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不均一系超分子における分子認識機構を解明するNMR戦略の開発

不均一系超分子における分子認識機構を解明するNMR戦略の開発
开发核磁共振策略来阐明异质超分子中的分子识别机制
批准号:
17053005
负责人:
大澤 匡範
金额:
$2.18万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 --

项目摘要

项目成果

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本研究では、コラーゲン繊維など巨大かつ不均一な相互作用系における分子間相互作用を立体構造の観点から解明するNMR戦略の開発を目的とする。実施例として、不溶性超分子であるコラーゲンと、コラーゲン認識蛋白質ディスコイディンドメイン(DDR)受容体DSドメインの相互作用系、およびビーズに固定化したカリウムチャネルGIRKの細胞内ドメインとスペルミンの相互作用系を取り上げた。(1)NMRにより、DSドメインの立体構造を決定した(βシート領域の主鎖原子r.m.s.d.は0.49Å)。また、転移交差飽和法によりDSドメイン上のコラーゲン結合部位を同定した。しかし、コラーゲン存在下のNMRスペクトルは分解能が低下しており、試料の高速回転による高感度化・高分解能化が必要であることが分かった。(投稿準備中)(2)NTA-シリカビーズに固定化したGIRKを懸濁したスペルミン溶液のNMRスペクトルを測定した。MAS回転数2-9kHzにおいて安定した回転が得られ、スペルミンのNMRシグナルが高分解能で観測された。(3)Zn-NTAビーズに固定化したGIRK細胞内ドメインとスペルミンとのNOE生成速度は、固定化していない場合に比べ3倍程度亢進しており、このことはレジンに固定化することにより見かけの高分子量化(超分子化)に成功したことを示している。(4)(3)の検討から、GIRKビーズースペルミンの間の転移NOEシグナルにMAS回転数の変化の影響を受けるものと受けないものがあることを見出した。現在、新たな相互作用解析法への展開を目指し、詳細にその影響の原因を究明している。また、コラーゲンとDSドメインのMAS条件下での転移交差飽和法へ発展させる予定である。
期刊论文(8)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Conformational Dynamics of Complementarity-determining Region H3 of an Anti-dansyl Fv Fragment in the Presence of its Hapten.
存在半抗原时抗丹磺酰 Fv 片段的互补决定区 H3 的构象动力学。
DOI: --
发表时间: 2005
期刊: J.Mol.Biol. 351
影响因子: --
作者: [Kato, D, Nakagawa M, Y.Yamaguchi et al., H.Sasakawa et al., S.Tashiro et al., M.Kawasaki et al., M.Nakasako et al.]
通讯作者: M.Nakasako et al.
Bead-linked proteoliposomes : a reconstitution method for NMR analyses of membrane protein-ligand interactions
珠联蛋白脂质体:膜蛋白-配体相互作用的核磁共振分析的重构方法
DOI: --
发表时间: 2005
期刊: J.Am.Chem.Soc. 127・34
影响因子: --
作者: [Aravin, A.(7名), Kuramochi-Miyagawa, S., Nakano, T.(6), Tuschl,T, Addy C., Takeuchi K., Yokogawa M]
通讯作者: Yokogawa M
DOI: 10.1074/jbc.m500338200
发表时间: 2005-05-06
期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子: 4.8
作者: [Osawa, M, Dace, A, Ames, JB]
通讯作者: Ames, JB
An NMR method for the determination of protein-binding interfaces using dioxygen-induced spin-lattice relaxation enhancement.
一种使用分子氧诱导的自旋晶格弛豫增强来确定蛋白质结合界面的 NMR 方法。
DOI: --
发表时间: 2005
期刊: J.Biol.Chem. 280・43
影响因子: --
作者: [Aravin, A.(7名), Kuramochi-Miyagawa, S., Nakano, T.(6), Tuschl,T, Addy C., Takeuchi K., Yokogawa M, Nakasako M, Ueda T]
通讯作者: Ueda T
7
    疾病の原因となる生体高分子間相互作用の新たな拮抗メカニズムの解明と創薬戦略
    • 批准号:
      24K02169
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.9万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      大澤 匡範
    • 依托单位:
    電位依存性イオンチャネルの機能構造と構造間遷移機構の解析による動作機構解明
    • 批准号:
      21H02618
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.07万
    • 财政年份:
      2021
    • 负责人:
      大澤 匡範
    • 依托单位:
    不均一系超分子における分子認識機構を解明するNMR戦略の開発
    • 批准号:
      20051005
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $4.74万
    • 财政年份:
      2008
    • 负责人:
      大澤 匡範
    • 依托单位:
    不均一系超分子における分子認識機構を解明するNMR戦略の開発
    • 批准号:
      18054006
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $4.22万
    • 财政年份:
      2006
    • 负责人:
      大澤 匡範
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金
    适用膜蛋白-配体复合物结构测定的1H和19F距离约束检测的固体NMR方法研究
    • 批准号:
      JCZRYB202500181
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2025
    • 负责人:
    • 依托单位:
    NMR-CRISPR体系的构建及在肝癌ctDNA及miRNA联合检测中的应 用
    基于 NMR 指纹特征图谱与代谢组学结合模式追踪土家药 血筒果实中抗类风湿关节炎的效应物质
    • 批准号:
      2024JJ6347
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2024
    • 负责人:
      苏维
    • 依托单位:
    基于ResNet-CNN和2D1H.13C HSQC NMR技术的多基原藏药'阿布卡'品质整合评控体系构建
    • 批准号:
      --
    • 项目类别:
      青年科学基金项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2024
    • 负责人:
      杜欢
    • 依托单位: