巨大モーター蛋白質ダイニンのX線構造解析
巨大モーター蛋白質ダイニンのX線構造解析
批准号:
20051006
负责人:
栗栖 源嗣
金额:
$4.48万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2008
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2008 至 2009
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英文摘要
細胞質ダイニンの微小管と結合する領域は、長いcoiled-coil領域によってATPの加水分解を行う球状ドメインと繋がれている。この微小管と結合するドメイン(coiled-coil領域を含む)はストークドメインと呼ばれている。100Aを超える長さを持つcoiled-coil構造が微小管結合とATPの加水分解という2つの連動したイベント情報を相互に伝えていることは間違いないが、その情報伝達の構造基盤については明らかになっていない。そこで、DynMDの結晶化と並行してダイニンストークドメインのX線結晶解析を行っている。再現性良く棒状の結晶を得ることに成功し、ゆっくり3日間かけて結晶化ドロップの状態で抗凍結剤を導入したSe-Met置換体結晶を使って3.2A分解能の良質のMADデータを収集した。MAD法により初期位相を決定することに成功し、coiled-coil領域の電子密度図を得ることに成功している。ダイニンのcoiled-coilは、一本のαヘリックスが真っ直ぐな構造をしており、対照的にもう一本のヘリックスが非常に湾曲した構造をとっていた。我々の結晶では、ストークヘッドの構造がハッキリしなかったが、Se-Metの位置からcoiled-coilの相対配置を特定できている。研究期間中にUCSFのR. Vale等のグループが世界に先駆けてマウス細胞質ダイニンのストークヘッドの結晶構造を発表した(Science 2008)。Vale等の構造と我々の構造とでは,coiled-coilの組合せが11残基ずれた関係にあった。このことは,coiled-coil構造を使った情報伝達の分子機構と相関があると考えられる。今後も,様々なコンストラクトを使って、この情報伝達機構に迫っていきたい。
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タンパク質の辞典(猪飼篤・伏見譲・卜部格・上野川修一・中村春木・浜窪隆雄編)
蛋白质词典(由 Atsushi Ikai、Yuzuru Fushimi、Ikaku Urabe、Shuichi Uenokawa、Haruki Nakamura 和 Takao Hamakubo 编辑)
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Norifumi Muraki, Tomoo Shiba, Daisuke Seo, Takeshi Sakurai and Genji Kurisu, 栗栖源嗣(分担)]
通讯作者:
栗栖源嗣(分担)
Crystallographic studies of ferredoxin-NAD(P)+ reductase from Chlorobium tepidum
来自温绿藻的铁氧还蛋白-NAD(P) 还原酶的晶体学研究
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Norifumi Muraki, Tomoo Shiba, Daisuke Seo, Takeshi Sakurai and Genji Kurisu]
通讯作者:
Takeshi Sakurai and Genji Kurisu
DOI:
10.1016/j.febslet.2009.11.068
发表时间:
2010-01-04
期刊:
FEBS LETTERS
影响因子:
3.5
作者:
[Otagiri, Masato, Ui, Sadaharu, Kusunoki, Masami]
通讯作者:
Kusunoki, Masami
Crystallization and preliminary X-ray studies of ferredoxin-NAD(P)+ reductase from Chlorobium tepidum
来自温绿藻的铁氧还蛋白-NAD(P) 还原酶的结晶和初步 X 射线研究
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
Acta Crystallographica. Sec. F 64
影响因子:
--
作者:
[Muraki, N., Seo, D., Shiba, T., Sakurai, T., Kurisu, G.]
通讯作者:
G.
Functional importance of Crenarchaea-specific extra-loop revealed by an X-ray structure of a heterotetrameric crenarchaeal splicing endonuclease
异四聚体缝隙菌剪接核酸内切酶的 X 射线结构揭示了缝隙菌特异性外环的功能重要性
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
Nucleic Acids Research 37
影响因子:
--
作者:
[S.Yoshinari, T.Shiba, D.K.Inaoka, T.Itoh, G.Kurisu, S.Harada, K.Kita, Y.Watanabe]
通讯作者:
Y.Watanabe
共 8 条
Structural analysis of the complex between Fd and Fd-dependent proteins considering their redox states strictly
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批准号:21H02417
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.23万
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财政年份:2021
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
複合体X線解析で解明する葉緑体内還元力分配システムの構造基盤
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批准号:21687008
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
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资助金额:$14.56万
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财政年份:2009
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
膜面新規ヘム鉄の役割解明を目指す高等植物チトクロムb6f複合体のX線構造解析
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批准号:19036003
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.35万
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财政年份:2007
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
巨大モーター蛋白質ダイニンのX線による原子レベル構造研究
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批准号:18054008
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.67万
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财政年份:2006
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
巨大モーター蛋白質ダイニンのX線結晶構造に基づいた機能解析
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批准号:17053006
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2005
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
複合体結晶構造解析で明らかにする高等植物に特有な光還元力分配システムの構造基盤
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批准号:17687008
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
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资助金额:$19.3万
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财政年份:2005
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
光合成循環電子伝達を制御するチトクロム複合体とフェレドキシンとの相互作用解析
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批准号:17048005
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2005
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
立体構造から探るフェレドキシン依存性循環電子伝達でのチトクロムb_6f複合体の役割
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批准号:16048217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2004
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
X線結晶解析法によるフェレドキシンと亜硫酸還元酵素による電子伝達複合体の構造研究
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批准号:15770067
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2003
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
X線結晶解析法によるフェレドキシンと亜硫酸還元酵素による電子伝達複合体の構造研究
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批准号:14780474
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:2002
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
機能を制御する水素結合を直接見る金属蛋白質の超高分解能X線結晶解析
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批准号:12740365
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2000
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
時間分割X線解析法によるUDP-Glcピロホスホリラーゼの反応機構の可視化
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批准号:10780384
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1998
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
海外基金