课题基金 / 基金详情

不均一系超分子における分子認識機構を解明するNMR戦略の開発

不均一系超分子における分子認識機構を解明するNMR戦略の開発
开发核磁共振策略来阐明异质超分子中的分子识别机制
批准号:
18054006
负责人:
大澤 匡範
金额:
$4.22万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007

项目摘要

项目成果

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1、ディスコイディンドメイン受容体2 DSドメインの繊維状コラーゲン認識様式の解明NMRによりディスコイディンドメイン受容体2(DDR2)-DSドメインの立体構造を明らかにした。さらに、不溶性超分子である繊維状コラーゲンとの相互作用に当研究室で開発した転移交差飽和(TCS)法を適用し、DSドメイン上のコラーゲン結合部位を同定した。コラーゲン結合部位は、DSドメインのループ領域において、荷電性残基と疎水性残基から構成される溝を形成していることが明らかとなり、これまで構造生物学的解析が困難であった繊維状コラーゲン認識の特異性に関する分子基盤が得られた。2、脂質二重膜中の膜蛋白質複合体における分子間相互作用解析法の確立膜蛋白質は、従来、界面活性剤で可溶化して構造生物学的解析が行われてきたが、界面活性剤による可溶化はしばしば膜蛋白質の失活につながる。そこで、我々の研究室では膜蛋白質をアフィニティービーズに固定化した状態で脂質二重膜中に再構成するBead-linked proteoliposome(BPL)を開発した。しかし、BPLを用いたNMRによる分子間相互作用解析には固体の共存によるスペクトルの低感度化・低分解能化が問題となっていた。そこで、今回、マジック角回転によるスペクトルの高分解能化を試みた。まず、ユビキチン(Ub)と結合する酵母Ub水酸化酵素(YUH)の相互作用系において、YUHをヒスチジンタグを介してZn-NTAシリカビーズに固定化し、不均一系超分子を模倣した系を作成した。マジック角回転条件下で転移交差飽和法の測定を試みたところ、従来法では解析が困難であった固体と液体が共存した超分子系において、Ub上のYUH結合界面残基の同定に成功した。本手法は、膜蛋白質複合体における分子間相互作用解析に適用可能であり、今後の展開が期待できる。
期刊论文(19)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
HR-MASを用いた生体超分子における分子認識機構を解明する新規NMR手法の開発
开发一种新的 NMR 方法,利用 HR-MAS 阐明生物超分子的分子识别机制
DOI: --
发表时间: 2007
期刊:
影响因子: --
作者: [Y.Hattori, Y.Maitani, Sakakura M, 豊永 翔, 小澤新一郎, 豊永翔, 小澤新一郎, Osawa M. et.al., Yokogawa M. et.al., Osawa M., Yokogawa M., 豊永 翔]
通讯作者: 豊永 翔
DOI: 10.1101/gad.1597707
发表时间: 2007-12-01
期刊: GENES & DEVELOPMENT
影响因子: 10.5
作者: [Funakoshi, Yuji, Doi, Yusuke, Hoshino, Shin-ichi]
通讯作者: Hoshino, Shin-ichi
DOI: 10.1107/s0907444906048712
发表时间: 2007-02-01
期刊: ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-STRUCTURAL BIOLOGY
影响因子: 2.2
作者: [Addy, Christine, Ohara, Masato, Heddle, Jonathan G.]
通讯作者: Heddle, Jonathan G.
DOI: --
发表时间: 2007
期刊: Biomol. NMR Assign. 1
影响因子: --
作者: [Tateishi, Y., Ariyoshi, H., Igarashi, R., Hara, H., Mizuguchi, K., Seto, A., Nakai, A., Kolcubo, T., Tochio, H. and Shirakawa, M, 杉田有治, Masayuki Oda, H. Takahashi, Shingo Nakada]
通讯作者: Shingo Nakada
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    疾病の原因となる生体高分子間相互作用の新たな拮抗メカニズムの解明と創薬戦略
    • 批准号:
      24K02169
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.9万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      大澤 匡範
    • 依托单位:
    電位依存性イオンチャネルの機能構造と構造間遷移機構の解析による動作機構解明
    • 批准号:
      21H02618
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.07万
    • 财政年份:
      2021
    • 负责人:
      大澤 匡範
    • 依托单位:
    不均一系超分子における分子認識機構を解明するNMR戦略の開発
    • 批准号:
      20051005
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $4.74万
    • 财政年份:
      2008
    • 负责人:
      大澤 匡範
    • 依托单位:
    不均一系超分子における分子認識機構を解明するNMR戦略の開発
    • 批准号:
      17053005
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $2.18万
    • 财政年份:
      2005
    • 负责人:
      大澤 匡範
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金
    适用膜蛋白-配体复合物结构测定的1H和19F距离约束检测的固体NMR方法研究
    • 批准号:
      JCZRYB202500181
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2025
    • 负责人:
    • 依托单位:
    NMR-CRISPR体系的构建及在肝癌ctDNA及miRNA联合检测中的应 用
    基于 NMR 指纹特征图谱与代谢组学结合模式追踪土家药 血筒果实中抗类风湿关节炎的效应物质
    • 批准号:
      2024JJ6347
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2024
    • 负责人:
      苏维
    • 依托单位:
    基于ResNet-CNN和2D1H.13C HSQC NMR技术的多基原藏药'阿布卡'品质整合评控体系构建
    • 批准号:
      --
    • 项目类别:
      青年科学基金项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2024
    • 负责人:
      杜欢
    • 依托单位: