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量子ゆらぎと熱ゆらぎを考慮した高次系生体分子クラスターの分子論的解明

量子ゆらぎと熱ゆらぎを考慮した高次系生体分子クラスターの分子論的解明
考虑量子涨落和热涨落的高阶生物分子簇的分子阐明
批准号:
20050027
负责人:
立川 仁典
金额:
$2.24万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2008
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2008 至 2009

项目摘要

项目成果

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これまで我々は、より現実系に近い理論計算を実現するために、温度効果だけでなく水素原子核の量子揺らぎを考慮した多成分系分子理論を開発し、常温においても核の量子効果が重要であることを見出してきた。本課題においては、我々が展開してきた手法を駆使することにより、量子ゆらぎと熱ゆらぎを考慮した高次系生体分子水和クラスターを微視的に解明することを目的とする。平成21年度は、経路積分分子動力学(PIMD)法を用いて、ab initio経路積分法を用いた低障壁水素結合クラスター(N_2H_7^+, H_3O_2^-)の計算、およびsemi-empirical経路積分法(半経験的分子軌道法による経路積分法)を用いたグリシン水クラスター(Gly・(H_2O)_n(n=2-7))の計算を実現した。いずれも水素原子核の量子効果が顕著に効き、大きなH/D同位体効果が生じることを見出した。グリシン分子は水溶液中では双生イオン構造が安定であることが知られているが、気相中では中性構造が安定である。グリシン分子の水和過程におけるプロトン移動機構の解明を目指し、経路積分法を用いてグリシン水クラスターGly・(H_2O)_nを解析した。カルボキシル基と二つの水分子からなる環状の水素結合ネットワークが構成され、水素原子が大きく揺らいでいる様子が解った。また水分子が増えると、n=4-6で多段階でのプロトン交換が、n=7で双生イオン構造を示す分布が得られた。
期刊论文(36)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1016/j.theochem.2009.02.011
发表时间: 2009-10-30
期刊: JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE-THEOCHEM
影响因子: --
作者: [Udagawa, Taro, Tachikawa, Masanori]
通讯作者: Tachikawa, Masanori
Ab initio経路積分分子動力学法を用いた電子スペクトルの解析
使用从头算路径积分分子动力学方法分析电子光谱
DOI: --
发表时间: 2008
期刊:
影响因子: --
作者: [杉本 昌崇, 志賀 基之, 立川 仁典]
通讯作者: 立川 仁典
DOI: 10.1016/j.theochem.2009.02.005
发表时间: 2009-10
期刊: Journal of Molecular Structure-theochem
影响因子: --
作者: [Kenshi Takahashi;M. Tachikawa]
通讯作者: Kenshi Takahashi;M. Tachikawa
Efficient ab initio path integral hybrid Monte Carlo based on the fourth-order Trotter expansion : Application to fluoride ion-water cluster
基于四阶Trotter展开式的高效从头算路径积分混合蒙特卡罗:在氟离子-水团簇中的应用
DOI: --
发表时间: 2010
期刊: J.Chem.Phys. 132
影响因子: --
作者: [K. Suzuki, M. Tachikawa, M. Shiga]
通讯作者: M. Shiga
33
    Combining quantum multicomponent molecular theory and data science to understand the mechanism of physical properties in low-barrier hydrogen-bonded systems
    • 批准号:
      23K17905
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    • 资助金额:
      $4.08万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      立川 仁典
    • 依托单位:
    ハイブリッドQM/MM経路積分法による核の量子効果を考慮した溶媒和機構の解明
    • 批准号:
      20038041
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $1.98万
    • 财政年份:
      2008
    • 负责人:
      立川 仁典
    • 依托单位:
    QM/MM経路積分法の確立および溶液内プロトン水和機構の微視的解明
    • 批准号:
      19029038
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $1.22万
    • 财政年份:
      2007
    • 负责人:
      立川 仁典
    • 依托单位:
    プロトン・電子の量子効果を考慮した新しい第一原理分子理論の開発および応用
    • 批准号:
      15750020
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额:
      $2.3万
    • 财政年份:
      2003
    • 负责人:
      立川 仁典
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金
    含钾盐细水雾抑制氢气爆炸的化学-物理耦合机理及加氢站喷淋系统参数优化研究
    • 批准号:
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2025
    • 负责人:
      游成旭
    • 依托单位:
    盐冻-化学物理多场耦合效应下水工混凝土损伤演化机理及算法研究
    • 批准号:
      --
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      54万元
    • 批准年份:
      2022
    • 负责人:
      覃源
    • 依托单位:
    反应性纺丝构筑高强水凝胶纤维及其“化学-物理”协同调控机制研究
    • 批准号:
      --
    • 项目类别:
      --
    • 资助金额:
      58万元
    • 批准年份:
      2021
    • 负责人:
      侯恺
    • 依托单位:
    反应性纺丝构筑高强水凝胶纤维及其“化学—物理”协同调控机制研究
    • 批准号:
      52173029
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      58.00万元
    • 批准年份:
      2021
    • 负责人:
      侯恺
    • 依托单位: