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真正粘菌のネットワーク幾何と生物としての機能発現

真实粘菌的网络几何与生物学功能表达

基本信息

批准号：
18047022
负责人：
高松敦子
金额：
$ 5.31万
依托单位：
Waseda University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

振動しながら環境中をはい回るアメーバ様の単細胞生物、真正粘菌(Physarun polycephalum)変形体は、環境に応じてその形態を動的に変化させる。変形体の部分間は管状構造で結ばれており、その内部には原形質の流れが観察され細胞内物質や栄養分を運んでいるる。変形体の振動している各部分を振動子(あるいはノード)、ノード間を結ぶ管状構造をリンクと定義して、変形体全体をネットワークとして捉えることができる。興味深いことに、この細胞は環境の状況に応じてその形態(管状構造ネットワークの形態)と振動周期が著しく変化する。この環境依存の形態変化は一種の適応行動と見て取ることができる。本研究では、形態の動的な変化はこの細胞にどのように利益をもたらすのかを探るために、各環境における形態の特徴の解析と振動の時空間パターンを解析した。次に、変形体の管状構造ネットワークの形態に着目し、実験結果からネットワーク・トポロジーの特徴抽出を行った。実験結果解析で明らかにされたネットワーク・トポロジーに基づき結合セルモデルによるネットワーク形態依存の同期現象について解析し、最後に、ネットワーク形成モデルの提案を行い、非常に簡単な局所ルールだけで複雑なネットワークが生成できることが示した。これらの実験・モデル解析による構成論的手法により生物のネットワーク幾何と生物機能の関係について考察を行った。今後は、これらの実験事実に基づき、要素集合系の環境依存形態変化による適応行動のアルゴリズムの抽出を目指す。

Vibrations in the environment are different from those in the form of cellular organisms, true fungi, and environmental changes. Some of the shapes are tubular structures, and the interior is a flow of protoplasm. The vibration of each part of the body is different from that of the other parts. In the case of deep excitation, the shape of the cell changes according to the environmental conditions (tubular structure) and the vibration cycle changes. The change of environmental dependence is a kind of appropriate action. In this study, the characteristics of morphology and vibration in different environments were analyzed. The shape of the tubular structure of the secondary and variable shapes is observed, and the characteristics of the tubular structure of the secondary and variable shapes are extracted The analysis of the results shows that there are many problems in the development of the system, such as the basic problem, and the basic problem. This paper discusses the relationship between biological function and geometric structure of organisms. In the future, the implementation of the system will be based on the transformation of the environmental dependence of the element set, and the extraction of appropriate actions will be directed.