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DNAタイルの高信頼セルフアセンブリ技術の研究

DNAタイルの高信頼セルフアセンブリ技術の研究
高可靠DNA瓦片自组装技术研究
批准号:
17059001
负责人:
村田 智
金额:
$5.38万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 2006

项目摘要

项目成果

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1)DNAタイルのセルフアセンブリの高信頼化前年度に引き続きDNAタイルセルフアセンブリ体におけるエラー率の定量化に取り組んだ.DNAオリガミを結晶核としてリボン上の構造を生成し,その上にXOR演算タイルを成長させた.これをAFM観察し,エラー率の精密な測定を行った.また,タイル種ごとの濃度,アニールによる温度変化などの条件を考慮したシミュレーションシステムを構築し,リボンアセンブリにおける実測値と予想値を比較して良好な一致を見た.エラー抑制手法としては,SST(single stranded tile)と呼ばれるより単純なDNAモチーフに対してLTMが適用可能であることをしめした.また,マイクロ流体デバイスを用いたDNAタイルのステップワイズアセンブリ実験に成功し,送液順序によりDNAセルフアセンブリ結晶の階層構造が制御可能であることを蛍光観察実験により実証した.2)DNA相互作用分子による機能発現2層化DNAタイル構造上にナノ微粒子を位置特異的に固定化するための基礎研究を行い、ビオチン化DNA上にアビジン修飾ナノ微粒子を周期的に配置したナノ構造体の長鎖化に成功した。また鋳型DNAとRecAタンパク質および一本鎖DNAによる塩基配列特異的複合体形成に適した塩基配列の決定を行なった。
期刊论文(15)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1007/11493785_10
发表时间: 2004-06
期刊: Numerical Mathematics-theory Methods and Applications
影响因子: 1.3
作者: [Kenichi Fujibayashi;S. Murata]
通讯作者: Kenichi Fujibayashi;S. Murata
Hybridization in a Microfluidic Device for DNA Tile Self-Assembly
用于 DNA Tile 自组装的微流体装置中的杂交
DOI: --
发表时间: 2006
期刊: Proc. Foundations of Nanoscience, Self-Assembled Architectures and Devices (FNANO2006)
影响因子: --
作者: [K.Somei, S.Kaneda, T.Fujii, S.Murata]
通讯作者: S.Murata
Nano-particle positioning and bottom up structure formation on DNA strand
纳米颗粒在 DNA 链上的定位和自下而上的结构形成
DOI: --
发表时间: 2005
期刊:
影响因子: --
作者: [Y. Yanagida, H. Mori, Y. Fujimori, T. Hatsuzawa]
通讯作者: T. Hatsuzawa
DNAを用いた微小粒子のナノ位置決め
使用 DNA 对微粒进行纳米定位
DOI: --
发表时间: 2006
期刊: 精密工学会誌 Vol.72,No.11
影响因子: --
作者: [初澤 毅, 小山内寛, 柳田保子]
通讯作者: 柳田保子
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    New development of spatio-temporal molecular programming
    • 批准号:
      20H00618
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • 资助金额:
      $28.29万
    • 财政年份:
      2020
    • 负责人:
      村田 智
    • 依托单位:
    DNA分子設計による分子機械システムの構築
    • 批准号:
      22240033
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • 资助金额:
      $14.31万
    • 财政年份:
      2010
    • 负责人:
      村田 智
    • 依托单位:
    メゾスケールのメカトロニック自己集積素子の開発
    • 批准号:
      19656067
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额:
      $2.05万
    • 财政年份:
      2007
    • 负责人:
      村田 智
    • 依托单位:
    難治性がんに対する革新的ドラッグデリバリーシステムの開発
    • 批准号:
      18591368
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $2.51万
    • 财政年份:
      2006
    • 负责人:
      村田 智
    • 依托单位:
    海外基金