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バイオインフォマティクスによるがん化学療法の新規創薬ターゲット遺伝子の探索

利用生物信息学寻找癌症化疗的新药发现靶基因

基本信息

批准号：
15025272
负责人：
旦慎吾
金额：
$ 3.78万
依托单位：
Japanese Foundation For Cancer Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

がん細胞の抗がん剤感受性を規定する遺伝子群を同定する目的で、39種類のヒトがん細胞株について約65種類の抗がん剤に対する感受性と約1万種類の遺伝子発現を測定し、バイオインフォマティクス的手法により各々の抗がん剤感受性と統計学的に有意な相関が認められた遺伝子群を抽出した。ここで認められた抗がん剤-遺伝子の間の関連性を一般化するためには、39細胞株とは違ったセットを用いて検証をおこなう必要がある。本研究では、関連性の検証のために米国国立がん研究所(NCI)が公開している60種類のヒトがん細胞についての薬剤感受性・遺伝子発現データベースを利用した。その結果、39細胞株での解析で有意な相関が認められた遺伝子-抗がん剤の組み合わせ3,267組のうち、617組(19%、268遺伝子)についてNCIのデータを用いても同様な相関が認められた(P<0.05)。このことから、これらの遺伝子は、相関が認められた抗がん剤の感受性への機能的な関与が期待された。そこで、RNA干渉法を利用してこれらの遺伝子発現が高い細胞株で発現をノックダウンさせ抗がん剤感受性が変化するかを検討し、これまでに発現ノックダウンによりDNAトポイソメラーゼ(トポ)阻害剤の感受性が大きく低下した遺伝子を同定した。このことから、この遺伝子はトポ阻害剤による抗がん作用に機能的な関与があることが示唆された。現在、他の遺伝子についても順次検討を進めている。抗がん剤感受性に大きな影響を与える遺伝子はがん化学療法・抗がん剤耐性克服の新たな創薬ターゲットとしての可能性が期待される。

It is stipulated that the target subgroup of the mouse is the same as that of the target group, and that the cell strain of the 39 species of the cell is less than 65% of the total population, and the sensitivity of the 39 species of the cell line is about 65% of the total population. The techniques used in this study include the extraction of subgroups from the statistical analysis of susceptibility in each group. The relationship between anti-virus and child-to-child connectivity is generalized. the cell lines of 39-year-old and 39-year-old cell lines are not sensitive to each other. The purpose of this study is to improve the sensitivity of the National Institute of Health (NCI) in the United States. In this study, the National Institute of Health of the United States (NCI) is open to the public. The results and 39 cell lines were analyzed. The results showed that the mice in the group of anti-hepatitis B and anti-hepatitis B were tested in the same way as those in 3267 groups (19%, 268%). The results showed that the results of the analysis of 39 cell lines and 39 cell lines showed that the mice in 3267 groups (19%, 268 mice) had the same results as those in the same group. Don't tell me, don't talk about it, don't worry about it. The method of RNA was used to detect the sensitivity of the cell line, the sensitivity of the cell line, the sensitivity, the sensitivity, Please tell me that you are not in a position to prevent and abet the effect of anti-cancer. At present, he is in the middle of a long-term trial. Anti-susceptibility, tolerance, tolerance, tolerance and tolerance.