バイオインフォマティクスによるがん化学療法の新規創薬ターゲット遺伝子の探索

利用生物信息学寻找癌症化疗的新药发现靶基因

• 批准号: 16023269
• 负责人: 旦 慎吾
• 金额: $ 3.46万
• 依托单位: Japanese Foundation For Cancer Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16023269/
• 关键词: ヒトがん細胞株; バイオインフォマティクス; 抗がん剤; 統合データベース; RNA干渉法

がん化学療法の新規ターゲットとなりうる遺伝子を同定するために、我々はこれまでに、多数のヒトがん細胞株をモデルに、バイオインフォマティクスを用いてがん細胞の抗がん剤感受性を決定する遺伝子群の抽出を試みてきた。本研究では、我々が独自に開発したヒトがん39細胞株パネル(JFCR39)におけるに遺伝子発現・薬剤感受性統合データベース(DB)に加え、アメリカ国立がん研究所(NCI)が開発した60細胞株パネル(NCI60)の遺伝子発現・薬剤感受性統合DBを利用して、抗がん剤感受性に関連を示す遺伝子群を抽出した。また、これらの遺伝子群のうち機能的に抗がん剤感受性への関与を示す遺伝子を同定することを目的に、RNA干渉法を利用したスクリーニング系を確立した。その結果、これまでに検討した15種類以上の遺伝子の中から、発現ノックダウンによりDNAトポイソメラーゼI阻害剤への感受性が低下する遺伝子(PLK1)、上昇する遺伝子(SFN)を同定した。このことから、これらの遺伝子はDNAトポイソメラーゼI阻害剤感受性へ機能的な関与があることが示唆された。以上のように、ヒトがん細胞株パネルを用いたモデル解析とRNA干渉法を利用したスクリーニング系を組み合わせることにより、抗がん剤感受性関連遺伝子を効率的に同定することができた。これらの遺伝子は、抗がん剤感受性診断マーカーやがん化学療法の新たなターゲットとして期待される。また、これらの遺伝子の機能解析を行うことにより、抗がん剤の作用メカニズムについて未知の部分が解明されることが期待される。

が ん chemotherapy の new rules タ ー ゲ ッ ト と な り う る posthumous son 伝 を with fixed す る た め に, I 々 は こ れ ま で に, most の ヒ ト が ん cell lines を モ デ ル に, バ イ オ イ ン フ ォ マ テ ィ ク ス を with い て が ん cells の resistance が ん tonic susceptibility を decided す る heritage 伝 subgroup の spare を try み て き た. This study で は, I 々 が に alone open 発 し た ヒ ト が ん 39 cell lines パ ネ ル (JFCR39) に お け る に posthumous son 伝 発 now, 薬 tonic sensibility coherence デ ー タ ベ ー ス (DB) に え, ア メ リ カ national が ん institute (NCI) が open 発 し た 60 cell lines パ ネ ル (NCI60) の heritage 伝 発 son now, 薬 tonic susceptibility integration DB を using し て, resisting が ん tonic susceptibility に masato even を shown す heritage 伝 subgroup を spare し た. ま た, こ れ ら の heritage 伝 subgroup の う ち functionary に resistance が ん tonic susceptibility へ の masato set with を shown す but 伝 son を す る こ と を purpose に, RNA を dry involved method using し た ス ク リ ー ニ ン を グ department establish し た. そ の results, こ れ ま で に beg し 検 た more than 15 kinds の heritage 伝 child の か ら, 発 ノ ッ ク ダ ウ ン に よ り DNA ト ポ イ ソ メ ラ ー ゼ I resistance against tonic へ の sensitivity low が す る heritage 伝 (PLK1), rising す る heritage 伝 child (SFN) with fixed し を た. こ の こ と か ら, こ れ ら の posthumous son 伝 は DNA ト ポ イ ソ メ ラ ー ゼ I resistance against tonic susceptibility へ functionary な masato and が あ る こ と が in stopping さ れ た. Above の よ う に, ヒ ト が ん cell lines パ ネ ル を with い た モ デ ル parsing と RNA dry involved を using し た ス ク リ ー ニ ン グ department を group み close わ せ る こ と に よ り, resisting が ん tonic susceptibility masato even heritage 伝 son を に sharper rates with fixed す る こ と が で き た. こ れ ら の heritage 伝 は, anti が ん tonic sensitivity in the diagnosis of マ ー カ ー や が ん chemotherapy の new た な タ ー ゲ ッ ト と し て expect さ れ る. ま た, こ れ ら の posthumous son 伝 の line function analytical を う こ と に よ り, resisting が ん tonic の role メ カ ニ ズ ム に つ い て の partly が interpret さ れ る こ と が expect さ れ る.

项目成果

Chemosensitivity profile of cancer cell lines and identification of genes determining chemosensitivity by an integrated bioinformatical approach using cDNA arrays

• DOI: 10.1158/1535-7163.mct-04-0234
• 发表时间: 2005-03
• 期刊: Molecular Cancer Therapeutics
• 影响因子: 5.7
• 作者: N. Nakatsu;Y. Yoshida;K. Yamazaki;Tomoki Nakamura;S. Dan;Y. Fukui;T. Yamori