翻訳終結と共役したmRNA分解制御機構の構造生物学的解明
翻訳終結と共役したmRNA分解制御機構の構造生物学的解明
批准号:
17026005
负责人:
大澤 匡範
金额:
$3.58万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 2006
中文摘要
(1)PABPの多量体化についての解析PABPは4個のRNA認識モチーフ(RRM)、蛋白質結合ドメインPABC、およびそれらを繋ぐリンカー領域から構成される蛋白質である。真核生物のmRNA3'末端に付加しているポリAは、約200塩基ほどの長さがあり、23-24塩基あたり1分子のPABPが結合していることが知られている。このポリA結合型PABPは、ポリA非結合型PABPと相互作用し多量体化していることが報告されている。このPABPを介したGSPT/eRF3とポリA分解酵素との共役機構を解明するためには、まず、ポリA上でのPABP多量体機構を明らかにする必要がある。本年度の研究において、ポリA上でのPABP分子間の相互作用を定量的に評価し、相互作用領域をPABP中のドメインRRM1、RRM2およびリンカー領域に存在することを明らかにした。また、得られた結果に基づき、多量体状態モデルを提唱した。(2)PABP依存性ポリA分解酵素とPABPの相互作用解析遺伝情報発現の最終段階である「翻訳」過程において、蛋白質の発現量はmRNAの寿命によって制御される。真核生物におけるmRNA分解の最初の段階は、mRNA3'末端のポリAの分解であるが、これを担うポリA分解酵素はポリAに結合しているPABPによりリクルートされる。このPABP依存性ポリA分解酵素は、酵素活性を有するRNaseサブユニットおよびPABP結合サブユニットからなる。本研究において、各サブユニットを大量発現・精製し、サブユニット間相互作用を熱力学的に解析した。また、PABP結合サブユニットは立体構造を形成するN末端ドメインと、特定の立体構造を形成しないC末端領域からなり、前者がRNaseサブユニットと、後者がPABPと相互作用することを明らかにし、そしてその親和性を定量的に求めた。さらに、C末端領域の中でPABPと直接相互作用する12残基からなる領域を同定した。
英文摘要
(1)PABPの多量体化についての解析PABPは4個のRNA認識モチーフ(RRM)、蛋白質結合ドメインPABC、およびそれらを繋ぐリンカー領域から構成される蛋白質である。真核生物のmRNA3'末端に付加しているポリAは、約200塩基ほどの長さがあり、23-24塩基あたり1分子のPABPが結合していることが知られている。このポリA結合型PABPは、ポリA非結合型PABPと相互作用し多量体化していることが報告されている。このPABPを介したGSPT/eRF3とポリA分解酵素との共役機構を解明するためには、まず、ポリA上でのPABP多量体機構を明らかにする必要がある。本年度の研究において、ポリA上でのPABP分子間の相互作用を定量的に評価し、相互作用領域をPABP中のドメインRRM1、RRM2およびリンカー領域に存在することを明らかにした。また、得られた結果に基づき、多量体状態モデルを提唱した。(2)PABP依存性ポリA分解酵素とPABPの相互作用解析遺伝情報発現の最終段階である「翻訳」過程において、蛋白質の発現量はmRNAの寿命によって制御される。真核生物におけるmRNA分解の最初の段階は、mRNA3'末端のポリAの分解であるが、これを担うポリA分解酵素はポリAに結合しているPABPによりリクルートされる。このPABP依存性ポリA分解酵素は、酵素活性を有するRNaseサブユニットおよびPABP結合サブユニットからなる。本研究において、各サブユニットを大量発現・精製し、サブユニット間相互作用を熱力学的に解析した。また、PABP結合サブユニットは立体構造を形成するN末端ドメインと、特定の立体構造を形成しないC末端領域からなり、前者がRNaseサブユニットと、後者がPABPと相互作用することを明らかにし、そしてその親和性を定量的に求めた。さらに、C末端領域の中でPABPと直接相互作用する12残基からなる領域を同定した。
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Conformational Dynamics of Complementarity-determining Region H3 of an Anti-dansyl Fv Fragment in the Presence of its Hapten.
存在半抗原时抗丹磺酰 Fv 片段的互补决定区 H3 的构象动力学。
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
J.Mol.Biol. 351
影响因子:
--
作者:
[Kato, D, Nakagawa M, Y.Yamaguchi et al., H.Sasakawa et al., S.Tashiro et al., M.Kawasaki et al., M.Nakasako et al.]
通讯作者:
M.Nakasako et al.
