Establishment of research base for lipid chemical biology

脂质化学生物学研究基地成立

• 批准号: 20H00405
• 负责人: 松森 信明
• 金额: $ 29.37万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20H00405/
• 关键词: 脂質; 膜タンパク質; 相互作用; ケミカルバイオロジー; 表面プラズモン共鳴; KcsA; バクテリオロドプシン; 脂質ケミカルバイオロジー

「生物はなぜ多様な脂質を有するのか?」という根源的な問いに対する一つの答えとして、膜タンパク質の構造や機能を制御するために多様な脂質が必要である、との仮説が成り立つ。一方で、脂質-膜タンパク質間相互作用解析の方法論が欠如しているため、この分野の研究は立ち遅れている。そこで本研究では、松森らが脂質膜研究で開発した分析手法を集約化することで脂質-膜タンパク質間相互作用解析のプラットフォームを構築し、脂質機能および脂質多様性の解明を目指す。我々はすでに表面プラズモン共鳴(SPR)センサーチップの金基盤表面を自己組織化単分子膜で修飾することで膜タンパク質を高密度に固定化することに成功し、膜タンパク質に特異的に結合する脂質の分析を可能にした。これを放線菌由来のカリウムチャネルKcsAに本手法を適用し、カルジオリピンが特異的に結合するとともにチャネル開口を促進することを見出した。さらに分担者の老木、岩本教授らと共同で変異実験を行い、カルジオリピンの結合部位を特定するとともに、分子動力学シミュレーションを行い、カルジオリピンによるKcsA活性化機構を明らかにした。令和４年度にはこれに関する論文を一報投稿し、さらにもう一報の投稿を準備している。一方、SPRを用いた相互作用解析方法では特異的脂質を見つけるために精製した脂質を分析する必要がある。この欠点を補うために、金ナノ粒子をSAMで修飾し、これに膜タンパク質を固定化することで、脂質混合物から膜タンパク質特異的脂質を簡便に取得する手法を発案した。本年度はバクテリオロドプシン(bR)を用いて本アイデアの検証に成功し、現在論文投稿準備中である。さらに、金ナノ粒子は強い赤色を呈することから、PVDF膜に付着させた脂質をこの膜タンパク質固定金ナノ粒子で染色することで、特異的脂質をより簡便に検出する手法の開発も開始し、おおむねこれを達成した。

"Biological diversity of lipids" The root cause of the problem is to answer the question, to control the structure and function of the membrane, and to establish a variety of lipids. The methodology for the analysis of lipid-membrane interactions is incomplete. In this study, we developed an analytical method for lipid membrane research, developed a framework for the analysis of lipid-membrane interactions, and directed the elucidation of lipid functions and lipid diversity. The surface resonance (SPR) of the gold substrate surface was modified by self-organizing molecular film, and the membrane was immobilized at high density. The lipid analysis was possible by membrane specific binding. This method is applicable to the production of bacteria, and the production of bacteria is promoted. Professor Ogi and Professor Iwamoto jointly developed a mechanism for activating KcsA by identifying the binding site of the molecule. In 2004, the paper was submitted and prepared for submission. A method of SPR interaction analysis is necessary for the analysis of specific lipids. A simple method for obtaining a lipid mixture from a membrane material is proposed. This year's paper submission preparation process is under way. The gold particles are strongly colored red, and the PVDF membrane is coated with lipids. The membrane is coated with a fixed gold particle. The dye is easy to detect. The method for developing specific lipids begins and ends.

项目成果

Interaction analysis between membrane proteins and lipids towards elucidation of lipid-related chemical communications

膜蛋白和脂质之间的相互作用分析，以阐明脂质相关的化学通讯

• 发表时间: 2021
• 作者: Matsumori Nobuaki

Impact of sphingomyelin acyl chain heterogeneity upon properties of raft-like membranes

• DOI: 10.1016/j.bbamem.2022.184036
• 发表时间: 2022-09-02
• 期刊: BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOMEMBRANES
• 影响因子: 3.4
• 作者: Hirano，Kana;Kinoshita，Masanao;Matsumori，Nobuaki
• 通讯作者: Matsumori，Nobuaki

Molecular substructure of the liquid-ordered phase formed by sphingomyelin and cholesterol: sphingomyelin clusters forming nano-subdomains are a characteristic feature

鞘磷脂和胆固醇形成的液体有序相的分子亚结构：形成纳米亚域的鞘磷脂簇是一个特征

• DOI: 10.1007/s12551-022-00967-1
• 发表时间: 2022
• 期刊: Biophysical Reviews
• 作者: Murata Michio;Matsumori Nobuaki;Kinoshita Masanao;London Erwin
• 通讯作者: London Erwin

University of Strasbourg(フランス)

斯特拉斯堡大学（法国）

Preparation of Nitrogen Analogues of Ceramide and Studies of Their Aggregation in Sphingomyelin Bilayers

神经酰胺氮类似物的制备及其在鞘磷脂双层中的聚集研究

• DOI: 10.1021/acs.langmuir.1c02101
• 发表时间: 2021
• 期刊: Langmuir
• 影响因子: 3.9
• 作者: Yasuda Hiroki;Torikai Kohei;Kinoshita Masanao;Sazzad Md. Abdullah Al;Tsujimura Koya;Slotte J. Peter;Matsumori Nobuaki
• 通讯作者: Matsumori Nobuaki