002)
Munehito Arai:“通过停流 X 射线散射研究折叠过程中 α-乳清蛋白的快速压缩”,《分子生物学杂志》321(1) (2002)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
桑島 邦博: "The use of the time-resolved X-ray solution scattering for studies of globular proteins"Spectroscopy. 16(3-4). 127-138 (2002)
Kunihiro Kuwashima:“使用时间分辨 X 射线溶液散射研究球状蛋白质”光谱学 16(3-4) (2002)。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 11 条
軽油相当のバイオ燃料を大量生産可能なGX用酵素の合理的創出
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批准号:24K01262
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.81万
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财政年份:2024
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负责人:新井 宗仁
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依托单位:
Development of a universal method for rationally improving enzymatic activity
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批准号:21K18841
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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财政年份:2021
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负责人:新井 宗仁
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依托单位:
軽油相当のバイオ燃料を大量生産可能な高活性型アルカン合成関連酵素の創出
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批准号:19H02521
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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财政年份:2019
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负责人:新井 宗仁
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依托单位:
フォールディング・エレメント間相互作用に基づく蛋白質構造形成機構の解明
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批准号:18031045
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.1万
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财政年份:2006
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负责人:新井 宗仁
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依托单位:
蛋白質フォールディングにおけるフォールディング・エレメントの役割
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批准号:16041248
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$8.0万
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财政年份:2004
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负责人:新井 宗仁
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依托单位:
モルテン・グロビュール状態の形成機構の解明
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批准号:11780463
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1999
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负责人:新井 宗仁
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依托单位:
蛋白質の折れたたみにおけるモルテン・グロビュール状態形成の分子機構
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批准号:98J04802
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1998
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负责人:新井 宗仁
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依托单位:
海外基金