Bead-linked proteoliposomes : a reconstitution method for NMR analyses of membrane protein-ligand interactions
珠联蛋白脂质体:膜蛋白-配体相互作用的核磁共振分析的重构方法
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
J.Am.Chem.Soc. 127・34
影响因子:
--
作者:
[Aravin, A.(7名), Kuramochi-Miyagawa, S., Nakano, T.(6), Tuschl,T, Addy C., Takeuchi K., Yokogawa M]
通讯作者:
Yokogawa M
DOI:
10.1074/jbc.m608425200
发表时间:
2006-12
期刊:
Journal of Biological Chemistry
影响因子:
4.8
作者:
[M. Takeda;Shinji Ogino;R. Umemoto;M. Sakakura;M. Kajiwara;K. Sugahara;Haruko Hayasaka;M. Miyasaka;H. Terasawa;I. Shimada]
通讯作者:
M. Takeda;Shinji Ogino;R. Umemoto;M. Sakakura;M. Kajiwara;K. Sugahara;Haruko Hayasaka;M. Miyasaka;H. Terasawa;I. Shimada
Pairwise NMR experiments for the determination of protein backbone dihedral angle Phi based on cross-correlated spin relaxation.
基于互相关自旋弛豫确定蛋白质主链二面角 Phi 的成对 NMR 实验。
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
J.Biomol.NMR 37
影响因子:
--
作者:
[Saetre, Rune, Kazuhiro Yoshida, Makoto Miwa, Takuya Matsuzaki, Yoshinobu Kano, Junichi Tsujii., Takahashi H. et al.]
通讯作者:
Takahashi H. et al.
DOI:
10.1074/jbc.m500338200
发表时间:
2005-05-06
期刊:
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子:
4.8
作者:
[Osawa, M, Dace, A, Ames, JB]
通讯作者:
Ames, JB
共 14 条
疾病の原因となる生体高分子間相互作用の新たな拮抗メカニズムの解明と創薬戦略
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批准号:24K02169
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.9万
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财政年份:2024
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负责人:大澤 匡範
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依托单位:
電位依存性イオンチャネルの機能構造と構造間遷移機構の解析による動作機構解明
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批准号:21H02618
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.07万
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财政年份:2021
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负责人:大澤 匡範
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依托单位:
不均一系超分子における分子認識機構を解明するNMR戦略の開発
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批准号:20051005
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.74万
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财政年份:2008
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负责人:大澤 匡範
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依托单位:
不均一系超分子における分子認識機構を解明するNMR戦略の開発
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批准号:18054006
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.22万
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财政年份:2006
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负责人:大澤 匡範
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依托单位:
不均一系超分子における分子認識機構を解明するNMR戦略の開発
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批准号:17053005
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2005
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负责人:大澤 匡範
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依托单位:
翻訳終結因子eRF3のmRNA分解制御機構の構造生物学的解析
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批准号:16790032
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2004
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负责人:大澤 匡範
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依托单位:
国内基金
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分子筛催化甲醇转化中活性位动态变化机制的固体NMR研究
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批准号:22502216
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项目类别:青年科学基金项目(C类)
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资助金额:30.00万元
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批准年份:2025
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负责人:胡敏
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依托单位:
基于NMR研究磷脂酰肌醇磷酸酶SHIP2自抑制作用的分子机制
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批准号:22504159
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项目类别:青年科学基金项目(C类)
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资助金额:30.00万元
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批准年份:2025
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负责人:王梓
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依托单位:
NMR研究尤文肉瘤相关融合基因EWS-FLI1 RNA的可变剪接调控机制
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批准号:22504158
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项目类别:青年科学基金项目(C类)
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资助金额:30.00万元
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批准年份:2025
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负责人:何小玲
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依托单位:
基于细胞原位固体NMR的糖转运蛋白BjSemiSWEET动态转运机制研究
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批准号:22577099
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2025
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负责人:谢华勇
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依托单位:
适用膜蛋白-配体复合物结构测定的1H和19F距离约束检测的固体NMR方法研究
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批准号:JCZRYB202500181
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:
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依托单位:
基于13C NMR的黄土高原半干旱区土壤有机碳稳定性对长期保护性耕作的响应机制
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批准号:32572472
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2025
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负责人:李玲玲
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依托单位:
新颖高灵敏F-19 NMR光化学诱导动态核极化技术开发与活细胞应用探索
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批准号:22574165
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2025
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负责人:柴兆斐
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依托单位:
新型Hoogsteen核酸链置换反应重启G四链体过氧化物酶活性的NMR研究
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批准号:32571393
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项目类别:面上项目
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资助金额:51.00万元
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批准年份:2025
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负责人:张钠
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依托单位:
低旋磁比固体MAS NMR信号检测关键技术与方法的研究
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批准号:22574167
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2025
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负责人:张志
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依托单位:
双金属改性分子筛催化甲烷选择性氧化反应的固体NMR研究
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批准号:22572201
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2025
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负责人:郝全果
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依托单位: