Establishment of research base for lipid chemical biology

脂质化学生物学研究基地成立

基本信息

  • 批准号:
    20H00405
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 29.37万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 财政年份:
    2020
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2020-04-01 至 2025-03-31
  • 项目状态:
    未结题

项目摘要

「生物はなぜ多様な脂質を有するのか?」という根源的な問いに対する一つの答えとして、膜タンパク質の構造や機能を制御するために多様な脂質が必要である、との仮説が成り立つ。一方で、脂質-膜タンパク質間相互作用解析の方法論が欠如しているため、この分野の研究は立ち遅れている。そこで本研究では、松森らが脂質膜研究で開発した分析手法を集約化することで脂質-膜タンパク質間相互作用解析のプラットフォームを構築し、脂質機能および脂質多様性の解明を目指す。我々はすでに表面プラズモン共鳴(SPR)センサーチップの金基盤表面を自己組織化単分子膜で修飾することで膜タンパク質を高密度に固定化することに成功し、膜タンパク質に特異的に結合する脂質の分析を可能にした。これを放線菌由来のカリウムチャネルKcsAに本手法を適用し、カルジオリピンが特異的に結合するとともにチャネル開口を促進することを見出した。さらに分担者の老木、岩本教授らと共同で変異実験を行い、カルジオリピンの結合部位を特定するとともに、分子動力学シミュレーションを行い、カルジオリピンによるKcsA活性化機構を明らかにした。令和4年度にはこれに関する論文を一報投稿し、さらにもう一報の投稿を準備している。一方、SPRを用いた相互作用解析方法では特異的脂質を見つけるために精製した脂質を分析する必要がある。この欠点を補うために、金ナノ粒子をSAMで修飾し、これに膜タンパク質を固定化することで、脂質混合物から膜タンパク質特異的脂質を簡便に取得する手法を発案した。本年度はバクテリオロドプシン(bR)を用いて本アイデアの検証に成功し、現在論文投稿準備中である。さらに、金ナノ粒子は強い赤色を呈することから、PVDF膜に付着させた脂質をこの膜タンパク質固定金ナノ粒子で染色することで、特異的脂質をより簡便に検出する手法の開発も開始し、おおむねこれを達成した。
"Is there a variety of な lipids を in biology なぜ なぜ?" と い う root な asked い に す seaborne る a つ の answer え と し て, membrane タ ン パ ク qualitative の function of tectonic や を suppression す る た め に many others な lipid が necessary で あ る, と の 仮 said が into り つ. Side で, lipid membrane タ ン パ ク qualitative analytical methodology の が owe such as interaction between し て い る た め, こ の eset の research は made ち 遅 れ て い る. そ こ で this study で は, ascension ら が lipid membrane research で open 発 し た analysis technique を intensive す る こ と で lipid - membrane タ ン パ ク qualitative interaction between analytic の プ ラ ッ ト フ ォ ー ム を build し, lipids functional お よ び lipid multiple others の interpret を refers す. I 々 は す で に surface プ ラ ズ モ ン resonance (SPR) セ ン サ ー チ ッ プ の を yourself organized molecular membrane で 単 Jin Jipan surface modification す る こ と で membrane タ ン パ ク qualitative を high-density に immobilized す る こ と に し success, membrane タ ン パ ク qualitative に specific に combining す る lipid を の analysis may に し た. こ れ を actinomycetes origin の カ リ ウ ム チ ャ ネ ル KcsA に this gimmick を し, カ ル ジ オ リ ピ ン が specific に combining す る と と も に チ ャ ネ ル openings を promote す る こ と を shows し た. さ ら に sharers の old wood, rock this professor ら と で together - vision be 験 を い, カ ル ジ オ リ ピ ン の combining site specific す を る と と も に, molecular dynamics シ ミ ュ レ ー シ ョ ン を い, カ ル ジ オ リ ピ ン に よ る KcsA activeness institutions を Ming ら か に し た. Make and 4 year に は こ れ に masato す を る essay contribute to し, さ ら に も う contribute a newspaper の を prepare し て い る. Party, SPR を い た interaction analysis method で は specific lipid を see つ け る た め に refined し た lipid を analysis す る necessary が あ る. こ の points less fill を う た め に, gold ナ ノ particle を SAM で modified し, こ れ に membrane タ ン パ ク qualitative を immobilized す る こ と で, lipid mixtures か ら membrane タ ン パ ク easy mass specific lipid を に obtain す る gimmick を 発 case し た. This year's は バ ク テ リ オ ロ ド プ シ ン (bR) を い て this ア イ デ ア の 検 に し success, now in the paper submitted to prepare で あ る. さ ら に, gold ナ ノ particles, red を show strong は い す る こ と か ら, PVDF membrane に pay さ せ た lipid を こ の membrane タ ン パ ク fixed gold ナ ノ particle で dyeing す る こ と で, specific lipid を よ り simple に 検 out す る gimmick の open 発 も began し, お お む ね こ れ を reached し た.

项目成果

期刊论文数量(38)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Interaction analysis between membrane proteins and lipids towards elucidation of lipid-related chemical communications
膜蛋白和脂质之间的相互作用分析,以阐明脂质相关的化学通讯
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Matsumori Nobuaki
  • 通讯作者:
    Matsumori Nobuaki
Impact of sphingomyelin acyl chain heterogeneity upon properties of raft-like membranes
  • DOI:
    10.1016/j.bbamem.2022.184036
  • 发表时间:
    2022-09-02
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Hirano,Kana;Kinoshita,Masanao;Matsumori,Nobuaki
  • 通讯作者:
    Matsumori,Nobuaki
Molecular substructure of the liquid-ordered phase formed by sphingomyelin and cholesterol: sphingomyelin clusters forming nano-subdomains are a characteristic feature
鞘磷脂和胆固醇形成的液体有序相的分子亚结构:形成纳米亚域的鞘磷脂簇是一个特征
  • DOI:
    10.1007/s12551-022-00967-1
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Murata Michio;Matsumori Nobuaki;Kinoshita Masanao;London Erwin
  • 通讯作者:
    London Erwin
Preparation of Nitrogen Analogues of Ceramide and Studies of Their Aggregation in Sphingomyelin Bilayers
神经酰胺氮类似物的制备及其在鞘磷脂双层中的聚集研究
  • DOI:
    10.1021/acs.langmuir.1c02101
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Yasuda Hiroki;Torikai Kohei;Kinoshita Masanao;Sazzad Md. Abdullah Al;Tsujimura Koya;Slotte J. Peter;Matsumori Nobuaki
  • 通讯作者:
    Matsumori Nobuaki
University of Strasbourg(フランス)
斯特拉斯堡大学(法国)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
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松森 信明其他文献

分子間距離情報に基づくアンフォテリシンB-エルゴステロール相互作用様式の解析
基于分子间距离信息的两性霉素B-麦角甾醇相互作用模式分析
  • DOI:
  • 发表时间:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    梅川 雄一;中川 泰男;松下 直広;土川 博史;花島 慎弥;大石 徹;松森 信明;村田 道雄
  • 通讯作者:
    村田 道雄
Bioactive fluorinated derivative of amphotericin B.
两性霉素 B 的生物活性氟化衍生物。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Okada;S.;N.Takai;原 正一郎;松森 信明
  • 通讯作者:
    松森 信明
脂質ラフト形成基盤の解明を目指したスフィンゴミエリンの動的およびNMR構造解析
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Kawase;T.;Sato;Y.;Kansaku;K.;中村 悠;岡洋樹;細谷孝充;松森 信明
  • 通讯作者:
    松森 信明

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  • DOI:
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Challenges to create natural product-drug conjugate starting from screening of natural products that bind to membrane proteins
从筛选与膜蛋白结合的天然产物开始创建天然产物-药物缀合物的挑战
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    2022
  • 资助金额:
    $ 29.37万
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    $ 29.37万
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オルガネラ間相互作用から探るペルオキシソーム膜タンパク質の輸送機構
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    2009
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    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
膜タンパク質・核タンパク質相互作用解析技術の開発
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    2008
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膜タンパク質の局在化と構造形成におけるソフトな相互作用
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    19036030
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    2007
  • 资助金额:
    $ 29.37万
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    05F05638
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    2005
  • 资助金额:
    $ 29.37万
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    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
ALPHASCREENによるソフトな膜タンパク質間相互作用の解析法開発
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  • 批准号:
    16048205
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 29.37万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
内在性膜タンパク質と脂質膜相互作用の単一分子力学
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  • 批准号:
    03F03362
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 29.37万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
内在性膜タンパク質と脂質膜相互作用の単一分子力学
完整膜蛋白和脂质膜相互作用的单分子动力学
  • 批准号:
    03F00362
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 29.37万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
膜タンパク質の膜貫通領域におけるタンパク質―タンパク質相互作用の検出
膜蛋白跨膜区域蛋白质-蛋白质相互作用的检测
  • 批准号:
    14014238
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 29.37万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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