New development of spatio-temporal molecular programming
时空分子编程新进展
基本信息
- 批准号:20H00618
- 负责人:
- 金额:$ 28.29万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
- 财政年份:2020
- 资助国家:日本
- 起止时间:2020-04-01 至 2025-03-31
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
本研究では,(1)時空間分子プログラミングに適した反応系の設計,(2)形成したパターンの物質化,(3)シミュレーションモデルの構築の3つを研究目的としている.(1)の時空間プログラミングに適した反応系の設計については,これまでの研究でゲル中のDNA分子反応に基づくカスケードパターン形成の理論的および実験的方法論を確立した.(2)の形成したパターンの物質化については,媒質をゲルからゾルに拡張し,パターンが形成された場所に特異的な性質(粘性,拡散係数など)の制御をねらっている.前年度に発見したパターン形成後にパターンの位置が動的に変化する現象について繰り返し実験を行い,再現性を確認した.また,反応槽の大きさや形状,反応温度,DNAモチーフの濃度などを様々に変化させた実験も行い,動的パターンの発生と消滅がどのような条件下で起こるかプロセスの解明を進めた.(3)のシミュレーションモデルの構築については,(2)の実験結果を説明するモデルを検討した結果,従来の反応拡散モデルの単なる拡張では記述が難しいという感触を得ている.今後は移流反応拡散モデルを含めて新たな枠組みを検討する必要がある.
The purpose of this study is to: (1) design of reaction system for space molecule evolution;(2) materialization of reaction system;(3) construction of reaction system. (1) The methodology of the theory of the formation of the DNA molecular reaction system in the study of the time and space optimization of the reaction system was established. (2) The material properties of the medium (viscosity, dispersion coefficient, etc.) are controlled by the specific properties of the medium (viscosity, dispersion coefficient, etc.). The previous year's appearance was confirmed after the formation of the position of the object. In addition, the size of the reaction tank, the reaction temperature, the concentration of DNA, the concentration of DNA, the concentration, the (3) the construction of the system,(2) the results of the implementation of the description, the results of the investigation, the investigation, the results of the investigation, the investigation, the results of the investigation, the investigation, the results, the results of the investigation, the investigation, the results of the investigation, the results, the results of the investigation, the results of the investigation, the In the future, it is necessary to discuss the new structure.
项目成果
期刊论文数量(13)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Pattern formation in sol media using branched DNA motifs
使用分支 DNA 基序在溶胶介质中形成图案
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hiroshi Ogata;Keita Abe;Ibuki Kawamata;Satoshi Murata
- 通讯作者:Satoshi Murata
Molecular Robotics An Introduction
分子机器人学简介
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:キリル ブルガレビッチ;Satoshi Murata
- 通讯作者:Satoshi Murata
DNAの重合反応を応用した反応拡散系のプログラムによるハイドロゲル中でのパターン形成
使用应用 DNA 聚合反应的反应扩散系统程序在水凝胶中形成图案
- DOI:
- 发表时间:2020
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Keita Abe;Satoshi Murata and Ibuki Kawamata;安部桂太;安部桂太
- 通讯作者:安部桂太
合成DNAによる反応拡散系のプログラムを用いたハイドロゲル中でのパターン形成
使用合成 DNA 的反应扩散程序在水凝胶中形成图案
- DOI:
- 发表时间:2020
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Keita Abe;Satoshi Murata and Ibuki Kawamata;安部桂太
- 通讯作者:安部桂太
Cascaded pattern formation in hydrogel medium using the polymerisation approach.
- DOI:10.1039/d1sm00296a
- 发表时间:2021-06
- 期刊:
- 影响因子:3.4
- 作者:K. Abe;S. Murata;I. Kawamata
- 通讯作者:K. Abe;S. Murata;I. Kawamata
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
村田 智其他文献
Controlling dynamic shape change of giant liposome by using molecular motors and DNAs
利用分子马达和DNA控制巨型脂质体的动态形状变化
- DOI:
- 发表时间:
2017 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
野村 慎一郎;佐藤 佑介;平塚 祐一;川岸 由;小椋 利彦;川又 生吹;村田 智;Yusuke Sato - 通讯作者:
Yusuke Sato
分子信号を認識して動く細胞サイズリポソームの構築に向けて
构建通过识别分子信号移动的细胞大小的脂质体
- DOI:
- 发表时间:
2017 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
野村 慎一郎;佐藤 佑介;平塚 祐一;川岸 由;小椋 利彦;川又 生吹;村田 智;Yusuke Sato;佐藤佑介 - 通讯作者:
佐藤佑介
大学の枠を越えたオンライン生体分子デザインコンペティションの取り組み
超越大学界限的在线生物分子设计竞赛的举措
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
村田 智;葛谷明紀;藤原 慶;平 順一;川又生吹;・佐藤佑介;瀧ノ上正浩;野村 M.慎一郎;角五彰;堀 豊;安部桂太 - 通讯作者:
安部桂太
Irrigation Control of Paddy Field to Reduce Pollutant Outflow
控制稻田灌溉减少污染物外流
- DOI:
- 发表时间:
2007 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
山下一郎;芝 清隆;河村秀樹;三浦篤志;金丸周司;鈴木治和;臼井健悟;林崎良英;岩場健治;安部 聡;上野隆史;小林未明;塚本里加子;杉本健二;柏木健司;佐野健一;梅津光央;芹澤 武;松野寿生;松浦和則;高谷 光;磯崎勝弘;芳賀祐輔;上杉 隆;中谷昭彦;直田 健;村田 智;齊藤博英;井上 丹;佐々木善浩;田 文杰;菊池純一;浦岡行治;桐村浩哉;冬木 隆;熊谷慎也;吉井重雄;寒川誠二;鈴木直毅;安立京一;李 奉局;川合知二;一木隆範;マニッシュ・ビヤニ;根本直人;松尾保孝;居城邦治;田畑 仁;松井 宏;松村幸;Ogawa AIKO - 通讯作者:
Ogawa AIKO
基板上成長大規模DNA ナノ構造体へのDNA origami の組み込み
将 DNA 折纸纳入在基质上生长的大规模 DNA 纳米结构中
- DOI:
- 发表时间:
2015 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
木越絵理奈;渡邉亮介;浜田省吾;葛谷明紀;村田 智;大矢裕一 - 通讯作者:
大矢裕一
村田 智的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('村田 智', 18)}}的其他基金
DNA分子設計による分子機械システムの構築
DNA分子设计构建分子力学系统
- 批准号:
22240033 - 财政年份:2010
- 资助金额:
$ 28.29万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
メゾスケールのメカトロニック自己集積素子の開発
介观机电一体化自集成装置研制
- 批准号:
19656067 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 28.29万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
難治性がんに対する革新的ドラッグデリバリーシステムの開発
难治性癌症创新药物输送系统的开发
- 批准号:
18591368 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 28.29万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
DNAタイルの高信頼セルフアセンブリ技術の研究
高可靠DNA瓦片自组装技术研究
- 批准号:
17059001 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 28.29万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
可変形態移動機構のコンプライアンス制御に関する研究
变形运动机构柔顺控制研究
- 批准号:
16650036 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 28.29万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
相似海外基金
ナノポア計測とDNAコンピューティング技術による超低濃度microRNAの検出
利用纳米孔测量和DNA计算技术检测超低浓度microRNA
- 批准号:
22KJ1231 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 28.29万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
DNAコンピューティングにおける実験プロセスの評価
DNA 计算实验过程的评估
- 批准号:
11878056 - 财政年份:1999
- 资助金额:
$ 28.29万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
DNAコンピューティングのための自己創出型計算モデルの理論構築
DNA计算自生成计算模型的理论构建
- 批准号:
99J05449 - 财政年份:1999
- 资助金额:
$ 28.29万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows