课题基金 / 基金详情

DNA上での蛋白質間相互作用を促進するHMGによるDNA変形の構造解析

DNA上での蛋白質間相互作用を促進するHMGによるDNA変形の構造解析
HMG 促进 DNA 上蛋白质-蛋白质相互作用的 DNA 变形结构分析
批准号：
11160215
负责人：
楯 真一
金额：
$1.22万
依托单位：
Japan Advanced Institute of Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份：
1999
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
1999 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-11160215/
关键词：
HMG蛋白質NMR安定同位体標識DNA構造

项目摘要

项目成果

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翻译
1.HMG2蛋白質C末端DNA結合ドメイン(B-ドメイン)の精密立体構造解析:NOEと2面角情報に基づく立体構造解析に加えて、磁場配向により誘導された残余双極子効果とバイセルにより誘導された残余双極子効果を取り入れることにより、精密な立体構造を得た。構造解析の結果、HMG2Bドメインを構成する第2、第3ヘリックスの形成する角度がHMG1の対応するドメインと有意に異なり、この違いが両蛋白質のDNAに対する親和性の違いおよび機能上の役割の違いを説明しえるものと示唆された。2.エンハンスソーム形成因子HMG-Iの高次構造解析を目的としたサンプル調製: HMG-Iのもつ3つのDNA結合ドメインのうちN末端の2つのDNA結合ドメインとC末端側2つの結合ドメインは、それぞれ異なるエンハンサーDNA領域に結合する。本年度は、それぞれ2つのDNA結合ドメインを持つHMG-Iフラグメントの大腸菌による大量発現系の構築と、その精製法の確立を行った。いずれのDNA結合フラグメントも1literの最小培地から約10mg程度のサンプルを高純度に得ることができる。3.HMG-I結合配列を含むDNAフラグメントの作成: HMG-IのそれぞれのDNA結合フラグメントは、異なる23bp程度のDNA領域に結合する。これまでに、23bpのエンハンサーDNA領域に相当するPRDII-NRDIの合成を行い、^<15>N標識したHMG-IのC末端側DNA結合フラグメントとの相互作用をNMRにより確認した。
英文摘要
1.HMG2蛋白質C末端DNA結合ドメイン(B-ドメイン)の精密立体構造解析:NOEと2面角情報に基づく立体構造解析に加えて、磁場配向により誘導された残余双極子効果とバイセルにより誘導された残余双極子効果を取り入れることにより、精密な立体構造を得た。構造解析の結果、HMG2Bドメインを構成する第2、第3ヘリックスの形成する角度がHMG1の対応するドメインと有意に異なり、この違いが両蛋白質のDNAに対する親和性の違いおよび機能上の役割の違いを説明しえるものと示唆された。2.エンハンスソーム形成因子HMG-Iの高次構造解析を目的としたサンプル調製: HMG-Iのもつ3つのDNA結合ドメインのうちN末端の2つのDNA結合ドメインとC末端側2つの結合ドメインは、それぞれ異なるエンハンサーDNA領域に結合する。本年度は、それぞれ2つのDNA結合ドメインを持つHMG-Iフラグメントの大腸菌による大量発現系の構築と、その精製法の確立を行った。いずれのDNA結合フラグメントも1literの最小培地から約10mg程度のサンプルを高純度に得ることができる。3.HMG-I結合配列を含むDNAフラグメントの作成: HMG-IのそれぞれのDNA結合フラグメントは、異なる23bp程度のDNA領域に結合する。これまでに、23bpのエンハンサーDNA領域に相当するPRDII-NRDIの合成を行い、^<15>N標識したHMG-IのC末端側DNA結合フラグメントとの相互作用をNMRにより確認した。
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
K. Ogura: "Solution structure of human acidic fibroblast growth factor and interaction with heparin-derived hexasaccharide"J. Bimol. NMR. 13. 11-24 (1999)
K. Ogura：“人酸性成纤维细胞生长因子的溶液结构及其与肝素衍生六糖的相互作用”J。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
S. Mine: "Analysis of the relationship between enzyme and its internal motion using nuclear magnetic resonance"J. Mol. Biol.. 286. 1547-1565 (1999)
S. Mine：“利用核磁共振分析酶及其内部运动之间的关系”J。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
K. Hiraga: "Mutational analysis of the reactive site loop of Streptomyces metalloproteinases inhibitor, SMPI"J. Biochem. (Tokyo). 125. 202-209 (1999)
K. Hiraga：“链霉菌金属蛋白酶抑制剂 SMPI 反应位点环的突变分析”J。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
核内タンパク質の液液相分離によるB型肝炎ウイルス複製制御機構の解明
  • 批准号：
    23K27118
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $8.74万
  • 财政年份：
    2024
  • 负责人：
    楯 真一
  • 依托单位：
    Hiroshima University
Exploring the role of LLPS of nuclear proteins in the replication of Hepatitis B viru
  • 批准号：
    23H02425
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $11.9万
  • 财政年份：
    2023
  • 负责人：
    楯 真一
  • 依托单位：
    Hiroshima University
Prediction of homologous recombination deficiency by urinary microRNAs in ovarian cancer
  • 批准号：
    22K09613
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额：
    $2.66万
  • 财政年份：
    2022
  • 负责人：
    楯 真一
  • 依托单位：
    Chiba University
3D analysis of chromatin structure in cell nucleus with electron microscopy and mathematical modeling
  • 批准号：
    21K18234
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
  • 资助金额：
    $16.64万
  • 财政年份：
    2021
  • 负责人：
    楯 真一
  • 依托单位：
    Hiroshima University
国内基金
海外基金
分子筛催化甲醇转化中活性位动态变化机制的固体NMR研究
基于NMR研究磷脂酰肌醇磷酸酶SHIP2自抑制作用的分子机制
NMR研究尤文肉瘤相关融合基因EWS-FLI1 RNA的可变剪接调控机制
基于细胞原位固体NMR的糖转运蛋白BjSemiSWEET动态转运机制研究
  • 批准号：
    22577099
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    50.00万元
  • 批准年份：
    2025
  • 负责人：
    谢华勇
  • 依托单位：
    武汉科技大学