巨大モーター蛋白質ダイニンのX線構造解析
巨运动蛋白动力蛋白的 X 射线结构分析
基本信息
- 批准号:20051006
- 负责人:
- 金额:$ 4.48万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2008
- 资助国家:日本
- 起止时间:2008 至 2009
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
細胞質ダイニンの微小管と結合する領域は、長いcoiled-coil領域によってATPの加水分解を行う球状ドメインと繋がれている。この微小管と結合するドメイン(coiled-coil領域を含む)はストークドメインと呼ばれている。100Aを超える長さを持つcoiled-coil構造が微小管結合とATPの加水分解という2つの連動したイベント情報を相互に伝えていることは間違いないが、その情報伝達の構造基盤については明らかになっていない。そこで、DynMDの結晶化と並行してダイニンストークドメインのX線結晶解析を行っている。再現性良く棒状の結晶を得ることに成功し、ゆっくり3日間かけて結晶化ドロップの状態で抗凍結剤を導入したSe-Met置換体結晶を使って3.2A分解能の良質のMADデータを収集した。MAD法により初期位相を決定することに成功し、coiled-coil領域の電子密度図を得ることに成功している。ダイニンのcoiled-coilは、一本のαヘリックスが真っ直ぐな構造をしており、対照的にもう一本のヘリックスが非常に湾曲した構造をとっていた。我々の結晶では、ストークヘッドの構造がハッキリしなかったが、Se-Metの位置からcoiled-coilの相対配置を特定できている。研究期間中にUCSFのR. Vale等のグループが世界に先駆けてマウス細胞質ダイニンのストークヘッドの結晶構造を発表した(Science 2008)。Vale等の構造と我々の構造とでは,coiled-coilの組合せが11残基ずれた関係にあった。このことは,coiled-coil構造を使った情報伝達の分子機構と相関があると考えられる。今後も,様々なコンストラクトを使って、この情報伝達機構に迫っていきたい。
Cytoplasmic microtubule binding domain, long coiled-coil domain, ATP hydrolysis domain, spherical domain The micro-tube is combined with the coil field. 100A, a long time, a coiled coil structure, a micro-tube combination, ATP hydration, and a connection between the information and each other. X-ray crystallographic analysis of DynMD and DynMD. Reproducibility Good rod-like crystals were obtained successfully and successfully. During the day, crystallization was carried out in a state where anti-freezing agents were introduced. Se-Met substitutants were crystallized and 3.2A decomposition was carried out in a state of good quality. The initial phase of MAD determines the electron density in the coiled coil domain. The coiled-coil structure of the original is very simple. The structure of the crystal is different from that of the coil, and the position of the coil is different from that of the phase. During the study period, UCSF's R. Vale et al.(2008) Vale et al. structure,coiled-coil combination, 11 residues. The coiled-coil structure enables information to be transmitted to molecular mechanisms. In the future, the information transmission mechanism will be forced to change.
项目成果
期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
タンパク質の辞典(猪飼篤・伏見譲・卜部格・上野川修一・中村春木・浜窪隆雄編)
蛋白质词典(由 Atsushi Ikai、Yuzuru Fushimi、Ikaku Urabe、Shuichi Uenokawa、Haruki Nakamura 和 Takao Hamakubo 编辑)
- DOI:
- 发表时间:2008
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Norifumi Muraki;Tomoo Shiba;Daisuke Seo;Takeshi Sakurai and Genji Kurisu;栗栖源嗣(分担)
- 通讯作者:栗栖源嗣(分担)
Crystallographic studies of ferredoxin-NAD(P)+ reductase from Chlorobium tepidum
来自温绿藻的铁氧还蛋白-NAD(P) 还原酶的晶体学研究
- DOI:
- 发表时间:2008
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Norifumi Muraki;Tomoo Shiba;Daisuke Seo;Takeshi Sakurai and Genji Kurisu
- 通讯作者:Takeshi Sakurai and Genji Kurisu
Structural basis for chiral substrate recognition by two 2,3-butanediol dehydrogenases
- DOI:10.1016/j.febslet.2009.11.068
- 发表时间:2010-01-04
- 期刊:
- 影响因子:3.5
- 作者:Otagiri, Masato;Ui, Sadaharu;Kusunoki, Masami
- 通讯作者:Kusunoki, Masami
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- DOI:
- 发表时间:2008
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Muraki;N.;Seo;D.;Shiba;T.;Sakurai;T.;Kurisu;G.
- 通讯作者:G.
Functional importance of Crenarchaea-specific extra-loop revealed by an X-ray structure of a heterotetrameric crenarchaeal splicing endonuclease
异四聚体缝隙菌剪接核酸内切酶的 X 射线结构揭示了缝隙菌特异性外环的功能重要性
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:S.Yoshinari;T.Shiba;D.K.Inaoka;T.Itoh;G.Kurisu;S.Harada;K.Kita;Y.Watanabe
- 通讯作者:Y.Watanabe
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