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NMRによる蛋白質構造の協調的内部運動と機能制御相関解析

NMRによる蛋白質構造の協調的内部運動と機能制御相関解析
使用 NMR 进行蛋白质结构的协同内部运动和功能控制相关性分析
批准号：
20050022
负责人：
楯 真一
金额：
$2.05万
依托单位：
Hiroshima University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2008
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2008 至 2009
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20050022/
关键词：
生物物理生体分子蛋白質NMR酵素反応スピン緩和安定同位体構造揺らぎ

项目摘要

项目成果

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本年度は,以下の研究成果を得た.1. DHFRループ変異体の内部運動性解析初年度に引き続いてG67A,G67V変異体の内部運動性の解析をすすめた.本年度は,野生体とG67V,G67A変異体により誘導される内部運動性変化の再現性を含めた実験精度の検証を行うと同時に,内部運動速度の分布を精密に解析した.その結果,活性変調が観測されたG67Vでは,内部運動速度は750sec^<-1>を中心に分布しているが,活性変化の小さいG67Aと野生体は500sec^<-1>を中心とした速度分布を持っている.また,揺らぎを持つ構造部も,G67VはG67Aおよび野生体と異なっていることが分かった.構造揺らぎの速度・構造上の分布の違いが活性変調と関係することが示唆された.2. ストップドフローを用いたDHFR変異体の反応速度変化G67V変異体のkcatの低下がどのような反応ステップの変調によるかを解析した.その結果,hydride transfer速度は約20%低下していることが分かった,観測されたkcat変化の全てがhydride transfer過程の低下により説明されるものではないが,構造揺らぎの変化がhydride transfer過程にも影響を与えることを明らかにした.
期刊论文(27)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Protein adaptation to high-pressure environments. in Protein Adaptation in Extremophiles., in : Protein Adaptation in Extremophiles. Molecular Anatomy and Physiology of proteins series (Eds. Thomas, T. and Siddiqui, K. S.)
蛋白质适应高压环境。
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [C. Kato, T. Sato, F. Abe, E. Ohmae, H. Tamegai, K. Nakasone, K. Siddiqui, and T. Thomas]
通讯作者： and T. Thomas
Protein structural dynamics and function relationships revealed by NMR spectroscopy
核磁共振波谱揭示蛋白质结构动力学和功能关系
DOI： --
发表时间： 2009
期刊：
影响因子： --
作者： [Tokutsu, R., Iwai, M. and Minagawa, J., 石川直子, Shin-ichi Tate]
通讯作者： Shin-ichi Tate
酸化LDL受容体蛋白質LOX-1の構造機能特性と本来の役割
氧化型LDL受体蛋白LOX-1的结构功能特征及原始作用
DOI： --
发表时间： 2009
期刊：
影响因子： --
作者： [西脇匡崇, 山根慶典, 白旗崇, 宮本久一, 御崎洋二, 楯真一]
通讯作者： 楯真一
異方性核スピン相互作用を利用する新規NMR技術による超高分子量タンパク質の分子形態観測
使用利用各向异性核自旋相互作用的新 NMR 技术观察超高分子量蛋白质的分子形态
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [T.Matsuo, K.Onai, K.Okamoto, J.Minagawa, M.Ishiura, 井上和秀, 楯真一]
通讯作者： 楯真一
共 26 条
    核内タンパク質の液液相分離によるB型肝炎ウイルス複製制御機構の解明
    • 批准号：
      23K27118
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $8.74万
    • 财政年份：
      2024
    • 负责人：
      楯 真一
    • 依托单位：
      Hiroshima University
    Exploring the role of LLPS of nuclear proteins in the replication of Hepatitis B viru
    • 批准号：
      23H02425
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $11.9万
    • 财政年份：
      2023
    • 负责人：
      楯 真一
    • 依托单位：
      Hiroshima University
    Prediction of homologous recombination deficiency by urinary microRNAs in ovarian cancer
    • 批准号：
      22K09613
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.66万
    • 财政年份：
      2022
    • 负责人：
      楯 真一
    • 依托单位：
      Chiba University
    3D analysis of chromatin structure in cell nucleus with electron microscopy and mathematical modeling
    • 批准号：
      21K18234
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
    • 资助金额：
      $16.64万
    • 财政年份：
      2021
    • 负责人：
      楯 真一
    • 依托单位：
      Hiroshima University
    海外基金